RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 KBTBD4Q9NVX7 518 aa9.67□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 USP3Q9Y6I4 520 aa9.67□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 UBR2Q8IWV8 1755 aa9.67□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 TJP1Q07157 1748 aa9.67□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 H0YIN7 160 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 PDE6BP35913 854 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 SOX9P48436 509 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 NASPP49321 788 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 KIF6Q6ZMV9 814 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 TTLL7Q6ZT98 887 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 COPS6Q7L5N1 327 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 SNX29Q8TEQ0 813 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 PHACTR1Q9C0D0 580 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 BCS1LQ9Y276 419 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 IL16Q14005 1332 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 CCER2I3L3R5 266 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 NPHP1O15259 732 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 RLBP1P12271 317 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 KRT24Q2M2I5 525 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 PLEKHG6Q3KR16 790 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 TAF7LQ5H9L4 462 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 PRR5LQ6MZQ0 368 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 C2CD5Q86YS7 1000 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 RELL1Q8IUW5 271 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 DEPDC7Q96QD5 511 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 HYPKQ9NX55 129 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 CHPF2Q9P2E5 772 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 FAN1Q9Y2M0 1017 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 MICAL2O94851 1124 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 RHOQP17081 205 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 CHRNA5P30532 468 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 ETFBP38117 255 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 CHMP4BP1P59074 171 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 ST5P78524 1137 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 PI16Q6UXB8 463 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 SV2AQ7L0J3 742 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF34Q8IZ26 560 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 C8orf58Q8NAV2 365 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 SNTG2Q9NY99 539 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 CDC45O75419 566 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 ANXA1P04083 346 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 SLURP2P0DP57 97 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 GSTT1P30711 240 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 CLN3Q13286 438 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 RASA3Q14644 834 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 PROSER3Q2NL68 480 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 CCDC30Q5VVM6 783 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 TTLL6Q8N841 843 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 CNBD1Q8NA66 436 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 XAGE3Q8WTP9 111 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 APPBP2Q92624 585 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 NT5C1AQ9BXI3 368 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 BCO2Q9BYV7 579 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 NYXQ9GZU5 481 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 CCDC113Q9H0I3 377 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 RAB6BQ9NRW1 208 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 PPP4R2Q9NY27 417 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 EFR3BQ9Y2G0 817 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 CARMIL3Q8ND23 1372 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM177BA6PVY3 158 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 TCIRG1Q13488 830 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 GAS6Q14393 721 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 PARP10Q53GL7 1025 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 NXPE4Q6UWF7 544 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 TRPM4Q8TD43 1214 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 KCNQ5Q9NR82 932 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 PRKAG3Q9UGI9 489 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 A6NHS1 94 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 TGFBR3LH3BV60 316 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 ARHGEF15O94989 841 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 GPTP24298 496 aa9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms