RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513134.5

TMA16-208, Transcript of translation machinery associated 16 homolog, human

TSL 3 BASIC

Gene TMA16, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMA16-208	ENST00000513134	KDM4A	O75164	1064 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMA16-208	ENST00000513134	REC8	O95072	547 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMA16-208	ENST00000513134	VCAM1	P19320	739 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMA16-208	ENST00000513134	KLRC3	Q07444	240 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMA16-208	ENST00000513134	C17orf99	Q6UX52	265 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMA16-208	ENST00000513134	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMA16-208	ENST00000513134	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMA16-208	ENST00000513134	DGKH	Q86XP1	1220 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMA16-208	ENST00000513134	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMA16-208	ENST00000513134	USP26	Q9BXU7	913 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMA16-208	ENST00000513134	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMA16-208	ENST00000513134		B4E1Z4	1266 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMA16-208	ENST00000513134	USP17L15	C9J2P7	530 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMA16-208	ENST00000513134	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMA16-208	ENST00000513134	USP17L11	C9JVI0	530 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMA16-208	ENST00000513134	USP17L18	D6R9N7	530 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMA16-208	ENST00000513134	USP17L22	D6RA61	530 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMA16-208	ENST00000513134	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMA16-208	ENST00000513134	USP17L19	D6RCP7	530 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMA16-208	ENST00000513134	USP17L20	D6RJB6	530 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMA16-208	ENST00000513134	GPR25	O00155	361 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMA16-208	ENST00000513134	CYP2C8	P10632	490 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMA16-208	ENST00000513134	HSPA4	P34932	840 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMA16-208	ENST00000513134	USP17L24	Q0WX57	530 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMA16-208	ENST00000513134	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	13.59	□□□□□ -0.23
TMA16-208	ENST00000513134	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TMA16-208	ENST00000513134	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TMA16-208	ENST00000513134	LBX2	Q6XYB7	198 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMA16-208	ENST00000513134	RASEF	Q8IZ41	740 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMA16-208	ENST00000513134	FEZ1	Q99689	392 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMA16-208	ENST00000513134	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TMA16-208	ENST00000513134	DOCK1	Q14185	1865 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMA16-208	ENST00000513134	NDUFB10	O96000	172 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	BCR	P11274	1271 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	RNF20	Q5VTR2	975 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	NCOA7	Q8NI08	942 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	GOPC	Q9HD26	462 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	TOMM22	Q9NS69	142 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	TSKS	Q9UJT2	592 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	LAMB1	P07942	1786 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	OSBP	P22059	807 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	LBX1	P52954	281 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	ATP2B2	Q01814	1243 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	TRDN	Q13061	729 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	SEC23A	Q15436	765 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	GMCL1	Q96IK5	515 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	MTA3	Q9BTC8	594 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	PNMA3	Q9UL41	463 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	STX8	Q9UNK0	236 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	AK9	Q5TCS8	1911 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	ANTXR2	P58335	489 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	COG2	Q14746	738 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	C8orf34	Q49A92	452 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	IQCA1	Q86XH1	822 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	IL17RA	Q96F46	866 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	PLA2G6	O60733	806 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	SEC24B	O95487	1268 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	SNHG28	P0DPA3	235 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	HERVK_113	P62684	666 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	SLFN13	Q68D06	897 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	CPA4	Q9UI42	421 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	MYPN	Q86TC9	1320 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	FKTN	O75072	461 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	DSG3	P32926	999 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	CAP1	Q01518	475 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	SP3	Q02447	781 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	KRT32	Q14532	448 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMA16-208	ENST00000513134	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		13.54	□□□□□ -0.24

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