RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527952.1

PTPRJ-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRJ, Length 626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-205ENST00000527952 LBX2Q6XYB7 198 aa29.05■■■□□ 2.24
PTPRJ-205ENST00000527952 TANGO6Q9C0B7 1094 aa29.05■■■□□ 2.24
PTPRJ-205ENST00000527952 PAG1Q9NWQ8 432 aa29.05■■■□□ 2.24
PTPRJ-205ENST00000527952 DDX19BQ9UMR2 479 aa29.05■■■□□ 2.24
PTPRJ-205ENST00000527952 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa29.05■■■□□ 2.24
PTPRJ-205ENST00000527952 CNGA1P29973 690 aa29.04■■■□□ 2.24
PTPRJ-205ENST00000527952 ATP2B2Q01814 1243 aa29.04■■■□□ 2.24
PTPRJ-205ENST00000527952 MFSD14CQ5VZR4 134 aa29.04■■■□□ 2.24
PTPRJ-205ENST00000527952 COL6A1P12109 1028 aa29.03■■■□□ 2.24
PTPRJ-205ENST00000527952 AKR1B1P15121 316 aa29.03■■■□□ 2.24
PTPRJ-205ENST00000527952 CYP2C19P33261 490 aa29.03■■■□□ 2.24
PTPRJ-205ENST00000527952 ADD2P35612 726 aa29.03■■■□□ 2.24
PTPRJ-205ENST00000527952 GRB14Q14449 540 aa29.03■■■□□ 2.24
PTPRJ-205ENST00000527952 LRRC26Q2I0M4 334 aa29.03■■■□□ 2.24
PTPRJ-205ENST00000527952 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
PTPRJ-205ENST00000527952 RLFQ13129 1914 aa29.02■■■□□ 2.24
PTPRJ-205ENST00000527952 RAB11FIP3O75154 756 aa29.02■■■□□ 2.24
PTPRJ-205ENST00000527952 COG2Q14746 738 aa29.02■■■□□ 2.24
PTPRJ-205ENST00000527952 SPICE1Q8N0Z3 855 aa29.02■■■□□ 2.24
PTPRJ-205ENST00000527952 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
PTPRJ-205ENST00000527952 BMP8BP34820 402 aa29.01■■■□□ 2.23
PTPRJ-205ENST00000527952 TRPV1Q8NER1 839 aa29.01■■■□□ 2.23
PTPRJ-205ENST00000527952 LAMA3Q16787 3333 aa29■■■□□ 2.23
PTPRJ-205ENST00000527952 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
PTPRJ-205ENST00000527952 TMEM179Q6ZVK1 233 aa29■■■□□ 2.23
PTPRJ-205ENST00000527952 SIAH1Q8IUQ4 282 aa29■■■□□ 2.23
PTPRJ-205ENST00000527952 MYH7P12883 1935 aa28.99■■■□□ 2.23
PTPRJ-205ENST00000527952 ATP5JP18859 108 aa28.99■■■□□ 2.23
PTPRJ-205ENST00000527952 PLS1Q14651 629 aa28.99■■■□□ 2.23
PTPRJ-205ENST00000527952 DPP9Q86TI2 863 aa28.99■■■□□ 2.23
PTPRJ-205ENST00000527952 HAUS7Q99871 368 aa28.99■■■□□ 2.23
PTPRJ-205ENST00000527952 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
PTPRJ-205ENST00000527952 HOXC10Q9NYD6 342 aa28.99■■■□□ 2.23
PTPRJ-205ENST00000527952 SWAP70Q9UH65 585 aa28.99■■■□□ 2.23
PTPRJ-205ENST00000527952 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
PTPRJ-205ENST00000527952 HOXC6P09630 235 aa28.98■■■□□ 2.23
PTPRJ-205ENST00000527952 ERCC3P19447 782 aa28.98■■■□□ 2.23
PTPRJ-205ENST00000527952 ADORA2AP29274 412 aa28.98■■■□□ 2.23
PTPRJ-205ENST00000527952 C20orf194Q5TEA3 1177 aa28.98■■■□□ 2.23
PTPRJ-205ENST00000527952 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
PTPRJ-205ENST00000527952 SPATC1LQ9H0A9 340 aa28.98■■■□□ 2.23
PTPRJ-205ENST00000527952 USP17L12C9JPN9 530 aa28.97■■■□□ 2.23
PTPRJ-205ENST00000527952 USP17L21D6R901 530 aa28.97■■■□□ 2.23
PTPRJ-205ENST00000527952 CDK8P49336 464 aa28.97■■■□□ 2.23
PTPRJ-205ENST00000527952 ICA1Q05084 483 aa28.97■■■□□ 2.23
PTPRJ-205ENST00000527952 ANO1Q5XXA6 986 aa28.97■■■□□ 2.23
PTPRJ-205ENST00000527952 ATG4CQ96DT6 458 aa28.97■■■□□ 2.23
PTPRJ-205ENST00000527952 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa28.97■■■□□ 2.23
PTPRJ-205ENST00000527952 FLOT1O75955 427 aa28.96■■■□□ 2.23
PTPRJ-205ENST00000527952 DSG3P32926 999 aa28.96■■■□□ 2.23
PTPRJ-205ENST00000527952 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
PTPRJ-205ENST00000527952 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
PTPRJ-205ENST00000527952 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP28.96■■■□□ 2.23
PTPRJ-205ENST00000527952 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa28.96■■■□□ 2.23
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa28.96■■■□□ 2.23
PTPRJ-205ENST00000527952 A0A0G2JMZ2 1700 aa28.95■■■□□ 2.23
PTPRJ-205ENST00000527952 COBLO75128 1261 aa28.95■■■□□ 2.22
PTPRJ-205ENST00000527952 C12orf60Q5U649 245 aa28.95■■■□□ 2.22
PTPRJ-205ENST00000527952 RCAN3Q9UKA8 241 aa28.95■■■□□ 2.22
PTPRJ-205ENST00000527952 Q7L0L9 218 aa28.94■■■□□ 2.22
PTPRJ-205ENST00000527952 NCAPG2Q86XI2 1143 aa28.94■■■□□ 2.22
PTPRJ-205ENST00000527952 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
PTPRJ-205ENST00000527952 VCPKMTQ9H867 229 aa28.94■■■□□ 2.22
PTPRJ-205ENST00000527952 TMX2Q9Y320 296 aa28.94■■■□□ 2.22
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
PTPRJ-205ENST00000527952 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
PTPRJ-205ENST00000527952 PARP14Q460N5 1801 aa28.93■■■□□ 2.22
PTPRJ-205ENST00000527952 CYBAP13498 195 aa28.93■■■□□ 2.22
PTPRJ-205ENST00000527952 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa28.93■■■□□ 2.22
PTPRJ-205ENST00000527952 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
PTPRJ-205ENST00000527952 TDHQ8IZJ6 230 aa28.93■■■□□ 2.22
PTPRJ-205ENST00000527952 STK11IPQ8N1F8 1099 aa28.93■■■□□ 2.22
PTPRJ-205ENST00000527952 LPAR1Q92633 364 aa28.93■■■□□ 2.22
PTPRJ-205ENST00000527952 IGHA2P01877 340 aa28.92■■■□□ 2.22
PTPRJ-205ENST00000527952 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
PTPRJ-205ENST00000527952 EEF2P13639 858 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
PTPRJ-205ENST00000527952 UBE3CQ15386 1083 aa28.92■■■□□ 2.22
PTPRJ-205ENST00000527952 LRRCC1Q9C099 1032 aa28.92■■■□□ 2.22
PTPRJ-205ENST00000527952 RAD21O60216 631 aa28.91■■■□□ 2.22
PTPRJ-205ENST00000527952 CTR9Q6PD62 1173 aa28.91■■■□□ 2.22
PTPRJ-205ENST00000527952 C16orf86Q6ZW13 317 aa28.91■■■□□ 2.22
PTPRJ-205ENST00000527952 AMOTL1Q8IY63 956 aa28.91■■■□□ 2.22
PTPRJ-205ENST00000527952 SHCBP1Q8NEM2 672 aa28.91■■■□□ 2.22
PTPRJ-205ENST00000527952 FBXO28Q9NVF7 368 aa28.91■■■□□ 2.22
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF236Q9UL36 1845 aa28.91■■■□□ 2.22
PTPRJ-205ENST00000527952 STRNO43815 780 aa28.9■■■□□ 2.22
PTPRJ-205ENST00000527952 CCDC17Q96LX7 622 aa28.9■■■□□ 2.22
PTPRJ-205ENST00000527952 DNAH12Q6ZR08 3092 aa28.89■■■□□ 2.22
PTPRJ-205ENST00000527952 MSCO60682 206 aa28.89■■■□□ 2.22
PTPRJ-205ENST00000527952 TMEM132BQ14DG7 1078 aa28.89■■■□□ 2.22
PTPRJ-205ENST00000527952 OLFML2BQ68BL8 750 aa28.89■■■□□ 2.22
PTPRJ-205ENST00000527952 MB21D1Q8N884 522 aa28.89■■■□□ 2.22
PTPRJ-205ENST00000527952 DDRGK1Q96HY6 314 aa28.89■■■□□ 2.22
PTPRJ-205ENST00000527952 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
PTPRJ-205ENST00000527952 SH2D4AQ9H788 454 aa28.89■■■□□ 2.22
PTPRJ-205ENST00000527952 WDR46O15213 610 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
PTPRJ-205ENST00000527952 LRIT3Q3SXY7 679 aa28.88■■■□□ 2.21
PTPRJ-205ENST00000527952 TSHZ3Q63HK5 1081 aa28.88■■■□□ 2.21
PTPRJ-205ENST00000527952 DEFB123Q8N688 67 aa28.88■■■□□ 2.21
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC17A8Q8NDX2 589 aa28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms