RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538616.1

CD27-AS1-208, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CD27-AS1, Length 657 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-208ENST00000538616 HOXC6P09630 235 aa23.24■■□□□ 1.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 TJAP1Q5JTD0 557 aa23.24■■□□□ 1.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 C9orf50Q5SZB4 431 aa23.24■■□□□ 1.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa23.23■■□□□ 1.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 USP5P45974 858 aa23.23■■□□□ 1.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 USP17L2Q6R6M4 530 aa23.23■■□□□ 1.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa23.23■■□□□ 1.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 EXOC6Q8TAG9 804 aa23.23■■□□□ 1.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa23.23■■□□□ 1.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 KBTBD13C9JR72 458 aa23.22■■□□□ 1.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 TNFRSF10AO00220 468 aa23.22■■□□□ 1.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 PTPREP23469 700 aa23.22■■□□□ 1.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 FLRT1Q9NZU1 646 aa23.22■■□□□ 1.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 CDH23Q9H251 3354 aa23.21■■□□□ 1.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 WDR78Q5VTH9 848 aa23.21■■□□□ 1.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 BADQ92934 168 aa23.21■■□□□ 1.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 EMILIN3Q9NT22 766 aa23.21■■□□□ 1.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 NAV1Q8NEY1 1877 aa23.2■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 USP17L15C9J2P7 530 aa23.2■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 USP17L13C9JLJ4 530 aa23.2■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 USP17L11C9JVI0 530 aa23.2■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 USP17L18D6R9N7 530 aa23.2■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 USP17L22D6RA61 530 aa23.2■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 USP17L17D6RBQ6 530 aa23.2■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 USP17L19D6RCP7 530 aa23.2■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 USP17L20D6RJB6 530 aa23.2■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 ADD2P35612 726 aa23.2■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 USP17L24Q0WX57 530 aa23.2■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 POTEEQ6S8J3 1075 aa23.2■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 GPATCH3Q96I76 525 aa23.2■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 DNAJC18Q9H819 358 aa23.2■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa23.2■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 MUC3AQ02505 3323 aa23.2■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 LTBP2Q14767 1821 aa23.19■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 FRMPD3Q5JV73 1810 aa23.19■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 JAG1P78504 1218 aa23.19■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 GRB14Q14449 540 aa23.19■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 C1orf53Q5VUE5 145 aa23.19■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 CERS3Q8IU89 383 aa23.19■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 LCORLQ8N3X6 602 aa23.19■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 C12orf42Q96LP6 360 aa23.19■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 CYP2C19P33261 490 aa23.18■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 SNX17Q15036 470 aa23.18■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 ANKRD45Q5TZF3 282 aa23.18■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP23.18■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 ARMT1Q9H993 441 aa23.18■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 CNMDO75829 334 aa23.17■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 GDF11O95390 407 aa23.17■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 HLA-DOAP06340 250 aa23.17■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 CYBAP13498 195 aa23.17■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 LBX2Q6XYB7 198 aa23.17■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 SDR42E1Q8WUS8 393 aa23.17■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 PDLIM7Q9NR12 457 aa23.17■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 MBD4O95243 580 aa23.16■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 USP14P54578 494 aa23.16■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRIM60Q495X7 471 aa23.16■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 OLFML2BQ68BL8 750 aa23.16■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 NPLOC4Q8TAT6 608 aa23.16■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 FEZ1Q99689 392 aa23.16■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 PRKAB2O43741 272 aa23.15■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 STRNO43815 780 aa23.15■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 IGHA2P01877 340 aa23.15■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 EVX2Q03828 476 aa23.15■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa23.15■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 DPP9Q86TI2 863 aa23.15■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRPV1Q8NER1 839 aa23.15■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 PI4K2BQ8TCG2 481 aa23.15■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 TACC3Q9Y6A5 838 aa23.15■■□□□ 1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 SEPT4O43236 478 aa23.14■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 PLCD1P51178 756 aa23.14■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 AAMPQ13685 434 aa23.14■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 UBE3CQ15386 1083 aa23.14■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 RLFQ13129 1914 aa23.14■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 TTC41PQ6P2S7 1318 aa23.13■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRIM43BA6NCK2 446 aa23.13■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 IGHDP01880 384 aa23.13■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 MX1P20591 662 aa23.13■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 KBTBD3Q8NAB2 608 aa23.13■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 MCM9Q9NXL9 1143 aa23.13■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 SLC5A4Q9NY91 659 aa23.13■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 SALL3Q9BXA9 1300 aa23.12■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 GH2P01242 217 aa23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms