RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495399.1

C9orf135-204, Transcript of chromosome 9 open reading frame 135, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf135, Length 502 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-204ENST00000495399 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 MAP2K5Q13163 448 aa9.32□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 ALDH1L2Q3SY69 923 aa9.32□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa9.32□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa9.32□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 CHMP3Q9Y3E7 222 aa9.32□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 MTCH2Q9Y6C9 303 aa9.32□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 ZFHX4Q86UP3 3567 aa9.32□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 CACNA1BQ00975 2339 aa9.31□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 HOXC6P09630 235 aa9.31□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 RAG1P15918 1043 aa9.31□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 MAPK4P31152 587 aa9.31□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 CYP2C19P33261 490 aa9.31□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 FAAP100Q0VG06 881 aa9.31□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 FLIIQ13045 1269 aa9.31□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 LRRC41Q15345 812 aa9.31□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 EPHA10Q5JZY3 1008 aa9.31□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 PLEKHH3Q7Z736 793 aa9.31□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 ARRDC4Q8NCT1 418 aa9.31□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa9.31□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 NPLOC4Q8TAT6 608 aa9.31□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 OXER1Q8TDS5 423 aa9.31□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 DNAAF4Q8WXU2 420 aa9.31□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 FERMT2Q96AC1 680 aa9.31□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 COG5Q9UP83 839 aa9.31□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 RFXAPO00287 272 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 BCAR3O75815 825 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 CNMDO75829 334 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 HERVK_113P62684 666 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 ERVK-9P63128 1117 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 ERVK-24P63145 666 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 DIXDC1Q155Q3 683 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 MFSD14CQ5VZR4 134 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 ANO1Q5XXA6 986 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 KRT40Q6A162 431 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 LMBR1LQ6UX01 489 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 NYAP1Q6ZVC0 841 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 MICALL1Q8N3F8 863 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 ZNF280CQ8ND82 737 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 LINS1Q8NG48 757 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 IDI2Q9BXS1 227 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 TBX21Q9UL17 535 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 PHF24Q9UPV7 400 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 SMCHD1A6NHR9 2005 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 TRIOO75962 3097 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 F6X3S4 739 aa9.29□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 ENTPD3O75355 529 aa9.29□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 KRT37O76014 449 aa9.29□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 TIMP1P01033 207 aa9.29□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 CNGA1P29973 690 aa9.29□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 RGS3P49796 1198 aa9.29□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP9.29□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 RAB30Q15771 203 aa9.29□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 MFSD5Q6N075 450 aa9.29□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa9.29□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa9.29□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 PRSS33Q8NF86 280 aa9.29□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 CNNM1Q9NRU3 951 aa9.29□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 SMC4Q9NTJ3 1288 aa9.29□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 USP40Q9NVE5 1235 aa9.29□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 MAST3O60307 1309 aa9.29□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 EPOPA6NHQ4 379 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 KBTBD13C9JR72 458 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 MYOGP15173 224 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 TAF7LQ5H9L4 462 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 ZNF365Q70YC5 407 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 FAM178BQ8IXR5 827 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 SLC44A5Q8NCS7 719 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 TOX2Q96NM4 488 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 UIMC1Q96RL1 719 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 SLC28A3Q9HAS3 691 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 TMEM39AQ9NV64 488 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 MSRAQ9UJ68 235 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 TNNQ9UQP3 1299 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 MYO15AQ9UKN7 3530 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 PTPRCP08575 1304 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf135-204ENST00000495399 ACRP10323 421 aa9.27□□□□□ -0.93
C9orf135-204ENST00000495399 JAG1P78504 1218 aa9.27□□□□□ -0.93
C9orf135-204ENST00000495399 GRB14Q14449 540 aa9.27□□□□□ -0.93
C9orf135-204ENST00000495399 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
C9orf135-204ENST00000495399 CCDC57Q2TAC2 916 aa9.27□□□□□ -0.93
C9orf135-204ENST00000495399 BEND3Q5T5X7 828 aa9.27□□□□□ -0.93
C9orf135-204ENST00000495399 GJD3Q8N144 294 aa9.27□□□□□ -0.93
C9orf135-204ENST00000495399 VGLL2Q8N8G2 317 aa9.27□□□□□ -0.93
C9orf135-204ENST00000495399 HLA-CQ95604 372 aa9.27□□□□□ -0.93
C9orf135-204ENST00000495399 ZDHHC16Q969W1 377 aa9.27□□□□□ -0.93
C9orf135-204ENST00000495399 VWCEQ96DN2 955 aa9.27□□□□□ -0.93
C9orf135-204ENST00000495399 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 156.7 ms