RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569298.1

KARS-211, Transcript of lysyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 2

Gene KARS, Length 589 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARS-211ENST00000569298 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa7.28□□□□□ -1.24
KARS-211ENST00000569298 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
KARS-211ENST00000569298 SENP2Q9HC62 589 aa7.28□□□□□ -1.24
KARS-211ENST00000569298 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
KARS-211ENST00000569298 TBC1D7Q9P0N9 293 aa7.28□□□□□ -1.24
KARS-211ENST00000569298 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa7.28□□□□□ -1.24
KARS-211ENST00000569298 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
KARS-211ENST00000569298 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
KARS-211ENST00000569298 ITM2BQ9Y287 266 aa7.28□□□□□ -1.24
KARS-211ENST00000569298 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa7.28□□□□□ -1.24
KARS-211ENST00000569298 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa7.28□□□□□ -1.24
KARS-211ENST00000569298 TLL2Q9Y6L7 1015 aa7.28□□□□□ -1.24
KARS-211ENST00000569298 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa7.28□□□□□ -1.24
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KARS-211ENST00000569298 ZNF132P52740 706 aa7.27□□□□□ -1.25
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KARS-211ENST00000569298 PPFIA1Q13136 1202 aa7.27□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
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KARS-211ENST00000569298 CREB3L3Q68CJ9 461 aa7.27□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 KIAA0825Q8IV33 1275 aa7.27□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 MSANTD4Q8NCY6 345 aa7.27□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 VPS37AQ8NEZ2 397 aa7.27□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa7.27□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 FAM174AQ8TBP5 190 aa7.27□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 GOLGA1Q92805 767 aa7.27□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 LRRC45Q96CN5 670 aa7.27□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 IL17RAQ96F46 866 aa7.27□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 SPATA32Q96LK8 384 aa7.27□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 CDK15Q96Q40 435 aa7.27□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 SMC6Q96SB8 1091 aa7.27□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 CGREF1Q99674 301 aa7.27□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 SENP7Q9BQF6 1050 aa7.27□□□□□ -1.25
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KARS-211ENST00000569298 VCX3BQ9H321 246 aa7.27□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 CD248Q9HCU0 757 aa7.27□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 SLC39A2Q9NP94 309 aa7.27□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 FKBPLQ9UIM3 349 aa7.27□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 MRFAP1Q9Y605 127 aa7.27□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 PRXQ9BXM0 1461 aa7.27□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
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KARS-211ENST00000569298 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa7.26□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa7.26□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 STXBP3O00186 592 aa7.26□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 AP5Z1O43299 807 aa7.26□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 ATP9BO43861 1147 aa7.26□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
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KARS-211ENST00000569298 ARPC4P59998 168 aa7.26□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 PDE4BQ07343 736 aa7.26□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP7.26□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 NR1H3Q13133 447 aa7.26□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 E2F5Q15329 346 aa7.26□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 INAQ16352 499 aa7.26□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.26□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 CFAP70Q5T0N1 1121 aa7.26□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 NBPF14Q5TI25 921 aa7.26□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 EMC10Q5UCC4 262 aa7.26□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 FAAH2Q6GMR7 532 aa7.26□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 BICDL1Q6ZP65 573 aa7.26□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 MAATS1Q7Z4T9 603 aa7.26□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 TMEM110Q86TL2 294 aa7.26□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 SPC24Q8NBT2 197 aa7.26□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 CNKSR1Q969H4 720 aa7.26□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 EVI5LQ96CN4 794 aa7.26□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 TCHPQ9BT92 498 aa7.26□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa7.26□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 TANGO6Q9C0B7 1094 aa7.26□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa7.26□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 ASB3Q9Y575 518 aa7.26□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa7.26□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa7.26□□□□□ -1.25
KARS-211ENST00000569298 NUP160Q12769 1436 aa7.26□□□□□ -1.25
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