RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517979.1

CCDC25-202, Transcript of coiled-coil domain containing 25, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCDC25, Length 877 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC25-202ENST00000517979 USP17L20D6RJB6 530 aa16.43■□□□□ 0.22
CCDC25-202ENST00000517979 M0R2C6 588 aa16.43■□□□□ 0.22
CCDC25-202ENST00000517979 ADCY3O60266 1144 aa16.43■□□□□ 0.22
CCDC25-202ENST00000517979 AKR1B1P15121 316 aa16.43■□□□□ 0.22
CCDC25-202ENST00000517979 UBXN2AP68543 259 aa16.43■□□□□ 0.22
CCDC25-202ENST00000517979 USP17L24Q0WX57 530 aa16.43■□□□□ 0.22
CCDC25-202ENST00000517979 MTFR1Q15390 333 aa16.43■□□□□ 0.22
CCDC25-202ENST00000517979 HS6ST3Q8IZP7 471 aa16.43■□□□□ 0.22
CCDC25-202ENST00000517979 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa16.43■□□□□ 0.22
CCDC25-202ENST00000517979 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
CCDC25-202ENST00000517979 PAGR1Q9BTK6 254 aa16.43■□□□□ 0.22
CCDC25-202ENST00000517979 TXNRD2Q9NNW7 524 aa16.43■□□□□ 0.22
CCDC25-202ENST00000517979 STK24Q9Y6E0 443 aa16.43■□□□□ 0.22
CCDC25-202ENST00000517979 SALL3Q9BXA9 1300 aa16.43■□□□□ 0.22
CCDC25-202ENST00000517979 GSG1L2A8MUP6 293 aa16.42■□□□□ 0.22
CCDC25-202ENST00000517979 PEX10O60683 326 aa16.42■□□□□ 0.22
CCDC25-202ENST00000517979 ELNP15502 786 aa16.42■□□□□ 0.22
CCDC25-202ENST00000517979 GNAT2P19087 354 aa16.42■□□□□ 0.22
CCDC25-202ENST00000517979 TDO2P48775 406 aa16.42■□□□□ 0.22
CCDC25-202ENST00000517979 ICA1Q05084 483 aa16.42■□□□□ 0.22
CCDC25-202ENST00000517979 IRF5Q13568 498 aa16.42■□□□□ 0.22
CCDC25-202ENST00000517979 GIMAP6Q6P9H5 292 aa16.42■□□□□ 0.22
CCDC25-202ENST00000517979 EXOC6Q8TAG9 804 aa16.42■□□□□ 0.22
CCDC25-202ENST00000517979 CCDC17Q96LX7 622 aa16.42■□□□□ 0.22
CCDC25-202ENST00000517979 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
CCDC25-202ENST00000517979 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
CCDC25-202ENST00000517979 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa16.42■□□□□ 0.22
CCDC25-202ENST00000517979 DOCK3Q8IZD9 2030 aa16.41■□□□□ 0.22
CCDC25-202ENST00000517979 A0A1W2PRG0 241 aa16.41■□□□□ 0.22
CCDC25-202ENST00000517979 MINDY4BA8MYZ0 360 aa16.41■□□□□ 0.22
CCDC25-202ENST00000517979 APPP05067 770 aa16.41■□□□□ 0.22
CCDC25-202ENST00000517979 CCL5P13501 91 aa16.41■□□□□ 0.22
CCDC25-202ENST00000517979 ERVK-9P63128 1117 aa16.41■□□□□ 0.22
CCDC25-202ENST00000517979 ERVK-24P63145 666 aa16.41■□□□□ 0.22
CCDC25-202ENST00000517979 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa16.41■□□□□ 0.22
CCDC25-202ENST00000517979 CLEC10AQ8IUN9 316 aa16.41■□□□□ 0.22
CCDC25-202ENST00000517979 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
CCDC25-202ENST00000517979 RBPJLQ9UBG7 517 aa16.41■□□□□ 0.22
CCDC25-202ENST00000517979 INHAP05111 366 aa16.4■□□□□ 0.22
CCDC25-202ENST00000517979 PDE1AP54750 535 aa16.4■□□□□ 0.22
CCDC25-202ENST00000517979 SBK1Q52WX2 424 aa16.4■□□□□ 0.22
CCDC25-202ENST00000517979 STK11IPQ8N1F8 1099 aa16.4■□□□□ 0.22
CCDC25-202ENST00000517979 PXYLP1Q8TE99 480 aa16.4■□□□□ 0.22
CCDC25-202ENST00000517979 TANGO6Q9C0B7 1094 aa16.4■□□□□ 0.22
CCDC25-202ENST00000517979 LNPKQ9C0E8 428 aa16.4■□□□□ 0.22
CCDC25-202ENST00000517979 SH2D4AQ9H788 454 aa16.4■□□□□ 0.22
CCDC25-202ENST00000517979 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
CCDC25-202ENST00000517979 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
CCDC25-202ENST00000517979 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
