RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513069.1

SH3BP2-225, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 866 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-225ENST00000513069 TBC1D10CQ8IV04 446 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP2-225ENST00000513069 CEP95Q96GE4 821 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP2-225ENST00000513069 IL17RBQ9NRM6 502 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP2-225ENST00000513069 PTPN22Q9Y2R2 807 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP2-225ENST00000513069 PLIN4Q96Q06 1357 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP2-225ENST00000513069 SGSM2O43147 1006 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP2-225ENST00000513069 ATP2B2Q01814 1243 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP2-225ENST00000513069 FAM110CQ1W6H9 321 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP2-225ENST00000513069 BMP2KLQ5H9B9 411 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP2-225ENST00000513069 ERICH6BQ5W0A0 696 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP2-225ENST00000513069 SPICE1Q8N0Z3 855 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP2-225ENST00000513069 LPAR1Q92633 364 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP2-225ENST00000513069 MKL1Q969V6 931 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP2-225ENST00000513069 MORF4L1Q9UBU8 362 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP2-225ENST00000513069 CLIP2Q9UDT6 1046 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP2-225ENST00000513069 HPS5Q9UPZ3 1129 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP2-225ENST00000513069 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP2-225ENST00000513069 RAD50Q92878 1312 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP2-225ENST00000513069 NMT2O60551 498 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP2-225ENST00000513069 CNMDO75829 334 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP2-225ENST00000513069 TSPY3P0CV98 308 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP2-225ENST00000513069 TSPY8P0CW00 308 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP2-225ENST00000513069 NOVP48745 357 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP2-225ENST00000513069 PTH1RQ03431 593 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP2-225ENST00000513069 Q3C1V9 767 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP2-225ENST00000513069 SH2D4AQ9H788 454 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP2-225ENST00000513069 PPP4R2Q9NY27 417 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP2-225ENST00000513069 MYH8P13535 1937 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP2-225ENST00000513069 KIF22Q14807 665 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP2-225ENST00000513069 AKNAD1Q5T1N1 836 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP2-225ENST00000513069 LBX2Q6XYB7 198 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP2-225ENST00000513069 STAG1Q8WVM7 1258 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP2-225ENST00000513069 RUFY2Q8WXA3 655 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP2-225ENST00000513069 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 F5H6K3 240 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 ZNF213O14771 459 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 GNRH1P01148 92 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 KLRC3Q07444 240 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 ARHGEF6Q15052 776 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 TSPY2A6NKD2 308 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 WDR46O15213 610 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 TTLL1O95922 423 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 NDUFB10O96000 172 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 FCGRTP55899 365 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 COG2Q14746 738 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 GOPCQ9HD26 462 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 BTBD7Q9P203 1132 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 SRRDQ9UH36 339 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 GABRQQ9UN88 632 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 NEDD4P46934 1319 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 CENPFP49454 3210 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 PCP11498 1178 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 DSG3P32926 999 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 ERVK-9P63128 1117 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 ERVK-24P63145 666 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 MFSD6Q6ZSS7 791 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 TANGO6Q9C0B7 1094 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 FBXO28Q9NVF7 368 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 HOXC10Q9NYD6 342 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 CTNNA3Q9UI47 895 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 RLFQ13129 1914 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 CAPN15O75808 1086 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 PRKCZQ05513 592 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 FAM83BQ5T0W9 1011 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 MAP4K1Q92918 833 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 PAGR1Q9BTK6 254 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 PORCNQ9H237 461 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 TOMM22Q9NS69 142 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 GJD2Q9UKL4 321 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 TAF6LQ9Y6J9 622 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 CCDC85CA6NKD9 419 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 FLOT1O75955 427 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 PRMT2P55345 433 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 RCSD1Q6JBY9 416 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 ATG4CQ96DT6 458 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 RAD21O60216 631 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 CYP21A2P08686 494 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 HOXD10P28358 340 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 FLT3LGP49771 235 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 ARMC5Q96C12 935 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 STX8Q9UNK0 236 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP2-225ENST00000513069 MYPNQ86TC9 1320 aa17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms