RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557549.5

RBM23-231, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-231	ENST00000557549	USP17L15	C9J2P7	530 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RBM23-231	ENST00000557549	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RBM23-231	ENST00000557549	USP17L11	C9JVI0	530 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RBM23-231	ENST00000557549	USP17L18	D6R9N7	530 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RBM23-231	ENST00000557549	USP17L22	D6RA61	530 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RBM23-231	ENST00000557549	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RBM23-231	ENST00000557549	USP17L19	D6RCP7	530 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RBM23-231	ENST00000557549	USP17L20	D6RJB6	530 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RBM23-231	ENST00000557549	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
RBM23-231	ENST00000557549	VCAM1	P19320	739 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RBM23-231	ENST00000557549	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	14.67	□□□□□ -0.06
RBM23-231	ENST00000557549	GRK4	P32298	578 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RBM23-231	ENST00000557549	USP17L24	Q0WX57	530 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RBM23-231	ENST00000557549	MTFR1	Q15390	333 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RBM23-231	ENST00000557549		Q3C1V9	767 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RBM23-231	ENST00000557549	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RBM23-231	ENST00000557549	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RBM23-231	ENST00000557549	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RBM23-231	ENST00000557549	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RBM23-231	ENST00000557549	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	14.66	□□□□□ -0.06
RBM23-231	ENST00000557549	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
RBM23-231	ENST00000557549	FOXP2	O15409	715 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RBM23-231	ENST00000557549	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
RBM23-231	ENST00000557549	NT5C2	P49902	561 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RBM23-231	ENST00000557549	PDE4B	Q07343	736 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RBM23-231	ENST00000557549	PPARA	Q07869	468 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RBM23-231	ENST00000557549	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RBM23-231	ENST00000557549	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
RBM23-231	ENST00000557549	COA7	Q96BR5	231 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RBM23-231	ENST00000557549	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RBM23-231	ENST00000557549	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RBM23-231	ENST00000557549	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RBM23-231	ENST00000557549	ADCY3	O60266	1144 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RBM23-231	ENST00000557549	FGA	P02671	866 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RBM23-231	ENST00000557549	ELN	P15502	786 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	14.65	□□□□□ -0.06
RBM23-231	ENST00000557549	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RBM23-231	ENST00000557549	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RBM23-231	ENST00000557549	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	14.65	□□□□□ -0.06
RBM23-231	ENST00000557549	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	14.65	□□□□□ -0.06
RBM23-231	ENST00000557549	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RBM23-231	ENST00000557549	GJD2	Q9UKL4	321 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RBM23-231	ENST00000557549	CNMD	O75829	334 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	14.64	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	RASA1	P20936	1047 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	CHML	P26374	656 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	ERVK-9	P63128	1117 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	ERVK-24	P63145	666 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	ICA1	Q05084	483 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	VPS53	Q5VIR6	699 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	14.64	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	PORCN	Q9H237	461 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	SH2D4A	Q9H788	454 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	14.64	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	TMX2	Q9Y320	296 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	PLXNB2	O15031	1838 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	LAMA4	Q16363	1823 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	PRDM1	O75626	825 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	FGR	P09769	529 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	14.63	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	ATP2B2	Q01814	1243 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	IRF5	Q13568	498 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	BTBD7	Q9P203	1132 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	RLF	Q13129	1914 aa		14.62	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	MYH4	Q9Y623	1939 aa		14.62	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		14.62	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	14.62	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	CCL5	P13501	91 aa		14.62	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		14.62	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	14.62	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	LPAR1	Q92633	364 aa		14.62	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	VCPKMT	Q9H867	229 aa		14.62	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		14.62	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	BRCA2	P51587	3418 aa		14.62	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	ORC4	O43929	436 aa		14.61	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	UBXN2A	P68543	259 aa		14.61	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	COG2	Q14746	738 aa		14.61	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	LBX2	Q6XYB7	198 aa		14.61	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		14.61	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		14.61	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		14.61	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	14.61	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	NYAP2	Q9P242	653 aa		14.61	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	14.61	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		14.6	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF213	O14771	459 aa		14.6	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	SGSM2	O43147	1006 aa		14.6	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	INHA	P05111	366 aa		14.6	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	CYP2B6	P20813	491 aa		14.6	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	MAPK4	P31152	587 aa		14.6	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	14.6	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	RNF208	Q9H0X6	261 aa		14.6	□□□□□ -0.07
RBM23-231	ENST00000557549	INCENP	Q9NQS7	918 aa		14.6	□□□□□ -0.07

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