CCDC25-202ENST00000517979 MAPK4P31152 587 aa16.39■□□□□ 0.21
CCDC25-202ENST00000517979 ATP2B2Q01814 1243 aa16.39■□□□□ 0.21
CCDC25-202ENST00000517979 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa16.39■□□□□ 0.21
CCDC25-202ENST00000517979 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa16.39■□□□□ 0.21
CCDC25-202ENST00000517979 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
CCDC25-202ENST00000517979 NACAP1Q9BZK3 213 aa16.39■□□□□ 0.21
CCDC25-202ENST00000517979 RNF208Q9H0X6 261 aa16.39■□□□□ 0.21
CCDC25-202ENST00000517979 MKNK2Q9HBH9 465 aa16.39■□□□□ 0.21
CCDC25-202ENST00000517979 STAP2Q9UGK3 403 aa16.39■□□□□ 0.21
CCDC25-202ENST00000517979 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa16.39■□□□□ 0.21
CCDC25-202ENST00000517979 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
CCDC25-202ENST00000517979 ROBO3Q96MS0 1386 aa16.38■□□□□ 0.21
CCDC25-202ENST00000517979 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
CCDC25-202ENST00000517979 Q3C1V9 767 aa16.38■□□□□ 0.21
CCDC25-202ENST00000517979 POTEEQ6S8J3 1075 aa16.38■□□□□ 0.21
CCDC25-202ENST00000517979 SOCS4Q8WXH5 440 aa16.38■□□□□ 0.21
CCDC25-202ENST00000517979 LPAR1Q92633 364 aa16.38■□□□□ 0.21
CCDC25-202ENST00000517979 EVI5LQ96CN4 794 aa16.38■□□□□ 0.21
CCDC25-202ENST00000517979 UNC93B1Q9H1C4 597 aa16.38■□□□□ 0.21
CCDC25-202ENST00000517979 PORCNQ9H237 461 aa16.38■□□□□ 0.21
CCDC25-202ENST00000517979 GJD2Q9UKL4 321 aa16.38■□□□□ 0.21
CCDC25-202ENST00000517979 TMX2Q9Y320 296 aa16.38■□□□□ 0.21
CCDC25-202ENST00000517979 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
CCDC25-202ENST00000517979 CNMDO75829 334 aa16.37■□□□□ 0.21
CCDC25-202ENST00000517979 CCNA1P78396 465 aa16.37■□□□□ 0.21
CCDC25-202ENST00000517979 WDR78Q5VTH9 848 aa16.37■□□□□ 0.21
CCDC25-202ENST00000517979 SIAH1Q8IUQ4 282 aa16.37■□□□□ 0.21
CCDC25-202ENST00000517979 SMC5Q8IY18 1101 aa16.37■□□□□ 0.21
CCDC25-202ENST00000517979 IFNL3Q8IZI9 196 aa16.37■□□□□ 0.21
CCDC25-202ENST00000517979 SPICE1Q8N0Z3 855 aa16.37■□□□□ 0.21
CCDC25-202ENST00000517979 NKX2-3Q8TAU0 364 aa16.37■□□□□ 0.21
CCDC25-202ENST00000517979 NUDT12Q9BQG2 462 aa16.37■□□□□ 0.21
CCDC25-202ENST00000517979 VCPKMTQ9H867 229 aa16.37■□□□□ 0.21
CCDC25-202ENST00000517979 KANSL2Q9H9L4 492 aa16.37■□□□□ 0.21
CCDC25-202ENST00000517979 RAD21O60216 631 aa16.36■□□□□ 0.21
CCDC25-202ENST00000517979 IGHDP01880 384 aa16.36■□□□□ 0.21
CCDC25-202ENST00000517979 HMGCRP04035 888 aa16.36■□□□□ 0.21
CCDC25-202ENST00000517979 GJB1P08034 283 aa16.36■□□□□ 0.21
CCDC25-202ENST00000517979 EEF2P13639 858 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
CCDC25-202ENST00000517979 CYP2B6P20813 491 aa16.36■□□□□ 0.21
CCDC25-202ENST00000517979 RASA1P20936 1047 aa16.36■□□□□ 0.21
CCDC25-202ENST00000517979 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa16.36■□□□□ 0.21
CCDC25-202ENST00000517979 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
CCDC25-202ENST00000517979 LBX2Q6XYB7 198 aa16.36■□□□□ 0.21
CCDC25-202ENST00000517979 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa16.36■□□□□ 0.21
CCDC25-202ENST00000517979 GPR142Q7Z601 462 aa16.36■□□□□ 0.21
CCDC25-202ENST00000517979 PLEKHH3Q7Z736 793 aa16.36■□□□□ 0.21
CCDC25-202ENST00000517979 SHISA4Q96DD7 197 aa16.36■□□□□ 0.21
CCDC25-202ENST00000517979 NAPBQ9H115 298 aa16.36■□□□□ 0.21
CCDC25-202ENST00000517979 ZNF287Q9HBT7 754 aa16.36■□□□□ 0.21
CCDC25-202ENST00000517979 PLXNB2O15031 1838 aa16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.2 ms