RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566905.5

PKD1-232, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, humanhuman

TSL 3

Gene PKD1, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1-232ENST00000566905 VCPKMTQ9H867 229 aa22.65■■□□□ 1.22
PKD1-232ENST00000566905 INCENPQ9NQS7 918 aa22.65■■□□□ 1.22
PKD1-232ENST00000566905 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
PKD1-232ENST00000566905 HAND2P61296 217 aa22.64■■□□□ 1.21
PKD1-232ENST00000566905 TFAP4Q01664 338 aa22.64■■□□□ 1.21
PKD1-232ENST00000566905 SKAP1Q86WV1 359 aa22.64■■□□□ 1.21
PKD1-232ENST00000566905 TXNRD2Q9NNW7 524 aa22.64■■□□□ 1.21
PKD1-232ENST00000566905 SRRDQ9UH36 339 aa22.64■■□□□ 1.21
PKD1-232ENST00000566905 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.64■■□□□ 1.21
PKD1-232ENST00000566905 LAMA4Q16363 1823 aa22.64■■□□□ 1.21
PKD1-232ENST00000566905 ZMYM6O95789 1325 aa22.63■■□□□ 1.21
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PKD1-232ENST00000566905 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
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PKD1-232ENST00000566905 LPAR1Q92633 364 aa22.63■■□□□ 1.21
PKD1-232ENST00000566905 GOPCQ9HD26 462 aa22.63■■□□□ 1.21
PKD1-232ENST00000566905 MORF4L1Q9UBU8 362 aa22.63■■□□□ 1.21
PKD1-232ENST00000566905 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.63■■□□□ 1.21
PKD1-232ENST00000566905 PARP14Q460N5 1801 aa22.63■■□□□ 1.21
PKD1-232ENST00000566905 HTTP42858 3142 aa22.62■■□□□ 1.21
PKD1-232ENST00000566905 PRKCZQ05513 592 aa22.62■■□□□ 1.21
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PKD1-232ENST00000566905 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.62■■□□□ 1.21
PKD1-232ENST00000566905 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
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PKD1-232ENST00000566905 TOMM22Q9NS69 142 aa22.62■■□□□ 1.21
PKD1-232ENST00000566905 RBPJLQ9UBG7 517 aa22.62■■□□□ 1.21
PKD1-232ENST00000566905 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.62■■□□□ 1.21
PKD1-232ENST00000566905 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.62■■□□□ 1.21
PKD1-232ENST00000566905 RLFQ13129 1914 aa22.62■■□□□ 1.21
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PKD1-232ENST00000566905 RAET1EQ8TD07 263 aa22.61■■□□□ 1.21
PKD1-232ENST00000566905 IL25Q9H293 177 aa22.61■■□□□ 1.21
PKD1-232ENST00000566905 NYAP2Q9P242 653 aa22.61■■□□□ 1.21
PKD1-232ENST00000566905 GABRQQ9UN88 632 aa22.61■■□□□ 1.21
PKD1-232ENST00000566905 PLIN4Q96Q06 1357 aa22.61■■□□□ 1.21
PKD1-232ENST00000566905 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
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PKD1-232ENST00000566905 SOX10P56693 466 aa22.6■■□□□ 1.21
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PKD1-232ENST00000566905 Q3C1V9 767 aa22.6■■□□□ 1.21
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PKD1-232ENST00000566905 POTEEQ6S8J3 1075 aa22.6■■□□□ 1.21
PKD1-232ENST00000566905 COA7Q96BR5 231 aa22.6■■□□□ 1.21
PKD1-232ENST00000566905 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.6■■□□□ 1.21
PKD1-232ENST00000566905 FLOT1O75955 427 aa22.59■■□□□ 1.21
PKD1-232ENST00000566905 TTLL1O95922 423 aa22.59■■□□□ 1.21
PKD1-232ENST00000566905 CHMLP26374 656 aa22.59■■□□□ 1.21
PKD1-232ENST00000566905 COG2Q14746 738 aa22.59■■□□□ 1.21
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PKD1-232ENST00000566905 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa22.59■■□□□ 1.21
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PKD1-232ENST00000566905 AKNAD1Q5T1N1 836 aa22.56■■□□□ 1.2
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PKD1-232ENST00000566905 PORCNQ9H237 461 aa22.56■■□□□ 1.2
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PKD1-232ENST00000566905 GRK4P32298 578 aa22.55■■□□□ 1.2
PKD1-232ENST00000566905 WDR78Q5VTH9 848 aa22.55■■□□□ 1.2
PKD1-232ENST00000566905 STAG1Q8WVM7 1258 aa22.55■■□□□ 1.2
PKD1-232ENST00000566905 MKL1Q969V6 931 aa22.55■■□□□ 1.2
PKD1-232ENST00000566905 ATG4CQ96DT6 458 aa22.55■■□□□ 1.2
PKD1-232ENST00000566905 FBXO28Q9NVF7 368 aa22.55■■□□□ 1.2
PKD1-232ENST00000566905 MAPK4P31152 587 aa22.54■■□□□ 1.2
PKD1-232ENST00000566905 CCNA1P78396 465 aa22.54■■□□□ 1.2
PKD1-232ENST00000566905 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.54■■□□□ 1.2
PKD1-232ENST00000566905 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.54■■□□□ 1.2
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