RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521467.5

MSC-AS1-207, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene MSC-AS1, Length 485 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-207ENST00000521467 HLA-DOAP06340 250 aa10□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 SCRN1Q12765 414 aa10□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 SNAPC2Q13487 334 aa10□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 MCTP1Q6DN14 999 aa10□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 IFNL1Q8IU54 200 aa10□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 SCYL3Q8IZE3 742 aa10□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa10□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 NBPF3Q9H094 633 aa10□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 INCENPQ9NQS7 918 aa10□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 PICK1Q9NRD5 415 aa10□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa10□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 GOLGA8BA8MQT2 603 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 ORC4O43929 436 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 TRAK2O60296 914 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 INPP5BP32019 993 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 CAP2P40123 477 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 ANTXR2P58335 489 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 PPP2R5BQ15173 497 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 C12orf60Q5U649 245 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 TRIM34Q9BYJ4 488 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 EHD4Q9H223 541 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 KCNH4Q9UQ05 1017 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 FLT1P17948 1338 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 NEDD4P46934 1319 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 TSPY2A6NKD2 308 aa9.98□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 IRF6O14896 467 aa9.98□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 F13A1P00488 732 aa9.98□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 ASNSP08243 561 aa9.98□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 FGRP09769 529 aa9.98□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 CALM1P0DP23 149 aa9.98□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 CALM2P0DP24 149 aa9.98□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 CALM3P0DP25 149 aa9.98□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 PTPRAP18433 802 aa9.98□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 GJA5P36382 358 aa9.98□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 CATIPQ7Z7H3 387 aa9.98□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 SGMS1Q86VZ5 419 aa9.98□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa9.98□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 WASF1Q92558 559 aa9.98□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 DDX11Q96FC9 970 aa9.98□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 OTUD5Q96G74 571 aa9.98□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 SERPINB13Q9UIV8 391 aa9.98□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 BRPF3Q9ULD4 1205 aa9.98□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 ZDHHC9Q9Y397 364 aa9.98□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa9.98□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa9.97□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa9.97□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 PTPDC1A2A3K4 754 aa9.97□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 GOLGA8AA7E2F4 631 aa9.97□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 USP17L5A8MUK1 530 aa9.97□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 PKP1Q13835 747 aa9.97□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 TRIM29Q14134 588 aa9.97□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 ARHGEF6Q15052 776 aa9.97□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 CCL15Q16663 113 aa9.97□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 TATDN1Q6P1N9 297 aa9.97□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 TRIM22Q8IYM9 498 aa9.97□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 PTPN18Q99952 460 aa9.97□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa9.97□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 LY9Q9HBG7 655 aa9.97□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 AS3MTQ9HBK9 375 aa9.97□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa9.97□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 MTMR6Q9Y217 621 aa9.97□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 ZHX2Q9Y6X8 837 aa9.97□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 MYH1P12882 1939 aa9.97□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 PCNTO95613 3336 aa9.96□□□□□ -0.81
MSC-AS1-207ENST00000521467 C19orf81C9J6K1 198 aa9.96□□□□□ -0.82
MSC-AS1-207ENST00000521467 GPR25O00155 361 aa9.96□□□□□ -0.82
MSC-AS1-207ENST00000521467 JAK2O60674 1132 aa9.96□□□□□ -0.82
MSC-AS1-207ENST00000521467 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
MSC-AS1-207ENST00000521467 PRDM1O75626 825 aa9.96□□□□□ -0.82
MSC-AS1-207ENST00000521467 TBC1D8O95759 1140 aa9.96□□□□□ -0.82
MSC-AS1-207ENST00000521467 CYP2D6P10635 497 aa9.96□□□□□ -0.82
MSC-AS1-207ENST00000521467 RCAN1P53805 252 aa9.96□□□□□ -0.82
MSC-AS1-207ENST00000521467 TFAP4Q01664 338 aa9.96□□□□□ -0.82
MSC-AS1-207ENST00000521467 ST3GAL1Q11201 340 aa9.96□□□□□ -0.82
MSC-AS1-207ENST00000521467 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
MSC-AS1-207ENST00000521467 RTN1Q16799 776 aa9.96□□□□□ -0.82
MSC-AS1-207ENST00000521467 APOA5Q6Q788 366 aa9.96□□□□□ -0.82
MSC-AS1-207ENST00000521467 ANKRD23Q86SG2 305 aa9.96□□□□□ -0.82
MSC-AS1-207ENST00000521467 RGS22Q8NE09 1264 aa9.96□□□□□ -0.82
MSC-AS1-207ENST00000521467 NUP133Q8WUM0 1156 aa9.96□□□□□ -0.82
MSC-AS1-207ENST00000521467 BRI3BPQ8WY22 251 aa9.96□□□□□ -0.82
MSC-AS1-207ENST00000521467 WDR18Q9BV38 432 aa9.96□□□□□ -0.82
MSC-AS1-207ENST00000521467 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms