RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524131.5

MEG3-223, Transcript of maternally expressed 3, human

TSL 5 BASIC

Gene MEG3, Length 721 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEG3-223	ENST00000524131	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	PI16	Q6UXB8	463 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	RUFY3	Q7L099	469 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	TRIB2	Q92519	343 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	13.76	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	RLF	Q13129	1914 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	PFAS	O15067	1338 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	CAP2	P40123	477 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	NUCB2	P80303	420 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	GPR153	Q6NV75	609 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	TMX3	Q96JJ7	454 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	CDH23	Q9H251	3354 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	PARP14	Q460N5	1801 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131		A0A0G2JMZ2	1700 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	PDE6A	P16499	860 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	ALX1	Q15699	326 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	OSBP2	Q969R2	916 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	NBPF3	Q9H094	633 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	MYH8	P13535	1937 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	USP17L5	A8MUK1	530 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131		M0R2C6	588 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	GNAT2	P19087	354 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	PTMS	P20962	102 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	13.73	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	DNAJC18	Q9H819	358 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	GPAA1	O43292	621 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	PEX10	O60683	326 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	SYN1	P17600	705 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	RPS6KB1	P23443	525 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	JAG1	P78504	1218 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	MTMR2	Q13614	643 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131		Q7L0L9	218 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	TDH	Q8IZJ6	230 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	WDR18	Q9BV38	432 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	LDHC	P07864	332 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	CYP21A2	P08686	494 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	COL6A1	P12109	1028 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	AK2	P54819	239 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	GSTO1	P78417	241 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	NFKBIB	Q15653	356 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	FBXL16	Q8N461	479 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	DEFB123	Q8N688	67 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	USP6NL	Q92738	828 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	NEK1	Q96PY6	1258 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
MEG3-223	ENST00000524131	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
MEG3-223	ENST00000524131	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
MEG3-223	ENST00000524131	CYP2B6	P20813	491 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MEG3-223	ENST00000524131	BACE1	P56817	501 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MEG3-223	ENST00000524131	HERVK_113	P62684	666 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MEG3-223	ENST00000524131	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MEG3-223	ENST00000524131	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MEG3-223	ENST00000524131	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
MEG3-223	ENST00000524131	TEX11	Q8IYF3	940 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MEG3-223	ENST00000524131	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
MEG3-223	ENST00000524131	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MEG3-223	ENST00000524131	GBP4	Q96PP9	640 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MEG3-223	ENST00000524131	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MEG3-223	ENST00000524131	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MEG3-223	ENST00000524131	FLT1	P17948	1338 aa		13.69	□□□□□ -0.22
MEG3-223	ENST00000524131	ASNS	P08243	561 aa		13.69	□□□□□ -0.22

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