RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582955.5

SMARCE1-218, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 5

Gene SMARCE1, Length 621 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-218ENST00000582955 GNRH1P01148 92 aa14.96□□□□□ -0.01
SMARCE1-218ENST00000582955 CTGFP29279 349 aa14.96□□□□□ -0.01
SMARCE1-218ENST00000582955 HAND2P61296 217 aa14.96□□□□□ -0.01
SMARCE1-218ENST00000582955 TFAP4Q01664 338 aa14.96□□□□□ -0.01
SMARCE1-218ENST00000582955 FAM47AQ5JRC9 791 aa14.96□□□□□ -0.01
SMARCE1-218ENST00000582955 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa14.96□□□□□ -0.01
SMARCE1-218ENST00000582955 SKAP1Q86WV1 359 aa14.96□□□□□ -0.01
SMARCE1-218ENST00000582955 SPICE1Q8N0Z3 855 aa14.96□□□□□ -0.01
SMARCE1-218ENST00000582955 LPAR1Q92633 364 aa14.96□□□□□ -0.01
SMARCE1-218ENST00000582955 PAGR1Q9BTK6 254 aa14.96□□□□□ -0.01
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SMARCE1-218ENST00000582955 VCPKMTQ9H867 229 aa14.96□□□□□ -0.01
SMARCE1-218ENST00000582955 GOPCQ9HD26 462 aa14.96□□□□□ -0.01
SMARCE1-218ENST00000582955 ANAPC4Q9UJX5 808 aa14.96□□□□□ -0.01
SMARCE1-218ENST00000582955 TSPY2A6NKD2 308 aa14.95□□□□□ -0.02
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SMARCE1-218ENST00000582955 HOXD10P28358 340 aa14.95□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa14.95□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 RUFY2Q8WXA3 655 aa14.95□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 INCENPQ9NQS7 918 aa14.95□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP14.95□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa14.95□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa14.94□□□□□ -0.02
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SMARCE1-218ENST00000582955 PEX10O60683 326 aa14.94□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 CHMLP26374 656 aa14.94□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 PRMT2P55345 433 aa14.94□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 NEDD1Q8NHV4 660 aa14.94□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 CEP95Q96GE4 821 aa14.94□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 NYAP2Q9P242 653 aa14.94□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 MORF4L1Q9UBU8 362 aa14.94□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 CLIP2Q9UDT6 1046 aa14.94□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 SRRDQ9UH36 339 aa14.94□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 PLIN4Q96Q06 1357 aa14.94□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 MYPNQ86TC9 1320 aa14.93□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 RAD50Q92878 1312 aa14.93□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 ZNF213O14771 459 aa14.93□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 WDR46O15213 610 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 TTLL1O95922 423 aa14.93□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa14.93□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 RAET1EQ8TD07 263 aa14.93□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 DSCC1Q9BVC3 393 aa14.93□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 IL25Q9H293 177 aa14.93□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 TXNRD2Q9NNW7 524 aa14.93□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 MTMR4Q9NYA4 1195 aa14.93□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 RBPJLQ9UBG7 517 aa14.93□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 TACC3Q9Y6A5 838 aa14.93□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 MGAMO43451 1857 aa14.93□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 ORC4O43929 436 aa14.92□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 FLOT1O75955 427 aa14.92□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 ERVK-9P63128 1117 aa14.92□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 ERVK-24P63145 666 aa14.92□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 PRKCZQ05513 592 aa14.92□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 COG2Q14746 738 aa14.92□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa14.92□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 AKNAD1Q5T1N1 836 aa14.92□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 MFSD6Q6ZSS7 791 aa14.92□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 TBC1D10CQ8IV04 446 aa14.92□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 COA7Q96BR5 231 aa14.92□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 CTNNA3Q9UI47 895 aa14.92□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 F5H6K3 240 aa14.91□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 KLRC3Q07444 240 aa14.91□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa14.91□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 FAM83BQ5T0W9 1011 aa14.91□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 STAG1Q8WVM7 1258 aa14.91□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 HOXC10Q9NYD6 342 aa14.91□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 GABRQQ9UN88 632 aa14.91□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 STX8Q9UNK0 236 aa14.91□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa14.91□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 MYH4Q9Y623 1939 aa14.9□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 HTTP42858 3142 aa14.9□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 NMT2O60551 498 aa14.9□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 CNMDO75829 334 aa14.9□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 NDUFB10O96000 172 aa14.9□□□□□ -0.02
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SMARCE1-218ENST00000582955 PCP11498 1178 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 FLT3LGP49771 235 aa14.9□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 Q3C1V9 767 aa14.9□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 POTEEQ6S8J3 1075 aa14.9□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 LBX2Q6XYB7 198 aa14.9□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 NBPF11Q86T75 865 aa14.9□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 SH3TC2Q8TF17 1288 aa14.9□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 MKL1Q969V6 931 aa14.9□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 NBPF3Q9H094 633 aa14.9□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SMARCE1-218ENST00000582955 LAMA4Q16363 1823 aa14.89□□□□□ -0.03
SMARCE1-218ENST00000582955 SGSM2O43147 1006 aa14.89□□□□□ -0.03
SMARCE1-218ENST00000582955 MAPK4P31152 587 aa14.89□□□□□ -0.03
SMARCE1-218ENST00000582955 SOX10P56693 466 aa14.89□□□□□ -0.03
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