RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522928.1

CLVS1-209, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-209ENST00000522928 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CLVS1-209ENST00000522928 ETV3P41162 512 aa6.29□□□□□ -1.4
CLVS1-209ENST00000522928 GAB4Q2WGN9 574 aa6.29□□□□□ -1.4
CLVS1-209ENST00000522928 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CLVS1-209ENST00000522928 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CLVS1-209ENST00000522928 CBLL1Q75N03 491 aa6.29□□□□□ -1.4
CLVS1-209ENST00000522928 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CLVS1-209ENST00000522928 RNF141Q8WVD5 230 aa6.29□□□□□ -1.4
CLVS1-209ENST00000522928 SHDQ96IW2 340 aa6.29□□□□□ -1.4
CLVS1-209ENST00000522928 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.29□□□□□ -1.4
CLVS1-209ENST00000522928 ADGRE2Q9UHX3 823 aa6.29□□□□□ -1.4
CLVS1-209ENST00000522928 SLC5A6Q9Y289 635 aa6.29□□□□□ -1.4
CLVS1-209ENST00000522928 SHISA3A0PJX4 238 aa6.28□□□□□ -1.4
CLVS1-209ENST00000522928 GNAT3A8MTJ3 354 aa6.28□□□□□ -1.4
CLVS1-209ENST00000522928 E9PSI1 815 aa6.28□□□□□ -1.4
CLVS1-209ENST00000522928 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP6.28□□□□□ -1.4
CLVS1-209ENST00000522928 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CLVS1-209ENST00000522928 KIR3DL1P43629 444 aa6.28□□□□□ -1.4
CLVS1-209ENST00000522928 GIPRP48546 466 aa6.28□□□□□ -1.4
CLVS1-209ENST00000522928 NASPP49321 788 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CLVS1-209ENST00000522928 CLCN7P51798 805 aa6.28□□□□□ -1.4
CLVS1-209ENST00000522928 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CLVS1-209ENST00000522928 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CLVS1-209ENST00000522928 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CLVS1-209ENST00000522928 CDKAL1Q5VV42 579 aa6.28□□□□□ -1.4
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CLVS1-209ENST00000522928 PHACTR4Q8IZ21 702 aa6.28□□□□□ -1.4
CLVS1-209ENST00000522928 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CLVS1-209ENST00000522928 FAM169BQ8N8A8 192 aa6.28□□□□□ -1.4
CLVS1-209ENST00000522928 MISP3Q96FF7 219 aa6.28□□□□□ -1.4
CLVS1-209ENST00000522928 HRASLS5Q96KN8 279 aa6.28□□□□□ -1.4
CLVS1-209ENST00000522928 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CLVS1-209ENST00000522928 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa6.28□□□□□ -1.4
CLVS1-209ENST00000522928 LTBP3Q9NS15 1303 aa6.27□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 H3BS24 57 aa6.27□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 RAG1P15918 1043 aa6.27□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 FUT4P22083 530 aa6.27□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 FLCNQ8NFG4 579 aa6.27□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 SEC16BQ96JE7 1060 aa6.27□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 COX4I2Q96KJ9 171 aa6.27□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 CCSER2Q9H7U1 834 aa6.27□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa6.27□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 SHOXO15266 292 aa6.26□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 ESR1P03372 595 aa6.26□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 CYP7A1P22680 504 aa6.26□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 CCNFP41002 786 aa6.26□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 NBPF9Q3BBW0 867 aa6.26□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 PPFIBP1Q86W92 1011 aa6.26□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 STK11IPQ8N1F8 1099 aa6.26□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 SPATA32Q96LK8 384 aa6.26□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 SLC6A18Q96N87 628 aa6.26□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 FERD3LQ96RJ6 166 aa6.26□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 GPR62Q9BZJ7 368 aa6.26□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 PRDM7Q9NQW5 492 aa6.26□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 C9IYK1 514 aa6.25□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 IMPDH2P12268 514 aa6.25□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 GBP1P32455 592 aa6.25□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 MLECQ14165 292 aa6.25□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 UNC5AQ6ZN44 842 aa6.25□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 THAP5Q7Z6K1 395 aa6.25□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 UBE2FQ969M7 185 aa6.25□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 TM9SF2Q99805 663 aa6.25□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 ASPNQ9BXN1 380 aa6.25□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.25□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 A0A1W2PQH9 124 aa6.24□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 FAM86C2PA6NEL3 165 aa6.24□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 FGRP09769 529 aa6.24□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa6.24□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 ASB11Q8WXH4 323 aa6.24□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP6.24□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.24□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 ZSWIM5Q9P217 1185 aa6.24□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF281Q9Y2X9 895 aa6.24□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 GUCY2CP25092 1073 aa6.23□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 FZD5Q13467 585 aa6.23□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF792Q3KQV3 632 aa6.23□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 FBXW10Q5XX13 1052 aa6.23□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 MCTP1Q6DN14 999 aa6.23□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 TMC3Q7Z5M5 1100 aa6.23□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 TTC6Q86TZ1 520 aa6.23□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 TP53INP2Q8IXH6 220 aa6.23□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 GMLQ99445 158 aa6.23□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 CAPN10Q9HC96 672 aa6.23□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 MINPP1Q9UNW1 487 aa6.23□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 PMS1P54277 932 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 EIF6P56537 245 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 IKZF1Q13422 519 aa6.22□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 MCF2L2Q86YR7 1114 aa6.22□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 FMNL2Q96PY5 1086 aa6.22□□□□□ -1.41
CLVS1-209ENST00000522928 HDAC8Q9BY41 377 aa6.22□□□□□ -1.41
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