RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525524.1

EDRF1-211, Transcript of erythroid differentiation regulatory factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene EDRF1, Length 462 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1-211ENST00000525524 CTNND2Q9UQB3 1225 aa6.07□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 SLIT1O75093 1534 aa6.07□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa6.07□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 ARHGAP23Q9P227 1491 aa6.07□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 NCANO14594 1321 aa6.06□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 PRRG2O14669 202 aa6.06□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 SERPINB4P48594 390 aa6.06□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 SIAH1Q8IUQ4 282 aa6.06□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 PRDM7Q9NQW5 492 aa6.06□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa6.06□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa6.06□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 MROH1Q8NDA8 1641 aa6.06□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 MSH6P52701 1360 aa6.06□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa6.05□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa6.05□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 FANCGO15287 622 aa6.05□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 KCNA6P17658 529 aa6.05□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 ARHGAP4P98171 946 aa6.05□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 PDE4CQ08493 712 aa6.05□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 LRRC14Q15048 493 aa6.05□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 LILRA6Q6PI73 481 aa6.05□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 NPAS4Q8IUM7 802 aa6.05□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 SPACA3Q8IXA5 215 aa6.05□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 GPBAR1Q8TDU6 330 aa6.05□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 CEP44Q9C0F1 390 aa6.05□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 U3KQE9 123 aa6.05□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa6.05□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 GPR182O15218 404 aa6.04□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 TSPY4P0CV99 314 aa6.04□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 TSPY10P0CW01 314 aa6.04□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 RAC2P15153 192 aa6.04□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 ELMO3Q96BJ8 720 aa6.04□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 BCO2Q9BYV7 579 aa6.04□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP6.04□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 ARHGEF5Q12774 1597 aa6.04□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 TMEM2Q9UHN6 1383 aa6.04□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 SHPRHQ149N8 1683 aa6.04□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 MYO5BQ9ULV0 1848 aa6.04□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa6.03□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 CEP162Q5TB80 1403 aa6.03□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 TRIM37O94972 964 aa6.03□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 TMEM253P0C7T8 217 aa6.03□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 CFPP27918 469 aa6.03□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 PPM1JQ5JR12 505 aa6.03□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 SCARA3Q6AZY7 606 aa6.03□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 ZNF507Q8TCN5 953 aa6.03□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 TET3O43151 1660 aa6.03□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.44
EDRF1-211ENST00000525524 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa6.02□□□□□ -1.45
EDRF1-211ENST00000525524 NWD1Q149M9 1564 aa6.02□□□□□ -1.45
EDRF1-211ENST00000525524 CARNS1A5YM72 827 aa6.02□□□□□ -1.45
EDRF1-211ENST00000525524 B8ZZF3 427 aa6.02□□□□□ -1.45
EDRF1-211ENST00000525524 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
EDRF1-211ENST00000525524 GSTT1P30711 240 aa6.02□□□□□ -1.45
EDRF1-211ENST00000525524 GDNFP39905 211 aa6.02□□□□□ -1.45
EDRF1-211ENST00000525524 NKPD1Q17RQ9 610 aa6.02□□□□□ -1.45
EDRF1-211ENST00000525524 C14orf37Q86TY3 774 aa6.02□□□□□ -1.45
EDRF1-211ENST00000525524 RBCK1Q9BYM8 510 aa6.02□□□□□ -1.45
EDRF1-211ENST00000525524 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
EDRF1-211ENST00000525524 CSADQ9Y600 493 aa6.02□□□□□ -1.45
EDRF1-211ENST00000525524 EFCAB6Q5THR3 1501 aa6.02□□□□□ -1.45
EDRF1-211ENST00000525524 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
EDRF1-211ENST00000525524 AFF2P51816 1311 aa6.01□□□□□ -1.45
EDRF1-211ENST00000525524 DCDC2CA8MYV0 355 aa6.01□□□□□ -1.45
EDRF1-211ENST00000525524 LRIG2O94898 1065 aa6.01□□□□□ -1.45
EDRF1-211ENST00000525524 IDI1Q13907 227 aa6.01□□□□□ -1.45
EDRF1-211ENST00000525524 SFRP5Q5T4F7 317 aa6.01□□□□□ -1.45
EDRF1-211ENST00000525524 LLGL2Q6P1M3 1020 aa6.01□□□□□ -1.45
EDRF1-211ENST00000525524 PRR23BQ6ZRT6 265 aa6.01□□□□□ -1.45
EDRF1-211ENST00000525524 FAM214BQ7L5A3 538 aa6.01□□□□□ -1.45
EDRF1-211ENST00000525524 PCDHA4Q9UN74 947 aa6.01□□□□□ -1.45
EDRF1-211ENST00000525524 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
EDRF1-211ENST00000525524 MAST1Q9Y2H9 1570 aa6.01□□□□□ -1.45
EDRF1-211ENST00000525524 RGS12O14924 1447 aa6□□□□□ -1.45
EDRF1-211ENST00000525524 FGD6Q6ZV73 1430 aa6□□□□□ -1.45
EDRF1-211ENST00000525524 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
EDRF1-211ENST00000525524 TCAF2A6NFQ2 919 aa6□□□□□ -1.45
EDRF1-211ENST00000525524 CYP7A1P22680 504 aa6□□□□□ -1.45
EDRF1-211ENST00000525524 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa6□□□□□ -1.45
EDRF1-211ENST00000525524 ECM1Q16610 540 aa6□□□□□ -1.45
EDRF1-211ENST00000525524 ARMCX6Q7L4S7 300 aa6□□□□□ -1.45
EDRF1-211ENST00000525524 C12orf40Q86WS4 652 aa6□□□□□ -1.45
EDRF1-211ENST00000525524 MFSD4AQ8N468 514 aa6□□□□□ -1.45
EDRF1-211ENST00000525524 COX4I2Q96KJ9 171 aa6□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.4 ms