RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558300.1

TMOD3-202, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TMOD3, Length 430 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-202ENST00000558300 GPATCH2Q9NW75 528 aa6.11□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 EBF1Q9UH73 591 aa6.11□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 DUSP13Q9UII6 198 aa6.11□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 CEP131Q9UPN4 1083 aa6.11□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 NOTOA8MTQ0 251 aa6.1□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 SASH1O94885 1247 aa6.1□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 SV2BQ7L1I2 683 aa6.1□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 DTWD2Q8NBA8 298 aa6.1□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 CELA3BP08861 270 aa6.09□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 RPS26P62854 115 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 PLCB3Q01970 1234 aa6.09□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 EFEMP1Q12805 493 aa6.09□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 ANKS4BQ8N8V4 417 aa6.09□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 TMEM87BQ96K49 555 aa6.09□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 SIGLEC10Q96LC7 697 aa6.09□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 DCTN4Q9UJW0 460 aa6.09□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa6.09□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 SLC22A31A6NKX4 558 aa6.08□□□□□ -1.44
TMOD3-202ENST00000558300 TMEM132EQ6IEE7 984 aa6.08□□□□□ -1.44
TMOD3-202ENST00000558300 PANK1Q8TE04 598 aa6.08□□□□□ -1.44
TMOD3-202ENST00000558300 G6PC3Q9BUM1 346 aa6.08□□□□□ -1.44
TMOD3-202ENST00000558300 SOWAHDA6NJG2 315 aa6.07□□□□□ -1.44
TMOD3-202ENST00000558300 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
TMOD3-202ENST00000558300 PSPNO60542 156 aa6.07□□□□□ -1.44
TMOD3-202ENST00000558300 PI3P19957 117 aa6.07□□□□□ -1.44
TMOD3-202ENST00000558300 TEKQ02763 1124 aa6.07□□□□□ -1.44
TMOD3-202ENST00000558300 NLRX1Q86UT6 975 aa6.07□□□□□ -1.44
TMOD3-202ENST00000558300 TEPSINQ96N21 525 aa6.07□□□□□ -1.44
TMOD3-202ENST00000558300 ADAM30Q9UKF2 790 aa6.07□□□□□ -1.44
TMOD3-202ENST00000558300 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
TMOD3-202ENST00000558300 OR14I1A6ND48 311 aa6.06□□□□□ -1.44
TMOD3-202ENST00000558300 EFEMP2O95967 443 aa6.06□□□□□ -1.44
TMOD3-202ENST00000558300 PDE6BP35913 854 aa6.06□□□□□ -1.44
TMOD3-202ENST00000558300 DUSP4Q13115 394 aa6.06□□□□□ -1.44
TMOD3-202ENST00000558300 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
TMOD3-202ENST00000558300 FAM8A1Q9UBU6 413 aa6.06□□□□□ -1.44
TMOD3-202ENST00000558300 IRAK3Q9Y616 596 aa6.06□□□□□ -1.44
TMOD3-202ENST00000558300 N4BP3O15049 544 aa6.05□□□□□ -1.44
TMOD3-202ENST00000558300 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
TMOD3-202ENST00000558300 YBX1P67809 324 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
TMOD3-202ENST00000558300 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP6.05□□□□□ -1.44
TMOD3-202ENST00000558300 ERICH6BQ5W0A0 696 aa6.05□□□□□ -1.44
TMOD3-202ENST00000558300 TTBK2Q6IQ55 1244 aa6.05□□□□□ -1.44
TMOD3-202ENST00000558300 C12orf49Q9H741 205 aa6.05□□□□□ -1.44
TMOD3-202ENST00000558300 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
TMOD3-202ENST00000558300 GPR160Q9UJ42 338 aa6.05□□□□□ -1.44
TMOD3-202ENST00000558300 KCNH3Q9ULD8 1083 aa6.05□□□□□ -1.44
