RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511398.1

LNX1-207, Transcript of ligand of numb-protein X 1, humanhuman

TSL 4

Gene LNX1, Length 622 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX1-207ENST00000511398 SSC5DA1L4H1 1573 aa9.32□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 RCCD1A6NED2 376 aa9.31□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 A6NJR5 290 aa9.31□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 FAM196BA6NMK8 535 aa9.31□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 GSG1L2A8MUP6 293 aa9.31□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 USP17L12C9JPN9 530 aa9.31□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 USP17L21D6R901 530 aa9.31□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 USP2O75604 605 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 CHMLP26374 656 aa9.31□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 PDE4BQ07343 736 aa9.31□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa9.31□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 IFNL3Q8IZI9 196 aa9.31□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP9.31□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 EHD4Q9H223 541 aa9.31□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 ELP3Q9H9T3 547 aa9.31□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 MKNK2Q9HBH9 465 aa9.31□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 CABP5Q9NP86 173 aa9.31□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 LIMD1Q9UGP4 676 aa9.31□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 CTNNA3Q9UI47 895 aa9.31□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 SIPA1L1O43166 1804 aa9.31□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 LAMA4Q16363 1823 aa9.31□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 UNCXA6NJT0 531 aa9.3□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 VGLL4Q14135 290 aa9.3□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 MAP3K11Q16584 847 aa9.3□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa9.3□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa9.3□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 CCDC82Q8N4S0 544 aa9.3□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 AS3MTQ9HBK9 375 aa9.3□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 ANO2Q9NQ90 1003 aa9.3□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa9.29□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 POTEMA6NI47 508 aa9.29□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 ZNF213O14771 459 aa9.29□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 GDF11O95390 407 aa9.29□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 ASNSP08243 561 aa9.29□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 CYP2D6P10635 497 aa9.29□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 INPP5BP32019 993 aa9.29□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 PLCD1P51178 756 aa9.29□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 PPARAQ07869 468 aa9.29□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 SREBF2Q12772 1141 aa9.29□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 ABCB5Q2M3G0 1257 aa9.29□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 SBK1Q52WX2 424 aa9.29□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 C12orf60Q5U649 245 aa9.29□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 VPS53Q5VIR6 699 aa9.29□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 CTR9Q6PD62 1173 aa9.29□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 POTEGQ6S5H5 508 aa9.29□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 NUDT18Q6ZVK8 323 aa9.29□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 SCYL3Q8IZE3 742 aa9.29□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP9.29□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 SPIRE2Q8WWL2 714 aa9.29□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 OPTNQ96CV9 577 aa9.29□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 DSCC1Q9BVC3 393 aa9.29□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 DDX11L8A8MPP1 907 aa9.28□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 SGSM2O43147 1006 aa9.28□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 REC8O95072 547 aa9.28□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 CAP2P40123 477 aa9.28□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 RFC5P40937 340 aa9.28□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 HAND2P61296 217 aa9.28□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 TRDNQ13061 729 aa9.28□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 RAB3GAP1Q15042 981 aa9.28□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 ERO1BQ86YB8 467 aa9.28□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 DYNLL2Q96FJ2 89 aa9.28□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 CLMNQ96JQ2 1002 aa9.28□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 HS3ST6Q96QI5 342 aa9.28□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 FEZ1Q99689 392 aa9.28□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa9.28□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 HTTP42858 3142 aa9.28□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 ZMYM6O95789 1325 aa9.28□□□□□ -0.92
LNX1-207ENST00000511398 TSPY2A6NKD2 308 aa9.27□□□□□ -0.93
LNX1-207ENST00000511398 USP17L5A8MUK1 530 aa9.27□□□□□ -0.93
LNX1-207ENST00000511398 SMAPO00193 183 aa9.27□□□□□ -0.93
LNX1-207ENST00000511398 FGAP02671 866 aa9.27□□□□□ -0.93
LNX1-207ENST00000511398 TSPY3P0CV98 308 aa9.27□□□□□ -0.93
LNX1-207ENST00000511398 TSPY8P0CW00 308 aa9.27□□□□□ -0.93
LNX1-207ENST00000511398 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
LNX1-207ENST00000511398 MCCP23508 829 aa9.27□□□□□ -0.93
LNX1-207ENST00000511398 CDK8P49336 464 aa9.27□□□□□ -0.93
LNX1-207ENST00000511398 ATP2B2Q01814 1243 aa9.27□□□□□ -0.93
LNX1-207ENST00000511398 CTDSPL2Q05D32 466 aa9.27□□□□□ -0.93
LNX1-207ENST00000511398 ALX1Q15699 326 aa9.27□□□□□ -0.93
LNX1-207ENST00000511398 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
LNX1-207ENST00000511398 LDLRAD1Q5T700 205 aa9.27□□□□□ -0.93
LNX1-207ENST00000511398 RNF20Q5VTR2 975 aa9.27□□□□□ -0.93
LNX1-207ENST00000511398 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa9.27□□□□□ -0.93
LNX1-207ENST00000511398 MFSD6Q6ZSS7 791 aa9.27□□□□□ -0.93
LNX1-207ENST00000511398 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
LNX1-207ENST00000511398 C16orf86Q6ZW13 317 aa9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms