RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 MAST3O60307 1309 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 NLRC4Q9NPP4 1024 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 RNF123Q5XPI4 1314 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 ARHGEF10O15013 1369 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 DAPK3O43293 454 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 KIAA0232Q92628 1395 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 TOM1O60784 492 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 MCUR1Q96AQ8 359 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 STK10O94804 968 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 TAF12Q16514 161 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 NEURL1BA8MQ27 555 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 TFAP4Q01664 338 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 A0A0D9SFI3 127 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP23.61■■□□□ 1.373e-18■■■■■ 81.5
PTPRM-211ENST00000580170 DCUN1D2Q6PH85 259 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 IQCDQ96DY2 449 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 TPCN1Q9ULQ1 816 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 GRM1Q13255 1194 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 MORC3Q14149 939 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 LRCH2Q5VUJ6 765 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 LONRF2Q1L5Z9 754 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC62Q6P9F0 684 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP23.6■■□□□ 1.378e-9■■■□□ 15.5
PTPRM-211ENST00000580170 ARHGAP44Q17R89 818 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 PICK1Q9NRD5 415 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 INSRP06213 1382 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 DENND2CQ68D51 928 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 DESI2Q9BSY9 194 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 PALD1Q9ULE6 856 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 BRD3Q15059 726 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 USP28Q96RU2 1077 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 TMOD4Q9NZQ9 345 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF654Q8IZM8 581 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 CAPN7Q9Y6W3 813 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 UBAP1LF5GYI3 381 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 GNA14O95837 355 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 NOSTRINQ8IVI9 506 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 GPT2Q8TD30 523 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 TSC1Q92574 1164 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 AP1ARQ63HQ0 302 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 MTMR6Q9Y217 621 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 PFKFB2O60825 505 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 FAM170AA1A519 330 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 KRT15P19012 456 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 GUCY2FP51841 1108 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 KRT71Q3SY84 523 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 SMCO2A6NFE2 343 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 SH3BP5O60239 455 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC87Q9NVE4 849 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 RAB17Q9H0T7 212 aa23.58■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 AMFRQ9UKV5 643 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 ZMYM3Q14202 1370 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 LRMPQ12912 555 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 CDAN1Q8IWY9 1227 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 ZMYM6O95789 1325 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 PKP1Q13835 747 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 RPAINQ86UA6 219 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 TRIM58Q8NG06 486 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 OR8K1Q8NGG5 319 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 NT5C3AQ9H0P0 336 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 I3L4J1 428 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 TBC1D8O95759 1140 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 LRRC8AQ8IWT6 810 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 KDRP35968 1356 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 CFBP00751 764 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 MGARPQ8TDB4 240 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 PARP2Q9UGN5 583 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 SSH3Q8TE77 659 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 MAIP1Q8WWC4 291 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 GBP5Q96PP8 586 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 VPS37BQ9H9H4 285 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 PPP2R5DQ14738 602 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 PFDN4Q9NQP4 134 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 NOP56O00567 594 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
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