RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542921.5

JMJD1C-210, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene JMJD1C, Length 8,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-210ENST00000542921 JAK1P23458 1154 aa3.46□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 ACADLP28330 430 aa3.46□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 TRAPPC10P48553 1259 aa3.46□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 RGS7P49802 495 aa3.46□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 PUDPQ08623 228 aa3.46□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 KIF22Q14807 665 aa3.46□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 RPS6KA2Q15349 733 aa3.46□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 CCDC142Q17RM4 750 aa3.46□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 SMYD5Q6GMV2 418 aa3.46□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 ARMC2Q8NEN0 867 aa3.46□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 PDZD8Q8NEN9 1154 aa3.46□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 ERLEC1Q96DZ1 483 aa3.46□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 PACSIN1Q9BY11 444 aa3.46□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 RAB34Q9BZG1 259 aa3.46□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 NBPF3Q9H094 633 aa3.46□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa3.46□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 SPEF1Q9Y4P9 236 aa3.46□□□□□ -1.86
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JMJD1C-210ENST00000542921 ARHGDIAP52565 204 aa3.46□□□□□ -1.86
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JMJD1C-210ENST00000542921 C2CD6Q53TS8 623 aa3.46□□□□□ -1.86
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JMJD1C-210ENST00000542921 SH3GL3Q99963 347 aa3.46□□□□□ -1.86
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JMJD1C-210ENST00000542921 IMPACTQ9P2X3 320 aa3.46□□□□□ -1.86
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JMJD1C-210ENST00000542921 CCDC144AA2RUR9 1427 aa3.46□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 A8MXQ7 604 aa3.46□□□□□ -1.86
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JMJD1C-210ENST00000542921 WASHC5Q12768 1159 aa3.46□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 TRAF1Q13077 416 aa3.46□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP3.46□□□□□ -1.86
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JMJD1C-210ENST00000542921 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 CLHC1Q8NHS4 586 aa3.46□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 BCAS4Q8TDM0 211 aa3.46□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP3.46□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 PHB2Q99623 299 aa3.46□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 MAP3K7O43318 606 aa3.46□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 TLR2O60603 784 aa3.46□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 IFNAR2P48551 515 aa3.46□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 VAV2P52735 878 aa3.46□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 ARHGAP4P98171 946 aa3.46□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP3.46□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa3.46□□□□□ -1.86
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JMJD1C-210ENST00000542921 NSMCE1Q8WV22 266 aa3.46□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 TTC17Q96AE7 1141 aa3.46□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 TRPC7Q9HCX4 862 aa3.46□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 CNGB3Q9NQW8 809 aa3.46□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 GOLGA8MH3BSY2 632 aa3.45□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 TAF4O00268 1085 aa3.45□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 TBC1D4O60343 1298 aa3.45□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
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JMJD1C-210ENST00000542921 PDE6CP51160 858 aa3.45□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 TMBIM6P55061 237 aa3.45□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 KRT85P78386 507 aa3.45□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 GUCY1B3Q02153 619 aa3.45□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP3.45□□□□□ -1.865e-7■■■■□ 24.4
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JMJD1C-210ENST00000542921 TMEM259Q4ZIN3 620 aa3.45□□□□□ -1.86
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JMJD1C-210ENST00000542921 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 OTUD5Q96G74 571 aa3.45□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 PPP1R36Q96LQ0 422 aa3.45□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 CUEDC2Q9H467 287 aa3.45□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 COMMD9Q9P000 198 aa3.45□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 SUN2Q9UH99 717 aa3.45□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 C16orf96A6NNT2 1141 aa3.45□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 E7EVH7 732 aa3.45□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 GJA1P17302 382 aa3.45□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 S100A1P23297 94 aa3.45□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 PDE1BQ01064 536 aa3.45□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 FCHO2Q0JRZ9 810 aa3.45□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 C6orf10Q5SRN2 563 aa3.45□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa3.45□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 TTC23Q5W5X9 447 aa3.45□□□□□ -1.86
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