RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533451.1

UBASH3B-208, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, human

TSL 2

Gene UBASH3B, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBASH3B-208	ENST00000533451	HAND2	P61296	217 aa		13.63	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		13.63	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	LHX8	Q68G74	356 aa		13.63	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	SKAP1	Q86WV1	359 aa		13.63	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		13.63	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		13.63	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		13.63	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		13.63	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	MYH4	Q9Y623	1939 aa		13.62	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		13.62	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		13.62	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		13.62	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		13.62	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		13.62	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	MGAM	O43451	1857 aa		13.61	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	FOXP2	O15409	715 aa		13.61	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	VCAM1	P19320	739 aa		13.61	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	PSMC4	P43686	418 aa		13.61	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		13.61	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	C17orf99	Q6UX52	265 aa		13.61	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		13.61	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	GOPC	Q9HD26	462 aa		13.61	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		13.61	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451		A0A1W2PRG0	241 aa		13.6	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	TSPY2	A6NKD2	308 aa		13.6	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	USP17L15	C9J2P7	530 aa		13.6	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		13.6	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	USP17L11	C9JVI0	530 aa		13.6	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	USP17L18	D6R9N7	530 aa		13.6	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	USP17L22	D6RA61	530 aa		13.6	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		13.6	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	USP17L19	D6RCP7	530 aa		13.6	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	USP17L20	D6RJB6	530 aa		13.6	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	FGA	P02671	866 aa		13.6	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	TIE1	P35590	1138 aa		13.6	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	FCGRT	P55899	365 aa		13.6	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	HERVK_113	P62684	666 aa		13.6	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	USP17L24	Q0WX57	530 aa		13.6	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	BCR	P11274	1271 aa		13.59	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	TFAP4	Q01664	338 aa		13.59	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	ALX1	Q15699	326 aa		13.59	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	C12orf42	Q96LP6	360 aa		13.59	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	INCENP	Q9NQS7	918 aa		13.59	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		13.59	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	LAMA4	Q16363	1823 aa		13.59	□□□□□ -0.23
UBASH3B-208	ENST00000533451	CHML	P26374	656 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UBASH3B-208	ENST00000533451	HOXD10	P28358	340 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UBASH3B-208	ENST00000533451	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
UBASH3B-208	ENST00000533451	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UBASH3B-208	ENST00000533451	IFFO2	Q5TF58	517 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UBASH3B-208	ENST00000533451	WDR78	Q5VTH9	848 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UBASH3B-208	ENST00000533451	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UBASH3B-208	ENST00000533451	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
UBASH3B-208	ENST00000533451	LPAR1	Q92633	364 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UBASH3B-208	ENST00000533451	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UBASH3B-208	ENST00000533451	TRIM47	Q96LD4	638 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UBASH3B-208	ENST00000533451	VCPKMT	Q9H867	229 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UBASH3B-208	ENST00000533451	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UBASH3B-208	ENST00000533451	MTMR7	Q9Y216	660 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UBASH3B-208	ENST00000533451	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UBASH3B-208	ENST00000533451	TMX2	Q9Y320	296 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UBASH3B-208	ENST00000533451	ZMYM6	O95789	1325 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UBASH3B-208	ENST00000533451	RAD50	Q92878	1312 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UBASH3B-208	ENST00000533451	ZNF213	O14771	459 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBASH3B-208	ENST00000533451	PEX10	O60683	326 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBASH3B-208	ENST00000533451	FLOT1	O75955	427 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBASH3B-208	ENST00000533451	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
UBASH3B-208	ENST00000533451	CAP1	Q01518	475 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBASH3B-208	ENST00000533451	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBASH3B-208	ENST00000533451	RAET1E	Q8TD07	263 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBASH3B-208	ENST00000533451	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
UBASH3B-208	ENST00000533451	COA7	Q96BR5	231 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBASH3B-208	ENST00000533451	CEP95	Q96GE4	821 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBASH3B-208	ENST00000533451	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBASH3B-208	ENST00000533451	STX8	Q9UNK0	236 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBASH3B-208	ENST00000533451	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBASH3B-208	ENST00000533451	MYPN	Q86TC9	1320 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBASH3B-208	ENST00000533451	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
UBASH3B-208	ENST00000533451	NMT2	O60551	498 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBASH3B-208	ENST00000533451	TTLL1	O95922	423 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBASH3B-208	ENST00000533451	GNRH1	P01148	92 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBASH3B-208	ENST00000533451	PLS1	Q14651	629 aa		13.56	□□□□□ -0.24

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