RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511459.1

APBB3-217, Transcript of amyloid beta precursor protein binding family B member 3, human

TSL 4

Gene APBB3, Length 547 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APBB3-217	ENST00000511459	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		13.75	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	MAP3K14	Q99558	947 aa		13.75	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	DTNB	O60941	627 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	CTDNEP1	O95476	244 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	ECE1	P42892	770 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	GRM4	Q14833	912 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	PPP2R5B	Q15173	497 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	MAP3K11	Q16584	847 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	MOB2	Q70IA6	237 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	ACER1	Q8TDN7	264 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	TMX2	Q9Y320	296 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	USP17L5	A8MUK1	530 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	PTPRA	P18433	802 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	VGLL4	Q14135	290 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	NTRK3	Q16288	839 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	PICK1	Q9NRD5	415 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	MTMR7	Q9Y216	660 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	MYH4	Q9Y623	1939 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	DOCK1	Q14185	1865 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459		F5H6K3	240 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	KIF3C	O14782	793 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	CPLX1	O14810	134 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	JAK2	O60674	1132 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	SNHG28	P0DPA3	235 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	PDHB	P11177	359 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	KLRC3	Q07444	240 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	SLFN13	Q68D06	897 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	WDR18	Q9BV38	432 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	KIF3A	Q9Y496	699 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		13.71	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	NDUFB10	O96000	172 aa		13.71	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	IFNAR1	P17181	557 aa		13.71	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	KIF5B	P33176	963 aa		13.71	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	FUT2	Q10981	343 aa		13.71	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		13.71	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		13.71	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		13.71	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		13.71	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		13.71	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	SH2D4A	Q9H788	454 aa		13.71	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	CSAD	Q9Y600	493 aa		13.71	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		13.71	□□□□□ -0.21
APBB3-217	ENST00000511459	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		13.7	□□□□□ -0.22
APBB3-217	ENST00000511459	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		13.7	□□□□□ -0.22
APBB3-217	ENST00000511459	PPFIA3	O75145	1194 aa		13.7	□□□□□ -0.22
APBB3-217	ENST00000511459	CDKL5	O76039	1030 aa		13.7	□□□□□ -0.22
APBB3-217	ENST00000511459	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		13.7	□□□□□ -0.22
APBB3-217	ENST00000511459	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
APBB3-217	ENST00000511459	GJB2	P29033	226 aa		13.7	□□□□□ -0.22
APBB3-217	ENST00000511459	DDIT3	P35638	169 aa		13.7	□□□□□ -0.22
APBB3-217	ENST00000511459	GNAQ	P50148	359 aa		13.7	□□□□□ -0.22
APBB3-217	ENST00000511459	FKBP1B	P68106	108 aa		13.7	□□□□□ -0.22
APBB3-217	ENST00000511459	ZNF543	Q08ER8	600 aa		13.7	□□□□□ -0.22
APBB3-217	ENST00000511459	SPP2	Q13103	211 aa		13.7	□□□□□ -0.22
APBB3-217	ENST00000511459	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		13.7	□□□□□ -0.22
APBB3-217	ENST00000511459	NBPF11	Q86T75	865 aa		13.7	□□□□□ -0.22
APBB3-217	ENST00000511459	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		13.7	□□□□□ -0.22
APBB3-217	ENST00000511459	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
APBB3-217	ENST00000511459	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		13.7	□□□□□ -0.22
APBB3-217	ENST00000511459	DCAF4	Q8WV16	495 aa		13.7	□□□□□ -0.22
APBB3-217	ENST00000511459	DDX11	Q96FC9	970 aa		13.7	□□□□□ -0.22
APBB3-217	ENST00000511459	GMCL1	Q96IK5	515 aa		13.7	□□□□□ -0.22
APBB3-217	ENST00000511459	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		13.7	□□□□□ -0.22
APBB3-217	ENST00000511459	GBP4	Q96PP9	640 aa		13.7	□□□□□ -0.22
APBB3-217	ENST00000511459	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		13.7	□□□□□ -0.22
APBB3-217	ENST00000511459	VCPKMT	Q9H867	229 aa		13.7	□□□□□ -0.22
APBB3-217	ENST00000511459	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		13.7	□□□□□ -0.22
APBB3-217	ENST00000511459	GOPC	Q9HD26	462 aa		13.7	□□□□□ -0.22
APBB3-217	ENST00000511459	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
APBB3-217	ENST00000511459	OTOF	Q9HC10	1997 aa		13.69	□□□□□ -0.22
APBB3-217	ENST00000511459	KLRF2	D3W0D1	207 aa		13.69	□□□□□ -0.22

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