RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552985.5

TPCN1-223, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 3

Gene TPCN1, Length 762 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-223	ENST00000552985	NBPF3	Q9H094	633 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	VCPKMT	Q9H867	229 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	SRRD	Q9UH36	339 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	GABRQ	Q9UN88	632 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	LAMA4	Q16363	1823 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	CNMD	O75829	334 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	GNRH1	P01148	92 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	HAND2	P61296	217 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	TFAP4	Q01664	338 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985		Q3C1V9	767 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	CEP95	Q96GE4	821 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	ZMYM6	O95789	1325 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	CHML	P26374	656 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	SOX10	P56693	466 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	PRKCZ	Q05513	592 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	LPAR1	Q92633	364 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	SH2D4A	Q9H788	454 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	NYAP2	Q9P242	653 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	PLXNB2	O15031	1838 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	MYPN	Q86TC9	1320 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	ORC4	O43929	436 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	RAD21	O60216	631 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	NMT2	O60551	498 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	FGR	P09769	529 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	TSPY3	P0CV98	308 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	TSPY8	P0CW00	308 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	HOXD10	P28358	340 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	ERVK-9	P63128	1117 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	ERVK-24	P63145	666 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	ARMC5	Q96C12	935 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	PORCN	Q9H237	461 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	BTBD7	Q9P203	1132 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985		A0A0G2JMZ2	1700 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	FLT3LG	P49771	235 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	PRMT2	P55345	433 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	COG2	Q14746	738 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	LBX2	Q6XYB7	198 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	GOPC	Q9HD26	462 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	TSPY2	A6NKD2	308 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TPCN1-223	ENST00000552985	FLOT1	O75955	427 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TPCN1-223	ENST00000552985	TTLL1	O95922	423 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TPCN1-223	ENST00000552985	NDUFB10	O96000	172 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TPCN1-223	ENST00000552985	NEFL	P07196	543 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TPCN1-223	ENST00000552985	DSG3	P32926	999 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TPCN1-223	ENST00000552985	PTH1R	Q03431	593 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TPCN1-223	ENST00000552985	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
TPCN1-223	ENST00000552985	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TPCN1-223	ENST00000552985	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
TPCN1-223	ENST00000552985	RAET1E	Q8TD07	263 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TPCN1-223	ENST00000552985	MKL1	Q969V6	931 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TPCN1-223	ENST00000552985	COA7	Q96BR5	231 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TPCN1-223	ENST00000552985	ATG4C	Q96DT6	458 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF333	Q96JL9	665 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TPCN1-223	ENST00000552985	TOMM22	Q9NS69	142 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TPCN1-223	ENST00000552985	GJD2	Q9UKL4	321 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TPCN1-223	ENST00000552985	RAD50	Q92878	1312 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TPCN1-223	ENST00000552985		F5H6K3	240 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TPCN1-223	ENST00000552985	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
TPCN1-223	ENST00000552985	GRK4	P32298	578 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TPCN1-223	ENST00000552985	KLRC3	Q07444	240 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TPCN1-223	ENST00000552985	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TPCN1-223	ENST00000552985	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TPCN1-223	ENST00000552985	NEDD4	P46934	1319 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF213	O14771	459 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TPCN1-223	ENST00000552985	SGSM2	O43147	1006 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TPCN1-223	ENST00000552985	ELN	P15502	786 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TPCN1-223	ENST00000552985	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TPCN1-223	ENST00000552985	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TPCN1-223	ENST00000552985	GPR142	Q7Z601	462 aa		13.31	□□□□□ -0.28

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