RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589425.5

PGS1-211, Transcript of phosphatidylglycerophosphate synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PGS1, Length 1,944 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGS1-211ENST00000589425 GH2P01242 217 aa22.9■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 KIF5BP33176 963 aa22.9■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 FERMT3Q86UX7 667 aa22.9■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 SIAH1Q8IUQ4 282 aa22.9■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 ALG1Q9BT22 464 aa22.9■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 GGA3Q9NZ52 723 aa22.9■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 ATP2B2Q01814 1243 aa22.89■■□□□ 1.25
PGS1-211ENST00000589425 TRIM22Q8IYM9 498 aa22.89■■□□□ 1.25
PGS1-211ENST00000589425 C8orf76Q96K31 380 aa22.89■■□□□ 1.25
PGS1-211ENST00000589425 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
PGS1-211ENST00000589425 EEF2P13639 858 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
PGS1-211ENST00000589425 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
PGS1-211ENST00000589425 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa22.88■■□□□ 1.25
PGS1-211ENST00000589425 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
PGS1-211ENST00000589425 CABP5Q9NP86 173 aa22.88■■□□□ 1.25
PGS1-211ENST00000589425 NYAP2Q9P242 653 aa22.88■■□□□ 1.25
PGS1-211ENST00000589425 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
PGS1-211ENST00000589425 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.88■■□□□ 1.25
PGS1-211ENST00000589425 MKL1Q969V6 931 aa22.88■■□□□ 1.25
PGS1-211ENST00000589425 V9GY48 417 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
PGS1-211ENST00000589425 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa22.87■■□□□ 1.25
PGS1-211ENST00000589425 USP17L5A8MUK1 530 aa22.87■■□□□ 1.25
PGS1-211ENST00000589425 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
PGS1-211ENST00000589425 GOLGA8HP0CJ92 632 aa22.87■■□□□ 1.25
PGS1-211ENST00000589425 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.87■■□□□ 1.25
PGS1-211ENST00000589425 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa22.87■■□□□ 1.25
PGS1-211ENST00000589425 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
PGS1-211ENST00000589425 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa22.87■■□□□ 1.25
PGS1-211ENST00000589425 GLTPD2A6NH11 291 aa22.86■■□□□ 1.25
PGS1-211ENST00000589425 DEXIO95424 95 aa22.86■■□□□ 1.25
PGS1-211ENST00000589425 PDHBP11177 359 aa22.86■■□□□ 1.25
PGS1-211ENST00000589425 ICA1Q05084 483 aa22.86■■□□□ 1.25
PGS1-211ENST00000589425 PHF20L1A8MW92 1017 aa22.86■■□□□ 1.25
PGS1-211ENST00000589425 PKN1Q16512 942 aa22.86■■□□□ 1.25
PGS1-211ENST00000589425 SLC35G1Q2M3R5 365 aa22.86■■□□□ 1.25
PGS1-211ENST00000589425 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
PGS1-211ENST00000589425 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
PGS1-211ENST00000589425 CAP2P40123 477 aa22.85■■□□□ 1.25
PGS1-211ENST00000589425 GNAQP50148 359 aa22.85■■□□□ 1.25
PGS1-211ENST00000589425 MCTP1Q6DN14 999 aa22.85■■□□□ 1.25
PGS1-211ENST00000589425 WASF1Q92558 559 aa22.85■■□□□ 1.25
PGS1-211ENST00000589425 KLRF2D3W0D1 207 aa22.84■■□□□ 1.25
PGS1-211ENST00000589425 SNHG28P0DPA3 235 aa22.84■■□□□ 1.25
PGS1-211ENST00000589425 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
PGS1-211ENST00000589425 RESTQ13127 1097 aa22.84■■□□□ 1.25
PGS1-211ENST00000589425 FAM173BQ6P4H8 233 aa22.84■■□□□ 1.25
PGS1-211ENST00000589425 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa22.84■■□□□ 1.25
PGS1-211ENST00000589425 CYTH3O43739 400 aa22.84■■□□□ 1.25
PGS1-211ENST00000589425 KRT40Q6A162 431 aa22.84■■□□□ 1.25
PGS1-211ENST00000589425 CPVLQ9H3G5 476 aa22.84■■□□□ 1.25
PGS1-211ENST00000589425 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa22.84■■□□□ 1.25
PGS1-211ENST00000589425 MYH4Q9Y623 1939 aa22.83■■□□□ 1.25
PGS1-211ENST00000589425 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
PGS1-211ENST00000589425 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.24
PGS1-211ENST00000589425 A0A1W2PRG0 241 aa22.82■■□□□ 1.24
PGS1-211ENST00000589425 RGS22Q8NE09 1264 aa22.82■■□□□ 1.24
PGS1-211ENST00000589425 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.82■■□□□ 1.24
PGS1-211ENST00000589425 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PGS1-211ENST00000589425 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PGS1-211ENST00000589425 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa22.82■■□□□ 1.24
PGS1-211ENST00000589425 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PGS1-211ENST00000589425 LZTS2Q9BRK4 669 aa22.82■■□□□ 1.24
PGS1-211ENST00000589425 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PGS1-211ENST00000589425 EPHX2P34913 555 aa22.81■■□□□ 1.24
PGS1-211ENST00000589425 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PGS1-211ENST00000589425 SHISA4Q96DD7 197 aa22.81■■□□□ 1.24
PGS1-211ENST00000589425 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.81■■□□□ 1.24
PGS1-211ENST00000589425 ASPRV1Q53RT3 343 aa22.8■■□□□ 1.24
PGS1-211ENST00000589425 DLK2Q6UY11 383 aa22.8■■□□□ 1.24
PGS1-211ENST00000589425 UBA5Q9GZZ9 404 aa22.8■■□□□ 1.24
PGS1-211ENST00000589425 POTECB2RU33 542 aa22.8■■□□□ 1.24
PGS1-211ENST00000589425 F5H6K3 240 aa22.8■■□□□ 1.24
PGS1-211ENST00000589425 ECE1P42892 770 aa22.8■■□□□ 1.24
PGS1-211ENST00000589425 KLRC3Q07444 240 aa22.8■■□□□ 1.24
PGS1-211ENST00000589425 ZNF543Q08ER8 600 aa22.8■■□□□ 1.24
PGS1-211ENST00000589425 TRIM29Q14134 588 aa22.8■■□□□ 1.24
PGS1-211ENST00000589425 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
PGS1-211ENST00000589425 ACER1Q8TDN7 264 aa22.8■■□□□ 1.24
PGS1-211ENST00000589425 SPZ1Q9BXG8 430 aa22.8■■□□□ 1.24
PGS1-211ENST00000589425 GPCPD1Q9NPB8 672 aa22.8■■□□□ 1.24
PGS1-211ENST00000589425 KCNJ14Q9UNX9 436 aa22.8■■□□□ 1.24
PGS1-211ENST00000589425 FZD1Q9UP38 647 aa22.8■■□□□ 1.24
PGS1-211ENST00000589425 CNPY2Q9Y2B0 182 aa22.8■■□□□ 1.24
PGS1-211ENST00000589425 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.79■■□□□ 1.24
PGS1-211ENST00000589425 RAD21O60216 631 aa22.79■■□□□ 1.24
PGS1-211ENST00000589425 DCAF15Q66K64 600 aa22.79■■□□□ 1.24
PGS1-211ENST00000589425 SLFN13Q68D06 897 aa22.79■■□□□ 1.24
PGS1-211ENST00000589425 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
PGS1-211ENST00000589425 GDPD2Q9HCC8 539 aa22.79■■□□□ 1.24
PGS1-211ENST00000589425 VPS54Q9P1Q0 977 aa22.79■■□□□ 1.24
PGS1-211ENST00000589425 MYH6P13533 1939 aa22.79■■□□□ 1.24
PGS1-211ENST00000589425 KIF28PB7ZC32 967 aa22.78■■□□□ 1.24
PGS1-211ENST00000589425 ASNSP08243 561 aa22.78■■□□□ 1.24
PGS1-211ENST00000589425 SMARCA1P28370 1054 aa22.78■■□□□ 1.24
PGS1-211ENST00000589425 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PGS1-211ENST00000589425 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PGS1-211ENST00000589425 KCTD1Q719H9 257 aa22.78■■□□□ 1.24
PGS1-211ENST00000589425 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
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