TMOD3-202ENST00000558300 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
TMOD3-202ENST00000558300 PGRP06401 933 aa6.04□□□□□ -1.44
TMOD3-202ENST00000558300 LTKP29376 864 aa6.04□□□□□ -1.44
TMOD3-202ENST00000558300 ALG1LQ6GMV1 187 aa6.04□□□□□ -1.44
TMOD3-202ENST00000558300 SP8Q8IXZ3 490 aa6.04□□□□□ -1.44
TMOD3-202ENST00000558300 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa6.04□□□□□ -1.44
TMOD3-202ENST00000558300 RNF141Q8WVD5 230 aa6.04□□□□□ -1.44
TMOD3-202ENST00000558300 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
TMOD3-202ENST00000558300 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa6.04□□□□□ -1.44
TMOD3-202ENST00000558300 CNTD2Q9H8S5 307 aa6.04□□□□□ -1.44
TMOD3-202ENST00000558300 CRTAC1Q9NQ79 661 aa6.04□□□□□ -1.44
TMOD3-202ENST00000558300 E9PSI1 815 aa6.03□□□□□ -1.44
TMOD3-202ENST00000558300 CCDC27Q2M243 656 aa6.03□□□□□ -1.44
TMOD3-202ENST00000558300 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
TMOD3-202ENST00000558300 SPATS1Q496A3 300 aa6.03□□□□□ -1.44
TMOD3-202ENST00000558300 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP6.03□□□□□ -1.44
TMOD3-202ENST00000558300 FRMD5Q7Z6J6 570 aa6.03□□□□□ -1.44
TMOD3-202ENST00000558300 FEZF2Q8TBJ5 459 aa6.03□□□□□ -1.44
TMOD3-202ENST00000558300 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
TMOD3-202ENST00000558300 EPHB3P54753 998 aa6.02□□□□□ -1.45
TMOD3-202ENST00000558300 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
TMOD3-202ENST00000558300 PDE4BQ07343 736 aa6.02□□□□□ -1.45
TMOD3-202ENST00000558300 AGMOQ6ZNB7 445 aa6.02□□□□□ -1.45
TMOD3-202ENST00000558300 TMEFF1Q8IYR6 380 aa6.02□□□□□ -1.45
TMOD3-202ENST00000558300 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
TMOD3-202ENST00000558300 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
TMOD3-202ENST00000558300 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa6.02□□□□□ -1.45
TMOD3-202ENST00000558300 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa6.02□□□□□ -1.45
TMOD3-202ENST00000558300 NRDCO43847 1150 aa6.01□□□□□ -1.45
TMOD3-202ENST00000558300 USP17L7P0C7H9 530 aa6.01□□□□□ -1.45
TMOD3-202ENST00000558300 RBM25P49756 843 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
TMOD3-202ENST00000558300 CAP1Q01518 475 aa6.01□□□□□ -1.45
TMOD3-202ENST00000558300 SEPT6Q14141 434 aa6.01□□□□□ -1.45
TMOD3-202ENST00000558300 SETDB2Q96T68 719 aa6.01□□□□□ -1.45
TMOD3-202ENST00000558300 SPG7Q9UQ90 795 aa6.01□□□□□ -1.45
TMOD3-202ENST00000558300 VIPR1P32241 457 aa6□□□□□ -1.45
TMOD3-202ENST00000558300 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
TMOD3-202ENST00000558300 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
TMOD3-202ENST00000558300 TMEM201Q5SNT2 666 aa6□□□□□ -1.45
TMOD3-202ENST00000558300 ADGRF1Q5T601 910 aa6□□□□□ -1.45
TMOD3-202ENST00000558300 FAM129CQ86XR2 697 aa6□□□□□ -1.45
TMOD3-202ENST00000558300 LINC01356Q8N9X3 169 aa6□□□□□ -1.45
TMOD3-202ENST00000558300 SIRT5Q9NXA8 310 aa6□□□□□ -1.45
TMOD3-202ENST00000558300 SHISA3A0PJX4 238 aa5.99□□□□□ -1.45
TMOD3-202ENST00000558300 GALK1P51570 392 aa5.99□□□□□ -1.45
TMOD3-202ENST00000558300 ERVFRD-1P60508 538 aa5.99□□□□□ -1.45
TMOD3-202ENST00000558300 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
TMOD3-202ENST00000558300 SLFN12Q8IYM2 578 aa5.99□□□□□ -1.45
TMOD3-202ENST00000558300 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
TMOD3-202ENST00000558300 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms