RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557332.5

TDRD9-208, Transcript of tudor domain containing 9, human

TSL 2

Gene TDRD9, Length 3,338 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TDRD9-208	ENST00000557332	LRRC31	Q6UY01	552 aa		11.65	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	MTMR7	Q9Y216	660 aa		11.65	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		11.65	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	RNF40	O75150	1001 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	CTSW	P56202	376 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	KRT23	Q9C075	422 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	TNKS	O95271	1327 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	ERCC3	P19447	782 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	NLRP10	Q86W26	655 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	NELFB	Q8WX92	580 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	DRC1	Q96MC2	740 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	MTR	Q99707	1265 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	POLD4	Q9HCU8	107 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	XDH	P47989	1333 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	TTC26	A0AVF1	554 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	KCNJ18	B7U540	433 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	ATF3	P18847	181 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	11.63	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	USP5	P45974	858 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	KCNJ12	Q14500	433 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	PSMB7	Q99436	277 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	MYBL2	P10244	700 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	CYP27A1	Q02318	531 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	PKN1	Q16512	942 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	TICAM2	Q86XR7	235 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	EHD4	Q9H223	541 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	11.63	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	STK36	Q9NRP7	1315 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	NMT2	O60551	498 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	KRT2	P35908	639 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	PIP4K2B	P78356	416 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	C4A	P0C0L4	1744 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	C4B	P0C0L5	1744 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	NDUFA10	O95299	355 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	KLK7	P49862	253 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	SLC20A2	Q08357	652 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	CAGE1	Q8TC20	777 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	GSDMA	Q96QA5	445 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	SLIT3	O75094	1523 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	USP54	Q70EL1	1684 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	PP2D1	A8MPX8	630 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	POTEB2	H3BUK9	544 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	CYP7A1	P22680	504 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	PRCP	P42785	496 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	PPARA	Q07869	468 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	TTC38	Q5R3I4	469 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	PACS2	Q86VP3	889 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	11.62	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	PAK1	Q13153	545 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	MYH8	P13535	1937 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	RCCD1	A6NED2	376 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	GGCX	P38435	758 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	AMPD2	Q01433	879 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	KIAA1328	Q86T90	577 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TDRD9-208	ENST00000557332	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55

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