RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
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PRPF40A-210ENST00000489741 SETDB2Q96T68 719 aa8.48□□□□□ -1.05
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PRPF40A-210ENST00000489741 CDC27P30260 824 aa8.41□□□□□ -1.06
PRPF40A-210ENST00000489741 CDC25BP30305 580 aa8.41□□□□□ -1.06
PRPF40A-210ENST00000489741 TXNRD3Q86VQ6 643 aa8.41□□□□□ -1.06
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PRPF40A-210ENST00000489741 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
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PRPF40A-210ENST00000489741 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
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