RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574236.5

PHF23-208, Transcript of PHD finger protein 23, human

TSL 3

Gene PHF23, Length 583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PHF23-208	ENST00000574236	HMGCR	P04035	888 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PHF23-208	ENST00000574236	MORN1	Q5T089	497 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PHF23-208	ENST00000574236	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PHF23-208	ENST00000574236	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PHF23-208	ENST00000574236	DEFB118	Q96PH6	123 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PHF23-208	ENST00000574236	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PHF23-208	ENST00000574236	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PHF23-208	ENST00000574236	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
PHF23-208	ENST00000574236	RASA1	P20936	1047 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PHF23-208	ENST00000574236	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PHF23-208	ENST00000574236	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PHF23-208	ENST00000574236	GCC1	Q96CN9	775 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PHF23-208	ENST00000574236	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PHF23-208	ENST00000574236	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PHF23-208	ENST00000574236	MYH4	Q9Y623	1939 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PHF23-208	ENST00000574236	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PHF23-208	ENST00000574236	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PHF23-208	ENST00000574236	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	27.85	■■■□□ 2.05	7e-8	■■■■□ 25.2
PHF23-208	ENST00000574236	VCPKMT	Q9H867	229 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PHF23-208	ENST00000574236	CCL14	Q16627	93 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PHF23-208	ENST00000574236	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PHF23-208	ENST00000574236	STAP2	Q9UGK3	403 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PHF23-208	ENST00000574236	ALPK3	Q96L96	1907 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PHF23-208	ENST00000574236	PDE1A	P54750	535 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PHF23-208	ENST00000574236	ATP2B2	Q01814	1243 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PHF23-208	ENST00000574236	COG2	Q14746	738 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PHF23-208	ENST00000574236	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PHF23-208	ENST00000574236	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PHF23-208	ENST00000574236	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	FOXP2	O15409	715 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	APP	P05067	770 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	GNAT2	P19087	354 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	TDO2	P48775	406 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	PRDM1	O75626	825 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	IGHD	P01880	384 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	DSG3	P32926	999 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	WDR78	Q5VTH9	848 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	LPAR1	Q92633	364 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	ATG4C	Q96DT6	458 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	LNPK	Q9C0E8	428 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	PTPRE	P23469	700 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	RGS2	P41220	211 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	CCNA1	P78396	465 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	RPTOR	Q8N122	1335 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	CEP290	O15078	2479 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	FLOT1	O75955	427 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	MAP2K5	Q13163	448 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	SMC5	Q8IY18	1101 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	APBA2	Q99767	749 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	SH2D4A	Q9H788	454 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	GRB14	Q14449	540 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PHF23-208	ENST00000574236	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PHF23-208	ENST00000574236	VPS53	Q5VIR6	699 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PHF23-208	ENST00000574236	EVI5L	Q96CN4	794 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PHF23-208	ENST00000574236		H0YGN5	161 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PHF23-208	ENST00000574236	RAD21	O60216	631 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PHF23-208	ENST00000574236	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
PHF23-208	ENST00000574236	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
PHF23-208	ENST00000574236	AAMP	Q13685	434 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PHF23-208	ENST00000574236	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
PHF23-208	ENST00000574236	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
PHF23-208	ENST00000574236	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PHF23-208	ENST00000574236	ERCC3	P19447	782 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PHF23-208	ENST00000574236	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PHF23-208	ENST00000574236	DPF3	Q92784	378 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PHF23-208	ENST00000574236	FAM227B	Q96M60	508 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PHF23-208	ENST00000574236	NAPB	Q9H115	298 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PHF23-208	ENST00000574236	NYAP2	Q9P242	653 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PHF23-208	ENST00000574236	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PHF23-208	ENST00000574236	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03

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