RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489994.5

IFRD1-215, Transcript of interferon related developmental regulator 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IFRD1, Length 1,721 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD1-215ENST00000489994 PLEKHG6Q3KR16 790 aa6.42□□□□□ -1.38
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IFRD1-215ENST00000489994 TMC4Q7Z404 712 aa6.42□□□□□ -1.38
IFRD1-215ENST00000489994 FMNL3Q8IVF7 1028 aa6.42□□□□□ -1.38
IFRD1-215ENST00000489994 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa6.42□□□□□ -1.38
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IFRD1-215ENST00000489994 TRIM29Q14134 588 aa6.41□□□□□ -1.38
IFRD1-215ENST00000489994 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP6.41□□□□□ -1.38
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IFRD1-215ENST00000489994 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa6.4□□□□□ -1.38
IFRD1-215ENST00000489994 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa6.4□□□□□ -1.38
IFRD1-215ENST00000489994 PRC1O43663 620 aa6.4□□□□□ -1.38
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IFRD1-215ENST00000489994 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
IFRD1-215ENST00000489994 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa6.39□□□□□ -1.39
IFRD1-215ENST00000489994 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
IFRD1-215ENST00000489994 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa6.39□□□□□ -1.39
IFRD1-215ENST00000489994 FGAP02671 866 aa6.39□□□□□ -1.39
IFRD1-215ENST00000489994 COL6A1P12109 1028 aa6.39□□□□□ -1.39
IFRD1-215ENST00000489994 MSX1P28360 303 aa6.39□□□□□ -1.39
IFRD1-215ENST00000489994 ZNF76P36508 570 aa6.39□□□□□ -1.39
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