RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557014.1

GTF3AP2-201, Transcript of general transcription factor IIIA pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene GTF3AP2, Length 266 nt, Biotype transcribed processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AP2-201ENST00000557014 ZNF318Q5VUA4 2279 aa3.53□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 TRIOO75962 3097 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 A0A1W2PQY0 241 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 DCDC2CA8MYV0 355 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 SEMA3EO15041 775 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 SEPT4O43236 478 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 GPR37L1O60883 481 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 COBLO75128 1261 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 GDF11O95390 407 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 PGK1P00558 417 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 TIMP1P01033 207 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 ASNSP08243 561 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 ACRP10323 421 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 CSF2RAP15509 400 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 ADORA2AP29274 412 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 MRE11P49959 708 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 NUBP1P53384 320 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 FAAP100Q0VG06 881 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 AAK1Q2M2I8 961 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 FAM47AQ5JRC9 791 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 TMEM240Q5SV17 173 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 RASIP1Q5U651 963 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 CCDC102BQ68D86 513 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 USP17L2Q6R6M4 530 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 ZNF365Q70YC5 407 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 TEX11Q8IYF3 940 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 SLC44A5Q8NCS7 719 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 TRIM34Q9BYJ4 488 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 DNAJC18Q9H819 358 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 SLC28A3Q9HAS3 691 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 CEP126Q9P2H0 1117 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 PI4KBQ9UBF8 816 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 MSRAQ9UJ68 235 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 SCN5AQ14524 2016 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 USP34Q70CQ2 3546 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 IL16Q14005 1332 aa3.51□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 USP17L15C9J2P7 530 aa3.51□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 USP17L13C9JLJ4 530 aa3.51□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 USP17L11C9JVI0 530 aa3.51□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 USP17L18D6R9N7 530 aa3.51□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 USP17L22D6RA61 530 aa3.51□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 USP17L17D6RBQ6 530 aa3.51□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 USP17L19D6RCP7 530 aa3.51□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 USP17L20D6RJB6 530 aa3.51□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 SMIM22K7EJ46 135 aa3.51□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 APBB1O00213 710 aa3.51□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 RFXAPO00287 272 aa3.51□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 ERC2O15083 957 aa3.51□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 GH2P01242 217 aa3.51□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 RARBP10826 455 aa3.51□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 MYOGP15173 224 aa3.51□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 VCAM1P19320 739 aa3.51□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 RABGGTBP53611 331 aa3.51□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 TIMM10P62072 90 aa3.51□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 GSTO1P78417 241 aa3.51□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 USP17L24Q0WX57 530 aa3.51□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP3.51□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 RAB30Q15771 203 aa3.51□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 CCDC27Q2M243 656 aa3.51□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 OLFML2BQ68BL8 750 aa3.51□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 KRT40Q6A162 431 aa3.51□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 MFSD5Q6N075 450 aa3.51□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 PI16Q6UXB8 463 aa3.51□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa3.51□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 ERICH6Q7L0X2 663 aa3.51□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa3.51□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 RNF180Q86T96 592 aa3.51□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa3.51□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa3.51□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 FEZ1Q99689 392 aa3.51□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 USP44Q9H0E7 712 aa3.51□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 PALD1Q9ULE6 856 aa3.51□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa3.51□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 EPG5Q9HCE0 2579 aa3.51□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 PTPRSQ13332 1948 aa3.5□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
GTF3AP2-201ENST00000557014 FLT1P17948 1338 aa3.5□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms