RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527193.1

PPP5C-212, Transcript of protein phosphatase 5 catalytic subunit, humanhuman

TSL 3

Gene PPP5C, Length 548 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP5C-212ENST00000527193 AMOTL1Q8IY63 956 aa28.41■■■□□ 2.14
PPP5C-212ENST00000527193 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa28.4■■■□□ 2.14
PPP5C-212ENST00000527193 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
PPP5C-212ENST00000527193 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa28.4■■■□□ 2.14
PPP5C-212ENST00000527193 DDRGK1Q96HY6 314 aa28.4■■■□□ 2.14
PPP5C-212ENST00000527193 TANGO6Q9C0B7 1094 aa28.4■■■□□ 2.14
PPP5C-212ENST00000527193 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa28.4■■■□□ 2.14
PPP5C-212ENST00000527193 SLC15A5A6NIM6 579 aa28.39■■■□□ 2.14
PPP5C-212ENST00000527193 AKR1B1P15121 316 aa28.39■■■□□ 2.14
PPP5C-212ENST00000527193 PTPREP23469 700 aa28.39■■■□□ 2.14
PPP5C-212ENST00000527193 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
PPP5C-212ENST00000527193 COG2Q14746 738 aa28.39■■■□□ 2.14
PPP5C-212ENST00000527193 C12orf60Q5U649 245 aa28.39■■■□□ 2.14
PPP5C-212ENST00000527193 C11orf49Q9H6J7 331 aa28.39■■■□□ 2.14
PPP5C-212ENST00000527193 HOXC10Q9NYD6 342 aa28.39■■■□□ 2.14
PPP5C-212ENST00000527193 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa28.39■■■□□ 2.14
PPP5C-212ENST00000527193 RLFQ13129 1914 aa28.39■■■□□ 2.13
PPP5C-212ENST00000527193 USP17L12C9JPN9 530 aa28.38■■■□□ 2.13
PPP5C-212ENST00000527193 USP17L21D6R901 530 aa28.38■■■□□ 2.13
PPP5C-212ENST00000527193 CDK8P49336 464 aa28.38■■■□□ 2.13
PPP5C-212ENST00000527193 CLEC10AQ8IUN9 316 aa28.38■■■□□ 2.13
PPP5C-212ENST00000527193 PRO3102Q9H379 93 aa28.38■■■□□ 2.13
PPP5C-212ENST00000527193 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa28.38■■■□□ 2.13
PPP5C-212ENST00000527193 SMIM22K7EJ46 135 aa28.37■■■□□ 2.13
PPP5C-212ENST00000527193 ICA1Q05084 483 aa28.37■■■□□ 2.13
PPP5C-212ENST00000527193 CCDC17Q96LX7 622 aa28.37■■■□□ 2.13
PPP5C-212ENST00000527193 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
PPP5C-212ENST00000527193 ECHDC1Q9NTX5 307 aa28.37■■■□□ 2.13
PPP5C-212ENST00000527193 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa28.36■■■□□ 2.13
PPP5C-212ENST00000527193 MFSD14CQ5VZR4 134 aa28.36■■■□□ 2.13
PPP5C-212ENST00000527193 SIAH1Q8IUQ4 282 aa28.36■■■□□ 2.13
PPP5C-212ENST00000527193 C7orf61Q8IZ16 206 aa28.36■■■□□ 2.13
PPP5C-212ENST00000527193 FLRT1Q9NZU1 646 aa28.36■■■□□ 2.13
PPP5C-212ENST00000527193 SZT2Q5T011 3432 aa28.36■■■□□ 2.13
PPP5C-212ENST00000527193 GRB14Q14449 540 aa28.35■■■□□ 2.13
PPP5C-212ENST00000527193 C16orf86Q6ZW13 317 aa28.35■■■□□ 2.13
PPP5C-212ENST00000527193 SPICE1Q8N0Z3 855 aa28.35■■■□□ 2.13
PPP5C-212ENST00000527193 LPAR1Q92633 364 aa28.35■■■□□ 2.13
PPP5C-212ENST00000527193 SH2D4AQ9H788 454 aa28.35■■■□□ 2.13
PPP5C-212ENST00000527193 TMX2Q9Y320 296 aa28.35■■■□□ 2.13
PPP5C-212ENST00000527193 ATP2B2Q01814 1243 aa28.34■■■□□ 2.13
PPP5C-212ENST00000527193 LHX8Q68G74 356 aa28.34■■■□□ 2.13
PPP5C-212ENST00000527193 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
PPP5C-212ENST00000527193 DCTPP1Q9H773 170 aa28.34■■■□□ 2.13
PPP5C-212ENST00000527193 A0A0G2JMZ2 1700 aa28.34■■■□□ 2.13
PPP5C-212ENST00000527193 FRMPD3Q5JV73 1810 aa28.34■■■□□ 2.13
PPP5C-212ENST00000527193 FLOT1O75955 427 aa28.33■■■□□ 2.13
PPP5C-212ENST00000527193 HOXC6P09630 235 aa28.33■■■□□ 2.13
