RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-208ENST00000558954 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
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RABGGTA-208ENST00000558954 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa22.32■■□□□ 1.16
RABGGTA-208ENST00000558954 FKTNO75072 461 aa22.31■■□□□ 1.16
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
RABGGTA-208ENST00000558954 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
RABGGTA-208ENST00000558954 CNNM2Q9H8M5 875 aa22.31■■□□□ 1.16
RABGGTA-208ENST00000558954 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
RABGGTA-208ENST00000558954 KRT23Q9C075 422 aa22.3■■□□□ 1.16
RABGGTA-208ENST00000558954 DOCK3Q8IZD9 2030 aa22.3■■□□□ 1.16
RABGGTA-208ENST00000558954 USP17L15C9J2P7 530 aa22.29■■□□□ 1.16
RABGGTA-208ENST00000558954 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.29■■□□□ 1.16
RABGGTA-208ENST00000558954 USP17L11C9JVI0 530 aa22.29■■□□□ 1.16
RABGGTA-208ENST00000558954 USP17L18D6R9N7 530 aa22.29■■□□□ 1.16
RABGGTA-208ENST00000558954 USP17L22D6RA61 530 aa22.29■■□□□ 1.16
RABGGTA-208ENST00000558954 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.29■■□□□ 1.16
RABGGTA-208ENST00000558954 USP17L19D6RCP7 530 aa22.29■■□□□ 1.16
RABGGTA-208ENST00000558954 USP17L20D6RJB6 530 aa22.29■■□□□ 1.16
RABGGTA-208ENST00000558954 CYP21A2P08686 494 aa22.29■■□□□ 1.16
RABGGTA-208ENST00000558954 SP3Q02447 781 aa22.29■■□□□ 1.16
RABGGTA-208ENST00000558954 USP17L24Q0WX57 530 aa22.29■■□□□ 1.16
RABGGTA-208ENST00000558954 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
RABGGTA-208ENST00000558954 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.29■■□□□ 1.16
RABGGTA-208ENST00000558954 STX8Q9UNK0 236 aa22.29■■□□□ 1.16
RABGGTA-208ENST00000558954 WDR46O15213 610 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
RABGGTA-208ENST00000558954 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
RABGGTA-208ENST00000558954 C17orf99Q6UX52 265 aa22.28■■□□□ 1.16
RABGGTA-208ENST00000558954 SPICE1Q8N0Z3 855 aa22.28■■□□□ 1.16
RABGGTA-208ENST00000558954 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
RABGGTA-208ENST00000558954 MKL1Q969V6 931 aa22.28■■□□□ 1.16
RABGGTA-208ENST00000558954 ERO1AQ96HE7 468 aa22.28■■□□□ 1.16
RABGGTA-208ENST00000558954 TANGO6Q9C0B7 1094 aa22.28■■□□□ 1.16
RABGGTA-208ENST00000558954 IL17RBQ9NRM6 502 aa22.28■■□□□ 1.16
RABGGTA-208ENST00000558954 CPA4Q9UI42 421 aa22.28■■□□□ 1.16
RABGGTA-208ENST00000558954 RAD21O60216 631 aa22.27■■□□□ 1.16
RABGGTA-208ENST00000558954 NMT2O60551 498 aa22.27■■□□□ 1.16
RABGGTA-208ENST00000558954 KDM4AO75164 1064 aa22.27■■□□□ 1.16
RABGGTA-208ENST00000558954 TRDNQ13061 729 aa22.27■■□□□ 1.16
RABGGTA-208ENST00000558954 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
RABGGTA-208ENST00000558954 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa22.27■■□□□ 1.16
RABGGTA-208ENST00000558954 B4E1Z4 1266 aa22.26■■□□□ 1.15
RABGGTA-208ENST00000558954 BCRP11274 1271 aa22.26■■□□□ 1.15
RABGGTA-208ENST00000558954 HERVK_113P62684 666 aa22.26■■□□□ 1.15
RABGGTA-208ENST00000558954 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.26■■□□□ 1.15
RABGGTA-208ENST00000558954 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa22.26■■□□□ 1.15
RABGGTA-208ENST00000558954 IQCA1Q86XH1 822 aa22.26■■□□□ 1.15
RABGGTA-208ENST00000558954 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa22.26■■□□□ 1.15
RABGGTA-208ENST00000558954 MYH6P13533 1939 aa22.25■■□□□ 1.15
RABGGTA-208ENST00000558954 REC8O95072 547 aa22.25■■□□□ 1.15
