RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550208.1

BRF1-216, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 3

Gene BRF1, Length 1,040 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-216ENST00000550208 USP17L13C9JLJ4 530 aa26.62■■□□□ 1.85
BRF1-216ENST00000550208 USP17L11C9JVI0 530 aa26.62■■□□□ 1.85
BRF1-216ENST00000550208 USP17L18D6R9N7 530 aa26.62■■□□□ 1.85
BRF1-216ENST00000550208 USP17L22D6RA61 530 aa26.62■■□□□ 1.85
BRF1-216ENST00000550208 USP17L17D6RBQ6 530 aa26.62■■□□□ 1.85
BRF1-216ENST00000550208 USP17L19D6RCP7 530 aa26.62■■□□□ 1.85
BRF1-216ENST00000550208 USP17L20D6RJB6 530 aa26.62■■□□□ 1.85
BRF1-216ENST00000550208 TTLL1O95922 423 aa26.62■■□□□ 1.85
BRF1-216ENST00000550208 USP17L24Q0WX57 530 aa26.62■■□□□ 1.85
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BRF1-216ENST00000550208 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
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BRF1-216ENST00000550208 ADGRA2Q96PE1 1338 aa26.62■■□□□ 1.85
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BRF1-216ENST00000550208 NECTIN1Q15223 517 aa26.61■■□□□ 1.85
BRF1-216ENST00000550208 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa26.61■■□□□ 1.85
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BRF1-216ENST00000550208 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
BRF1-216ENST00000550208 KLRC3Q07444 240 aa26.6■■□□□ 1.85
BRF1-216ENST00000550208 KRT23Q9C075 422 aa26.6■■□□□ 1.85
BRF1-216ENST00000550208 GOPCQ9HD26 462 aa26.6■■□□□ 1.85
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BRF1-216ENST00000550208 CREB3L3Q68CJ9 461 aa26.59■■□□□ 1.85
BRF1-216ENST00000550208 STOX1Q6ZVD7 989 aa26.59■■□□□ 1.85
BRF1-216ENST00000550208 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
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BRF1-216ENST00000550208 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa26.59■■□□□ 1.85
BRF1-216ENST00000550208 CNNM2Q9H8M5 875 aa26.59■■□□□ 1.85
BRF1-216ENST00000550208 BCRP11274 1271 aa26.58■■□□□ 1.85
BRF1-216ENST00000550208 NDUFB10O96000 172 aa26.57■■□□□ 1.84
BRF1-216ENST00000550208 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa26.57■■□□□ 1.84
BRF1-216ENST00000550208 WDR46O15213 610 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
BRF1-216ENST00000550208 NT5C2P49902 561 aa26.56■■□□□ 1.84
BRF1-216ENST00000550208 HERVK_113P62684 666 aa26.56■■□□□ 1.84
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BRF1-216ENST00000550208 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
BRF1-216ENST00000550208 RCSD1Q6JBY9 416 aa26.56■■□□□ 1.84
BRF1-216ENST00000550208 POTEEQ6S8J3 1075 aa26.56■■□□□ 1.84
BRF1-216ENST00000550208 CYB5R4Q7L1T6 521 aa26.56■■□□□ 1.84
BRF1-216ENST00000550208 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa26.56■■□□□ 1.84
BRF1-216ENST00000550208 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
BRF1-216ENST00000550208 TANGO6Q9C0B7 1094 aa26.56■■□□□ 1.84
BRF1-216ENST00000550208 MYH4Q9Y623 1939 aa26.56■■□□□ 1.84
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BRF1-216ENST00000550208 CD99L2Q8TCZ2 262 aa26.55■■□□□ 1.84
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BRF1-216ENST00000550208 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
BRF1-216ENST00000550208 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
BRF1-216ENST00000550208 COG2Q14746 738 aa26.54■■□□□ 1.84
BRF1-216ENST00000550208 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa26.54■■□□□ 1.84
BRF1-216ENST00000550208 NCOA7Q8NI08 942 aa26.54■■□□□ 1.84
BRF1-216ENST00000550208 RBPJLQ9UBG7 517 aa26.54■■□□□ 1.84
BRF1-216ENST00000550208 TOP1P11387 765 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
BRF1-216ENST00000550208 IQCA1Q86XH1 822 aa26.53■■□□□ 1.84
BRF1-216ENST00000550208 ERO1AQ96HE7 468 aa26.53■■□□□ 1.84
BRF1-216ENST00000550208 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
BRF1-216ENST00000550208 REC8O95072 547 aa26.52■■□□□ 1.84
BRF1-216ENST00000550208 MCCP23508 829 aa26.52■■□□□ 1.84
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BRF1-216ENST00000550208 RNF20Q5VTR2 975 aa26.51■■□□□ 1.83
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BRF1-216ENST00000550208 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
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BRF1-216ENST00000550208 Q3C1V9 767 aa26.5■■□□□ 1.83
BRF1-216ENST00000550208 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
BRF1-216ENST00000550208 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
BRF1-216ENST00000550208 UBAC1Q9BSL1 405 aa26.5■■□□□ 1.83
BRF1-216ENST00000550208 PAGR1Q9BTK6 254 aa26.5■■□□□ 1.83
BRF1-216ENST00000550208 MORF4L1Q9UBU8 362 aa26.5■■□□□ 1.83
BRF1-216ENST00000550208 TNKSO95271 1327 aa26.49■■□□□ 1.83
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