RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568501.5

REXO5-217, Transcript of RNA exonuclease 5, human

TSL 3

Gene REXO5, Length 624 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
REXO5-217	ENST00000568501	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	18.52	■□□□□ 0.56
REXO5-217	ENST00000568501	PBX2	P40425	430 aa		18.52	■□□□□ 0.56
REXO5-217	ENST00000568501	TIMM10	P62072	90 aa		18.52	■□□□□ 0.56
REXO5-217	ENST00000568501	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	18.52	■□□□□ 0.56
REXO5-217	ENST00000568501	XAGE2	Q96GT9	111 aa		18.52	■□□□□ 0.56
REXO5-217	ENST00000568501	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	18.52	■□□□□ 0.56
REXO5-217	ENST00000568501	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	18.52	■□□□□ 0.56
REXO5-217	ENST00000568501	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		18.52	■□□□□ 0.56
REXO5-217	ENST00000568501	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		18.52	■□□□□ 0.56
REXO5-217	ENST00000568501	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		18.52	■□□□□ 0.56
REXO5-217	ENST00000568501		A0A1B0GUL7	405 aa		18.51	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	GH2	P01242	217 aa		18.51	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	TMEM240	Q5SV17	173 aa		18.51	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	TMEM199	Q8N511	208 aa		18.51	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	HERVK_113	Q902F9	699 aa		18.51	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	18.51	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	MROH8	Q9H579	483 aa		18.51	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	COPRS	Q9NQ92	184 aa		18.51	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		18.51	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		18.51	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	FLT1	P17948	1338 aa		18.5	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		18.5	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	GPR37L1	O60883	481 aa		18.5	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	IGSF3	O75054	1194 aa		18.5	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	18.5	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	PPP4C	P60510	307 aa		18.5	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	MB21D1	Q8N884	522 aa		18.5	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		18.5	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	MAML3	Q96JK9	1138 aa		18.5	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		18.5	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	PALD1	Q9ULE6	856 aa		18.5	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		18.49	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	ERC2	O15083	957 aa		18.49	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	COBL	O75128	1261 aa		18.49	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	COG2	Q14746	738 aa		18.49	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	18.49	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		18.49	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		18.49	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		18.49	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	18.49	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	18.49	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	TBX21	Q9UL17	535 aa		18.49	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		18.48	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		18.48	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	ERCC3	P19447	782 aa		18.48	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	CCDC184	Q52MB2	194 aa		18.48	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	GORAB	Q5T7V8	394 aa		18.48	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	18.48	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		18.48	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		18.48	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	18.48	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	18.48	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		18.48	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	18.48	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	ZNF521	Q96K83	1311 aa		18.48	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		18.48	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		18.47	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	PGK1	P00558	417 aa		18.47	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	AKR1A1	P14550	325 aa		18.47	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		18.47	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		18.47	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	CABP5	Q9NP86	173 aa		18.47	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	COG5	Q9UP83	839 aa		18.47	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	FCER1A	P12319	257 aa		18.46	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	18.46	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	ACLY	P53396	1101 aa		18.46	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	ZNF365	Q70YC5	407 aa		18.46	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	SNX27	Q96L92	541 aa		18.46	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	18.46	■□□□□ 0.55
REXO5-217	ENST00000568501	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		18.45	■□□□□ 0.54
REXO5-217	ENST00000568501	CSF2RA	P15509	400 aa		18.45	■□□□□ 0.54
REXO5-217	ENST00000568501	KCNQ1	P51787	676 aa		18.45	■□□□□ 0.54
REXO5-217	ENST00000568501	TFF2	Q03403	129 aa		18.45	■□□□□ 0.54
REXO5-217	ENST00000568501	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	18.45	■□□□□ 0.54
REXO5-217	ENST00000568501	CERS3	Q8IU89	383 aa		18.45	■□□□□ 0.54
REXO5-217	ENST00000568501	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		18.45	■□□□□ 0.54
REXO5-217	ENST00000568501	EHD4	Q9H223	541 aa		18.45	■□□□□ 0.54
REXO5-217	ENST00000568501	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		18.45	■□□□□ 0.54
REXO5-217	ENST00000568501	MRS2	Q9HD23	443 aa		18.45	■□□□□ 0.54
REXO5-217	ENST00000568501	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	18.45	■□□□□ 0.54
REXO5-217	ENST00000568501	ELP1	O95163	1332 aa		18.45	■□□□□ 0.54
REXO5-217	ENST00000568501	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		18.44	■□□□□ 0.54
REXO5-217	ENST00000568501	ADAMTS4	O75173	837 aa		18.44	■□□□□ 0.54
REXO5-217	ENST00000568501	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		18.44	■□□□□ 0.54
REXO5-217	ENST00000568501	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	18.44	■□□□□ 0.54
REXO5-217	ENST00000568501	PI16	Q6UXB8	463 aa		18.44	■□□□□ 0.54
REXO5-217	ENST00000568501	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		18.44	■□□□□ 0.54
REXO5-217	ENST00000568501	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		18.44	■□□□□ 0.54
REXO5-217	ENST00000568501	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		18.44	■□□□□ 0.54
REXO5-217	ENST00000568501	TINF2	Q9BSI4	451 aa		18.44	■□□□□ 0.54
REXO5-217	ENST00000568501	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		18.44	■□□□□ 0.54
REXO5-217	ENST00000568501	APBB1	O00213	710 aa		18.43	■□□□□ 0.54
REXO5-217	ENST00000568501	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	18.43	■□□□□ 0.54
REXO5-217	ENST00000568501	SLC25A27	O95847	323 aa		18.43	■□□□□ 0.54
REXO5-217	ENST00000568501	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	18.43	■□□□□ 0.54
REXO5-217	ENST00000568501	TFCP2	Q12800	502 aa		18.43	■□□□□ 0.54
REXO5-217	ENST00000568501	ACER1	Q8TDN7	264 aa		18.43	■□□□□ 0.54
REXO5-217	ENST00000568501	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		18.43	■□□□□ 0.54
REXO5-217	ENST00000568501	IL23A	Q9NPF7	189 aa		18.43	■□□□□ 0.54
REXO5-217	ENST00000568501	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	18.43	■□□□□ 0.54

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