RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492728.1

CHD1L-209, Transcript of chromodomain helicase DNA binding protein 1 like, humanhuman

TSL 2

Gene CHD1L, Length 662 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD1L-209ENST00000492728 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CHD1L-209ENST00000492728 FLRT1Q9NZU1 646 aa22.2■■□□□ 1.14
CHD1L-209ENST00000492728 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa22.2■■□□□ 1.14
CHD1L-209ENST00000492728 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CHD1L-209ENST00000492728 RGS2P41220 211 aa22.19■■□□□ 1.14
CHD1L-209ENST00000492728 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa22.19■■□□□ 1.14
CHD1L-209ENST00000492728 SPICE1Q8N0Z3 855 aa22.19■■□□□ 1.14
CHD1L-209ENST00000492728 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
CHD1L-209ENST00000492728 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CHD1L-209ENST00000492728 TMX2Q9Y320 296 aa22.19■■□□□ 1.14
CHD1L-209ENST00000492728 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CHD1L-209ENST00000492728 GSG1L2A8MUP6 293 aa22.18■■□□□ 1.14
CHD1L-209ENST00000492728 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CHD1L-209ENST00000492728 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
CHD1L-209ENST00000492728 MAP2K5Q13163 448 aa22.18■■□□□ 1.14
CHD1L-209ENST00000492728 CHRDL2Q6WN34 429 aa22.18■■□□□ 1.14
CHD1L-209ENST00000492728 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CHD1L-209ENST00000492728 PI4K2BQ8TCG2 481 aa22.18■■□□□ 1.14
CHD1L-209ENST00000492728 TANGO6Q9C0B7 1094 aa22.18■■□□□ 1.14
CHD1L-209ENST00000492728 PARP14Q460N5 1801 aa22.17■■□□□ 1.14
CHD1L-209ENST00000492728 SZT2Q5T011 3432 aa22.17■■□□□ 1.14
CHD1L-209ENST00000492728 M0R2C6 588 aa22.17■■□□□ 1.14
CHD1L-209ENST00000492728 PTPREP23469 700 aa22.17■■□□□ 1.14
CHD1L-209ENST00000492728 CCNA1P78396 465 aa22.17■■□□□ 1.14
CHD1L-209ENST00000492728 WDR78Q5VTH9 848 aa22.17■■□□□ 1.14
CHD1L-209ENST00000492728 APPBP2Q92624 585 aa22.17■■□□□ 1.14
CHD1L-209ENST00000492728 VCPKMTQ9H867 229 aa22.17■■□□□ 1.14
CHD1L-209ENST00000492728 ROBO3Q96MS0 1386 aa22.16■■□□□ 1.14
CHD1L-209ENST00000492728 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CHD1L-209ENST00000492728 GRB14Q14449 540 aa22.16■■□□□ 1.14
CHD1L-209ENST00000492728 COG2Q14746 738 aa22.16■■□□□ 1.14
CHD1L-209ENST00000492728 NPLOC4Q8TAT6 608 aa22.16■■□□□ 1.14
CHD1L-209ENST00000492728 GPATCH3Q96I76 525 aa22.16■■□□□ 1.14
CHD1L-209ENST00000492728 CCDC17Q96LX7 622 aa22.16■■□□□ 1.14
CHD1L-209ENST00000492728 CRBNQ96SW2 442 aa22.16■■□□□ 1.14
CHD1L-209ENST00000492728 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CHD1L-209ENST00000492728 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CHD1L-209ENST00000492728 OGDHLQ9ULD0 1010 aa22.16■■□□□ 1.14
CHD1L-209ENST00000492728 SALL3Q9BXA9 1300 aa22.15■■□□□ 1.14
CHD1L-209ENST00000492728 SLC15A5A6NIM6 579 aa22.15■■□□□ 1.14
CHD1L-209ENST00000492728 GPAA1O43292 621 aa22.15■■□□□ 1.14
CHD1L-209ENST00000492728 EEF2P13639 858 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CHD1L-209ENST00000492728 STK11IPQ8N1F8 1099 aa22.15■■□□□ 1.14
CHD1L-209ENST00000492728 ATG4CQ96DT6 458 aa22.15■■□□□ 1.14
CHD1L-209ENST00000492728 PRO3102Q9H379 93 aa22.15■■□□□ 1.14
CHD1L-209ENST00000492728 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa22.15■■□□□ 1.14
CHD1L-209ENST00000492728 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CHD1L-209ENST00000492728 ZNF236Q9UL36 1845 aa22.15■■□□□ 1.14
CHD1L-209ENST00000492728 IGHA2P01877 340 aa22.14■■□□□ 1.13
CHD1L-209ENST00000492728 CAPN2P17655 700 aa22.14■■□□□ 1.13
CHD1L-209ENST00000492728 RASA1P20936 1047 aa22.14■■□□□ 1.13
CHD1L-209ENST00000492728 DSG3P32926 999 aa22.14■■□□□ 1.13
CHD1L-209ENST00000492728 SBK1Q52WX2 424 aa22.14■■□□□ 1.13
CHD1L-209ENST00000492728 LHX8Q68G74 356 aa22.14■■□□□ 1.13
CHD1L-209ENST00000492728 AMOTL1Q8IY63 956 aa22.14■■□□□ 1.13
CHD1L-209ENST00000492728 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CHD1L-209ENST00000492728 ANKLE1Q8NAG6 615 aa22.14■■□□□ 1.13
CHD1L-209ENST00000492728 LPAR1Q92633 364 aa22.14■■□□□ 1.13
CHD1L-209ENST00000492728 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.14■■□□□ 1.13
CHD1L-209ENST00000492728 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CHD1L-209ENST00000492728 SPATC1LQ9H0A9 340 aa22.14■■□□□ 1.13
CHD1L-209ENST00000492728 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CHD1L-209ENST00000492728 PFASO15067 1338 aa22.13■■□□□ 1.13
CHD1L-209ENST00000492728 TTC41PQ6P2S7 1318 aa22.13■■□□□ 1.13
CHD1L-209ENST00000492728 FLOT1O75955 427 aa22.13■■□□□ 1.13
CHD1L-209ENST00000492728 HOXC6P09630 235 aa22.13■■□□□ 1.13
CHD1L-209ENST00000492728 NECAB2Q7Z6G3 386 aa22.13■■□□□ 1.13
CHD1L-209ENST00000492728 FBXO28Q9NVF7 368 aa22.13■■□□□ 1.13
CHD1L-209ENST00000492728 LAMA3Q16787 3333 aa22.13■■□□□ 1.13
CHD1L-209ENST00000492728 FRMPD3Q5JV73 1810 aa22.13■■□□□ 1.13
CHD1L-209ENST00000492728 WDR46O15213 610 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CHD1L-209ENST00000492728 ERCC3P19447 782 aa22.12■■□□□ 1.13
CHD1L-209ENST00000492728 ATP2B2Q01814 1243 aa22.12■■□□□ 1.13
CHD1L-209ENST00000492728 SH2D4AQ9H788 454 aa22.12■■□□□ 1.13
CHD1L-209ENST00000492728 HOXC10Q9NYD6 342 aa22.12■■□□□ 1.13
CHD1L-209ENST00000492728 PCDH10Q9P2E7 1040 aa22.12■■□□□ 1.13
CHD1L-209ENST00000492728 EVI5O60447 810 aa22.11■■□□□ 1.13
CHD1L-209ENST00000492728 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CHD1L-209ENST00000492728 GIMAP6Q6P9H5 292 aa22.11■■□□□ 1.13
CHD1L-209ENST00000492728 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CHD1L-209ENST00000492728 TRPV1Q8NER1 839 aa22.11■■□□□ 1.13
CHD1L-209ENST00000492728 KANSL2Q9H9L4 492 aa22.11■■□□□ 1.13
CHD1L-209ENST00000492728 NR2E3Q9Y5X4 410 aa22.11■■□□□ 1.13
CHD1L-209ENST00000492728 MINDY4BA8MYZ0 360 aa22.1■■□□□ 1.13
CHD1L-209ENST00000492728 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CHD1L-209ENST00000492728 ADORA2AP29274 412 aa22.1■■□□□ 1.13
CHD1L-209ENST00000492728 CYP2C19P33261 490 aa22.1■■□□□ 1.13
CHD1L-209ENST00000492728 TMEM132BQ14DG7 1078 aa22.1■■□□□ 1.13
CHD1L-209ENST00000492728 SHCBP1Q8NEM2 672 aa22.1■■□□□ 1.13
CHD1L-209ENST00000492728 NBPF3Q9H094 633 aa22.1■■□□□ 1.13
CHD1L-209ENST00000492728 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa22.1■■□□□ 1.13
CHD1L-209ENST00000492728 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CHD1L-209ENST00000492728 FOXP2O15409 715 aa22.09■■□□□ 1.13
CHD1L-209ENST00000492728 COBLO75128 1261 aa22.09■■□□□ 1.13
CHD1L-209ENST00000492728 PRDM1O75626 825 aa22.09■■□□□ 1.13
CHD1L-209ENST00000492728 COL6A1P12109 1028 aa22.09■■□□□ 1.13
CHD1L-209ENST00000492728 MX1P20591 662 aa22.09■■□□□ 1.13
CHD1L-209ENST00000492728 MB21D1Q8N884 522 aa22.09■■□□□ 1.13
CHD1L-209ENST00000492728 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CHD1L-209ENST00000492728 C11orf49Q9H6J7 331 aa22.09■■□□□ 1.13
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