RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504982.1

PAPD4-208, Transcript of Poly(A) RNA polymerase GLD2, human

TSL 2

Gene PAPD4, Length 600 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAPD4-208	ENST00000504982	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PAPD4-208	ENST00000504982	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PAPD4-208	ENST00000504982	USP17L7	P0C7H9	530 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PAPD4-208	ENST00000504982	PI3	P19957	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PAPD4-208	ENST00000504982	CHRNE	Q04844	493 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PAPD4-208	ENST00000504982	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PAPD4-208	ENST00000504982	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PAPD4-208	ENST00000504982	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PAPD4-208	ENST00000504982	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PAPD4-208	ENST00000504982	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PAPD4-208	ENST00000504982	SGPP1	Q9BX95	441 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PAPD4-208	ENST00000504982	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PAPD4-208	ENST00000504982	PGR	P06401	933 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PAPD4-208	ENST00000504982	SEPT6	Q14141	434 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PAPD4-208	ENST00000504982	SLC6A19	Q695T7	634 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PAPD4-208	ENST00000504982	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PAPD4-208	ENST00000504982	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PAPD4-208	ENST00000504982	SETDB2	Q96T68	719 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PAPD4-208	ENST00000504982	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PAPD4-208	ENST00000504982	C12orf49	Q9H741	205 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PAPD4-208	ENST00000504982	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PAPD4-208	ENST00000504982	GFRA2	O00451	464 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PAPD4-208	ENST00000504982	SASH1	O94885	1247 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PAPD4-208	ENST00000504982	LMNB1	P20700	586 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PAPD4-208	ENST00000504982	MAPK8	P45983	427 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PAPD4-208	ENST00000504982	DUSP4	Q13115	394 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PAPD4-208	ENST00000504982	SNX17	Q15036	470 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PAPD4-208	ENST00000504982	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PAPD4-208	ENST00000504982	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PAPD4-208	ENST00000504982	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PAPD4-208	ENST00000504982	BORCS6	Q96GS4	357 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PAPD4-208	ENST00000504982	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PAPD4-208	ENST00000504982	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PAPD4-208	ENST00000504982	SPG7	Q9UQ90	795 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PAPD4-208	ENST00000504982	IRAK3	Q9Y616	596 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PAPD4-208	ENST00000504982	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	CELA3B	P08861	270 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	NFKB2	Q00653	900 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	PDE4B	Q07343	736 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	SHISA4	Q96DD7	197 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	OR14I1	A6ND48	311 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	HRK	O00198	91 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	ATP2B2	Q01814	1243 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	TEK	Q02763	1124 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	ADGRF1	Q5T601	910 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	SP8	Q8IXZ3	490 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	RNF141	Q8WVD5	230 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	PSPN	O60542	156 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	ADRB1	P08588	477 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	GALK1	P51570	392 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	GGN	Q86UU5	652 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	GIPC2	Q8TF65	315 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	EPHB3	P54753	998 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	NLRX1	Q86UT6	975 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	PANK1	Q8TE04	598 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	EBF1	Q9UH73	591 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	FAM13C	Q8NE31	585 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	TEPSIN	Q96N21	525 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	NOTO	A8MTQ0	251 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	N4BP3	O15049	544 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	EFEMP2	O95967	443 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	LIG3	P49916	1009 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	ZNF428	Q96B54	188 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	ASPN	Q9BXN1	380 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PAPD4-208	ENST00000504982	SHISA3	A0PJX4	238 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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