PPP5C-212ENST00000527193 CTR9Q6PD62 1173 aa28.33■■■□□ 2.13
PPP5C-212ENST00000527193 GPATCH3Q96I76 525 aa28.33■■■□□ 2.13
PPP5C-212ENST00000527193 SPATC1LQ9H0A9 340 aa28.33■■■□□ 2.13
PPP5C-212ENST00000527193 VCPKMTQ9H867 229 aa28.33■■■□□ 2.13
PPP5C-212ENST00000527193 STAP2Q9UGK3 403 aa28.33■■■□□ 2.13
PPP5C-212ENST00000527193 DSG3P32926 999 aa28.32■■■□□ 2.12
PPP5C-212ENST00000527193 MB21D1Q8N884 522 aa28.32■■■□□ 2.12
PPP5C-212ENST00000527193 NPLOC4Q8TAT6 608 aa28.32■■■□□ 2.12
PPP5C-212ENST00000527193 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
PPP5C-212ENST00000527193 PARP14Q460N5 1801 aa28.32■■■□□ 2.12
PPP5C-212ENST00000527193 PLS1Q14651 629 aa28.31■■■□□ 2.12
PPP5C-212ENST00000527193 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
PPP5C-212ENST00000527193 PFASO15067 1338 aa28.31■■■□□ 2.12
PPP5C-212ENST00000527193 STRNO43815 780 aa28.3■■■□□ 2.12
PPP5C-212ENST00000527193 ERCC3P19447 782 aa28.3■■■□□ 2.12
PPP5C-212ENST00000527193 TSHZ3Q63HK5 1081 aa28.3■■■□□ 2.12
PPP5C-212ENST00000527193 DPP9Q86TI2 863 aa28.3■■■□□ 2.12
PPP5C-212ENST00000527193 KBTBD3Q8NAB2 608 aa28.3■■■□□ 2.12
PPP5C-212ENST00000527193 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
PPP5C-212ENST00000527193 KANSL2Q9H9L4 492 aa28.3■■■□□ 2.12
PPP5C-212ENST00000527193 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
PPP5C-212ENST00000527193 ZNF236Q9UL36 1845 aa28.29■■■□□ 2.12
PPP5C-212ENST00000527193 A0A1W2PPC1 479 aa28.29■■■□□ 2.12
PPP5C-212ENST00000527193 WDR46O15213 610 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
PPP5C-212ENST00000527193 EEF2P13639 858 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
PPP5C-212ENST00000527193 ADORA2AP29274 412 aa28.29■■■□□ 2.12
PPP5C-212ENST00000527193 CNGA1P29973 690 aa28.29■■■□□ 2.12
PPP5C-212ENST00000527193 CYP2C19P33261 490 aa28.29■■■□□ 2.12
PPP5C-212ENST00000527193 SHCBP1Q8NEM2 672 aa28.29■■■□□ 2.12
PPP5C-212ENST00000527193 ATG4CQ96DT6 458 aa28.29■■■□□ 2.12
PPP5C-212ENST00000527193 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
PPP5C-212ENST00000527193 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
PPP5C-212ENST00000527193 COL6A1P12109 1028 aa28.28■■■□□ 2.12
PPP5C-212ENST00000527193 SYN1P17600 705 aa28.27■■■□□ 2.12
PPP5C-212ENST00000527193 NCAPG2Q86XI2 1143 aa28.27■■■□□ 2.12
PPP5C-212ENST00000527193 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
PPP5C-212ENST00000527193 GSG1L2A8MUP6 293 aa28.26■■■□□ 2.11
PPP5C-212ENST00000527193 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
PPP5C-212ENST00000527193 RAD21O60216 631 aa28.26■■■□□ 2.11
PPP5C-212ENST00000527193 APPBP2Q92624 585 aa28.26■■■□□ 2.11
PPP5C-212ENST00000527193 OSBP2Q969R2 916 aa28.26■■■□□ 2.11
PPP5C-212ENST00000527193 MROH8Q9H579 483 aa28.26■■■□□ 2.11
PPP5C-212ENST00000527193 GOPCQ9HD26 462 aa28.26■■■□□ 2.11
PPP5C-212ENST00000527193 MSCO60682 206 aa28.25■■■□□ 2.11
PPP5C-212ENST00000527193 SBK1Q52WX2 424 aa28.25■■■□□ 2.11
PPP5C-212ENST00000527193 OLFML2BQ68BL8 750 aa28.25■■■□□ 2.11
PPP5C-212ENST00000527193 STK11IPQ8N1F8 1099 aa28.25■■■□□ 2.11
PPP5C-212ENST00000527193 TRPV1Q8NER1 839 aa28.25■■■□□ 2.11
PPP5C-212ENST00000527193 GDF15Q99988 308 aa28.25■■■□□ 2.11
PPP5C-212ENST00000527193 LAMA3Q16787 3333 aa28.25■■■□□ 2.11
PPP5C-212ENST00000527193 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
PPP5C-212ENST00000527193 MINDY4BA8MYZ0 360 aa28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.2 ms