RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493831.1

ETV1-222, Transcript of ETS variant 1, human

TSL 2

Gene ETV1, Length 536 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ETV1-222	ENST00000493831	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	LILRA6	Q6PI73	481 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	FAM13C	Q8NE31	585 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	RNF34	Q969K3	372 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	LRRC3	Q9BY71	257 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	PCDHB14	Q9Y5E9	798 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	SCRIB	Q14160	1630 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	CBX7	O95931	251 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	CFP	P27918	469 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	ZP2	Q05996	745 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	SEZ6	Q53EL9	994 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	USP48	Q86UV5	1035 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	SPON2	Q9BUD6	331 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	KLHL3	Q9UH77	587 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	NFIB	O00712	420 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	CLC	Q05315	142 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	APOBR	Q0VD83	1088 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	ZNF428	Q96B54	188 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	4.79	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	NCAN	O14594	1321 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	PRRG2	O14669	202 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	ATE1	O95260	518 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	GLI1	P08151	1106 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	MCM4	P33991	863 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	GK5	Q6ZS86	529 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	MFSD4A	Q8N468	514 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	NKD1	Q969G9	470 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ETV1-222	ENST00000493831		B8ZZF3	427 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ETV1-222	ENST00000493831	ETV3	P41162	512 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ETV1-222	ENST00000493831	CLCN7	P51798	805 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ETV1-222	ENST00000493831	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ETV1-222	ENST00000493831	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ETV1-222	ENST00000493831	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ETV1-222	ENST00000493831	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ETV1-222	ENST00000493831	KIRREL1	Q96J84	757 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ETV1-222	ENST00000493831		Q96M66	194 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ETV1-222	ENST00000493831	KIF2C	Q99661	725 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ETV1-222	ENST00000493831	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ETV1-222	ENST00000493831	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ETV1-222	ENST00000493831	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ETV1-222	ENST00000493831	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ETV1-222	ENST00000493831	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ETV1-222	ENST00000493831	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ETV1-222	ENST00000493831		H3BS24	57 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ETV1-222	ENST00000493831	LRRN2	O75325	713 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ETV1-222	ENST00000493831	CYP7A1	P22680	504 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ETV1-222	ENST00000493831	TNK2	Q07912	1038 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ETV1-222	ENST00000493831	ARSH	Q5FYA8	562 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ETV1-222	ENST00000493831	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ETV1-222	ENST00000493831	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ETV1-222	ENST00000493831	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ETV1-222	ENST00000493831	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ETV1-222	ENST00000493831	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ETV1-222	ENST00000493831	CCDC120	Q96HB5	630 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ETV1-222	ENST00000493831	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		4.76	□□□□□ -1.65

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