RABGGTA-208ENST00000558954 FAM110CQ1W6H9 321 aa22.25■■□□□ 1.15
RABGGTA-208ENST00000558954 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
RABGGTA-208ENST00000558954 PLXNB2O15031 1838 aa22.24■■□□□ 1.15
RABGGTA-208ENST00000558954 F5H6K3 240 aa22.24■■□□□ 1.15
RABGGTA-208ENST00000558954 NDUFB10O96000 172 aa22.24■■□□□ 1.15
RABGGTA-208ENST00000558954 NOVP48745 357 aa22.24■■□□□ 1.15
RABGGTA-208ENST00000558954 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
RABGGTA-208ENST00000558954 KLRC3Q07444 240 aa22.24■■□□□ 1.15
RABGGTA-208ENST00000558954 KIF22Q14807 665 aa22.24■■□□□ 1.15
RABGGTA-208ENST00000558954 CCDC178Q5BJE1 867 aa22.24■■□□□ 1.15
RABGGTA-208ENST00000558954 RNF20Q5VTR2 975 aa22.24■■□□□ 1.15
RABGGTA-208ENST00000558954 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa22.24■■□□□ 1.15
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RABGGTA-208ENST00000558954 E7EWF7 191 aa22.23■■□□□ 1.15
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RABGGTA-208ENST00000558954 NECTIN1Q15223 517 aa22.23■■□□□ 1.15
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RABGGTA-208ENST00000558954 CD99L2Q8TCZ2 262 aa22.23■■□□□ 1.15
RABGGTA-208ENST00000558954 MYPNQ86TC9 1320 aa22.23■■□□□ 1.15
RABGGTA-208ENST00000558954 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC27A2O14975 620 aa22.22■■□□□ 1.15
RABGGTA-208ENST00000558954 TOP1P11387 765 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
RABGGTA-208ENST00000558954 COG2Q14746 738 aa22.22■■□□□ 1.15
RABGGTA-208ENST00000558954 ARHGEF6Q15052 776 aa22.22■■□□□ 1.15
RABGGTA-208ENST00000558954 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.22■■□□□ 1.15
RABGGTA-208ENST00000558954 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
RABGGTA-208ENST00000558954 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.22■■□□□ 1.15
RABGGTA-208ENST00000558954 LBX2Q6XYB7 198 aa22.22■■□□□ 1.15
RABGGTA-208ENST00000558954 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
RABGGTA-208ENST00000558954 NKX2-3Q8TAU0 364 aa22.22■■□□□ 1.15
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RABGGTA-208ENST00000558954 UBAC1Q9BSL1 405 aa22.22■■□□□ 1.15
RABGGTA-208ENST00000558954 ZSWIM5Q9P217 1185 aa22.22■■□□□ 1.15
RABGGTA-208ENST00000558954 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.22■■□□□ 1.15
RABGGTA-208ENST00000558954 STOX1Q6ZVD7 989 aa22.21■■□□□ 1.15
RABGGTA-208ENST00000558954 DGKHQ86XP1 1220 aa22.21■■□□□ 1.15
RABGGTA-208ENST00000558954 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
RABGGTA-208ENST00000558954 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa22.21■■□□□ 1.15
RABGGTA-208ENST00000558954 MORF4L1Q9UBU8 362 aa22.21■■□□□ 1.15
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
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RABGGTA-208ENST00000558954 RCSD1Q6JBY9 416 aa22.2■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 GMCL1Q96IK5 515 aa22.2■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 TMEM47Q9BQJ4 181 aa22.2■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 HOXC10Q9NYD6 342 aa22.2■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 TNKSO95271 1327 aa22.2■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC1A4P43007 532 aa22.19■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 MB21D1Q8N884 522 aa22.19■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 PAGR1Q9BTK6 254 aa22.19■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa22.19■■□□□ 1.14
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