RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	F13B	P05160	661 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	RAG1	P15918	1043 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	ZAR1	Q86SH2	424 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		6.61	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		6.61	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	WDR64	B1ANS9	1081 aa		6.61	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	DYRK3	O43781	588 aa		6.61	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	IGLV1-40	P01703	118 aa		6.61	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	IGHA1	P01876	353 aa		6.61	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	FST	P19883	344 aa		6.61	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	GBP1	P32455	592 aa		6.61	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	NFIA	Q12857	509 aa		6.61	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	PPP2R5E	Q16537	467 aa		6.61	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		6.61	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		6.61	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		6.61	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		6.61	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	DRC1	Q96MC2	740 aa		6.61	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	SLC9A7	Q96T83	725 aa		6.61	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	USP35	Q9P2H5	1018 aa		6.61	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	MAP3K1	Q13233	1512 aa		6.6	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	ABCC2	Q92887	1545 aa		6.6	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		6.6	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		6.6	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	EOMES	O95936	686 aa		6.6	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	ACR	P10323	421 aa		6.6	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		6.6	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		6.6	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		6.6	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		6.6	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		6.6	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		6.6	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		6.6	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		6.6	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		6.59	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	HECW1	Q76N89	1606 aa		6.59	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	TNFRSF10C	O14798	259 aa		6.59	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	RGS13	O14921	159 aa		6.59	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	UBOX5	O94941	541 aa		6.59	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	GUCY2C	P25092	1073 aa		6.59	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		6.59	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		6.59	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	TM9SF2	Q99805	663 aa		6.59	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		6.59	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		6.59	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	ATG3	Q9NT62	314 aa		6.59	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	TIAM1	Q13009	1591 aa		6.59	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		6.59	□□□□□ -1.36
LINS1-210	ENST00000560934	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		6.58	□□□□□ -1.36
LINS1-210	ENST00000560934		A0A1W2PQH9	124 aa		6.58	□□□□□ -1.36
LINS1-210	ENST00000560934	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		6.58	□□□□□ -1.36
LINS1-210	ENST00000560934	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
LINS1-210	ENST00000560934	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		6.58	□□□□□ -1.36
LINS1-210	ENST00000560934	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		6.58	□□□□□ -1.36
LINS1-210	ENST00000560934	TTC6	Q86TZ1	520 aa		6.58	□□□□□ -1.36
LINS1-210	ENST00000560934	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		6.58	□□□□□ -1.36
LINS1-210	ENST00000560934	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
LINS1-210	ENST00000560934	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		6.58	□□□□□ -1.36
LINS1-210	ENST00000560934	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		6.58	□□□□□ -1.36
LINS1-210	ENST00000560934	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
LINS1-210	ENST00000560934	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		6.57	□□□□□ -1.36
LINS1-210	ENST00000560934	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		6.57	□□□□□ -1.36
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM192	Q8IY95	271 aa		6.57	□□□□□ -1.36
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
LINS1-210	ENST00000560934	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
LINS1-210	ENST00000560934	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
LINS1-210	ENST00000560934	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		6.57	□□□□□ -1.36
LINS1-210	ENST00000560934	GSC2	O15499	205 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LINS1-210	ENST00000560934	CBX7	O95931	251 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LINS1-210	ENST00000560934	CASP7	P55210	303 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LINS1-210	ENST00000560934	CHMP4BP1	P59074	171 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LINS1-210	ENST00000560934	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LINS1-210	ENST00000560934	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LINS1-210	ENST00000560934	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LINS1-210	ENST00000560934	SLC6A18	Q96N87	628 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LINS1-210	ENST00000560934	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LINS1-210	ENST00000560934	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LINS1-210	ENST00000560934	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LINS1-210	ENST00000560934	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
LINS1-210	ENST00000560934	ASXL2	Q76L83	1435 aa		6.56	□□□□□ -1.36
LINS1-210	ENST00000560934	NCOA2	Q15596	1464 aa		6.55	□□□□□ -1.36
LINS1-210	ENST00000560934	IGSF3	O75054	1194 aa		6.55	□□□□□ -1.36
LINS1-210	ENST00000560934	LRRN2	O75325	713 aa		6.55	□□□□□ -1.36
LINS1-210	ENST00000560934	CYP27A1	Q02318	531 aa		6.55	□□□□□ -1.36
LINS1-210	ENST00000560934	RBL2	Q08999	1139 aa		6.55	□□□□□ -1.36
LINS1-210	ENST00000560934	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
LINS1-210	ENST00000560934	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		6.55	□□□□□ -1.36

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