RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524770.5

GMDS-AS1-203, humanhuman

TSL 3

Gene GMDS-AS1, Length 565 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-203ENST00000524770 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
GMDS-AS1-203ENST00000524770 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
GMDS-AS1-203ENST00000524770 TOMM22Q9NS69 142 aa23.71■■□□□ 1.39
GMDS-AS1-203ENST00000524770 USP17L15C9J2P7 530 aa23.7■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 USP17L13C9JLJ4 530 aa23.7■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 USP17L11C9JVI0 530 aa23.7■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 USP17L18D6R9N7 530 aa23.7■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 USP17L22D6RA61 530 aa23.7■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 USP17L17D6RBQ6 530 aa23.7■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 USP17L19D6RCP7 530 aa23.7■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 USP17L20D6RJB6 530 aa23.7■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 TTLL1O95922 423 aa23.7■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 USP17L24Q0WX57 530 aa23.7■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 GOPCQ9HD26 462 aa23.7■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa23.7■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 DOCK3Q8IZD9 2030 aa23.69■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 HERVK_113P62684 666 aa23.69■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 FAM110CQ1W6H9 321 aa23.69■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 SPICE1Q8N0Z3 855 aa23.69■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 IL17RBQ9NRM6 502 aa23.69■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 WDR46O15213 610 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 NMT2O60551 498 aa23.68■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 CASC1Q6TDU7 716 aa23.68■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa23.68■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa23.68■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 NKX2-3Q8TAU0 364 aa23.68■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 MAP4K1Q92918 833 aa23.68■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 MKL1Q969V6 931 aa23.68■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 CLIP2Q9UDT6 1046 aa23.68■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 NT5C2P49902 561 aa23.67■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa23.67■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa23.67■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 OTOP1Q7RTM1 612 aa23.67■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 TNS4Q8IZW8 715 aa23.67■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 TANGO6Q9C0B7 1094 aa23.67■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa23.67■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 HTTP42858 3142 aa23.66■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 CYP21A2P08686 494 aa23.66■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 NOVP48745 357 aa23.66■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 ESR2Q92731 530 aa23.66■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 MCOLN1Q9GZU1 580 aa23.66■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 MORF4L1Q9UBU8 362 aa23.66■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 NDUFB10O96000 172 aa23.65■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 CTGFP29279 349 aa23.65■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 KIF22Q14807 665 aa23.65■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 POTEEQ6S8J3 1075 aa23.65■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 LBX2Q6XYB7 198 aa23.65■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa23.65■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 ANO2Q9NQ90 1003 aa23.65■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa23.65■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 STX8Q9UNK0 236 aa23.65■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 TRIM17Q9Y577 477 aa23.65■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 PLXNB2O15031 1838 aa23.64■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 B4E1Z4 1266 aa23.64■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-203ENST00000524770 F5H6K3 240 aa23.64■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-203ENST00000524770 RAD21O60216 631 aa23.64■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-203ENST00000524770 KLRC3Q07444 240 aa23.64■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-203ENST00000524770 CNNM2Q9H8M5 875 aa23.64■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-203ENST00000524770 EFCC1Q9HA90 598 aa23.64■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-203ENST00000524770 TXNRD2Q9NNW7 524 aa23.64■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-203ENST00000524770 KDM4AO75164 1064 aa23.63■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-203ENST00000524770 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-203ENST00000524770 FAM83BQ5T0W9 1011 aa23.63■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-203ENST00000524770 TRIM47Q96LD4 638 aa23.63■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-203ENST00000524770 KRT23Q9C075 422 aa23.63■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-203ENST00000524770 RBPJLQ9UBG7 517 aa23.63■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-203ENST00000524770 TAF6LQ9Y6J9 622 aa23.63■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-203ENST00000524770 MYPNQ86TC9 1320 aa23.62■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-203ENST00000524770 PEX10O60683 326 aa23.62■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-203ENST00000524770 FLOT1O75955 427 aa23.62■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-203ENST00000524770 PSMC4P43686 418 aa23.62■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-203ENST00000524770 COG2Q14746 738 aa23.62■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-203ENST00000524770 ARHGEF6Q15052 776 aa23.62■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-203ENST00000524770 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-203ENST00000524770 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-203ENST00000524770 FCGRTP55899 365 aa23.61■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-203ENST00000524770 RCSD1Q6JBY9 416 aa23.61■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-203ENST00000524770 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-203ENST00000524770 PAGR1Q9BTK6 254 aa23.61■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-203ENST00000524770 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa23.61■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-203ENST00000524770 CNMDO75829 334 aa23.6■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-203ENST00000524770 GNRH1P01148 92 aa23.6■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-203ENST00000524770 ERVK-9P63128 1117 aa23.6■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-203ENST00000524770 ERVK-24P63145 666 aa23.6■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-203ENST00000524770 STOX1Q6ZVD7 989 aa23.6■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-203ENST00000524770 FBXO28Q9NVF7 368 aa23.6■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-203ENST00000524770 TOP1P11387 765 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-203ENST00000524770 DSG3P32926 999 aa23.59■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-203ENST00000524770 SLFN13Q68D06 897 aa23.59■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-203ENST00000524770 IQCA1Q86XH1 822 aa23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms