RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 PTPREP23469 700 aa24.2■■□□□ 1.46
ACTB-212ENST00000484841 CDK8P49336 464 aa24.2■■□□□ 1.46
ACTB-212ENST00000484841 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP24.2■■□□□ 1.463e-14■■□□□ 11.8
ACTB-212ENST00000484841 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
ACTB-212ENST00000484841 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa24.2■■□□□ 1.46
ACTB-212ENST00000484841 POTEEQ6S8J3 1075 aa24.2■■□□□ 1.46
ACTB-212ENST00000484841 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
ACTB-212ENST00000484841 C11orf49Q9H6J7 331 aa24.2■■□□□ 1.46
ACTB-212ENST00000484841 DCTPP1Q9H773 170 aa24.2■■□□□ 1.46
ACTB-212ENST00000484841 BTBD7Q9P203 1132 aa24.2■■□□□ 1.46
ACTB-212ENST00000484841 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
ACTB-212ENST00000484841 ATP2B2Q01814 1243 aa24.19■■□□□ 1.46
ACTB-212ENST00000484841 CCL14Q16627 93 aa24.19■■□□□ 1.46
ACTB-212ENST00000484841 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
ACTB-212ENST00000484841 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
ACTB-212ENST00000484841 OGDHLQ9ULD0 1010 aa24.19■■□□□ 1.46
ACTB-212ENST00000484841 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa24.18■■□□□ 1.46
ACTB-212ENST00000484841 PLS1Q14651 629 aa24.18■■□□□ 1.46
ACTB-212ENST00000484841 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
ACTB-212ENST00000484841 C16orf86Q6ZW13 317 aa24.18■■□□□ 1.46
ACTB-212ENST00000484841 MB21D1Q8N884 522 aa24.18■■□□□ 1.46
ACTB-212ENST00000484841 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
ACTB-212ENST00000484841 TMX2Q9Y320 296 aa24.18■■□□□ 1.46
ACTB-212ENST00000484841 FLOT1O75955 427 aa24.17■■□□□ 1.46
ACTB-212ENST00000484841 DPP9Q86TI2 863 aa24.17■■□□□ 1.46
ACTB-212ENST00000484841 SPICE1Q8N0Z3 855 aa24.17■■□□□ 1.46
ACTB-212ENST00000484841 KBTBD3Q8NAB2 608 aa24.17■■□□□ 1.46
ACTB-212ENST00000484841 VCPKMTQ9H867 229 aa24.17■■□□□ 1.46
ACTB-212ENST00000484841 KANSL2Q9H9L4 492 aa24.17■■□□□ 1.46
ACTB-212ENST00000484841 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
ACTB-212ENST00000484841 STRNO43815 780 aa24.16■■□□□ 1.46
ACTB-212ENST00000484841 RAD21O60216 631 aa24.16■■□□□ 1.46
ACTB-212ENST00000484841 CHGBP05060 677 aa24.16■■□□□ 1.46
ACTB-212ENST00000484841 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
ACTB-212ENST00000484841 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
ACTB-212ENST00000484841 CTR9Q6PD62 1173 aa24.16■■□□□ 1.46
ACTB-212ENST00000484841 C7orf61Q8IZ16 206 aa24.16■■□□□ 1.46
ACTB-212ENST00000484841 GOPCQ9HD26 462 aa24.16■■□□□ 1.46
ACTB-212ENST00000484841 SLC5A4Q9NY91 659 aa24.16■■□□□ 1.46
ACTB-212ENST00000484841 WDR46O15213 610 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
ACTB-212ENST00000484841 CNGA1P29973 690 aa24.15■■□□□ 1.46
ACTB-212ENST00000484841 GRB14Q14449 540 aa24.15■■□□□ 1.46
ACTB-212ENST00000484841 CLEC10AQ8IUN9 316 aa24.15■■□□□ 1.46
ACTB-212ENST00000484841 APPBP2Q92624 585 aa24.15■■□□□ 1.46
ACTB-212ENST00000484841 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
ACTB-212ENST00000484841 SPATC1LQ9H0A9 340 aa24.15■■□□□ 1.46
ACTB-212ENST00000484841 MKNK2Q9HBH9 465 aa24.15■■□□□ 1.46
ACTB-212ENST00000484841 ALPK3Q96L96 1907 aa24.14■■□□□ 1.46
ACTB-212ENST00000484841 ERC2O15083 957 aa24.14■■□□□ 1.45
ACTB-212ENST00000484841 EEF2P13639 858 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
ACTB-212ENST00000484841 DSG3P32926 999 aa24.14■■□□□ 1.45
ACTB-212ENST00000484841 SHCBP1Q8NEM2 672 aa24.14■■□□□ 1.45
ACTB-212ENST00000484841 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
ACTB-212ENST00000484841 MINDY4BA8MYZ0 360 aa24.13■■□□□ 1.45
ACTB-212ENST00000484841 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
ACTB-212ENST00000484841 MSCO60682 206 aa24.13■■□□□ 1.45
ACTB-212ENST00000484841 APPP05067 770 aa24.13■■□□□ 1.45
ACTB-212ENST00000484841 HOXC6P09630 235 aa24.13■■□□□ 1.45
ACTB-212ENST00000484841 GNAT2P19087 354 aa24.13■■□□□ 1.45
ACTB-212ENST00000484841 GIMAP6Q6P9H5 292 aa24.13■■□□□ 1.45
ACTB-212ENST00000484841 NCAPG2Q86XI2 1143 aa24.13■■□□□ 1.45
ACTB-212ENST00000484841 MROH8Q9H579 483 aa24.13■■□□□ 1.45
ACTB-212ENST00000484841 ERCC3P19447 782 aa24.12■■□□□ 1.45
ACTB-212ENST00000484841 TDO2P48775 406 aa24.12■■□□□ 1.45
ACTB-212ENST00000484841 SBK1Q52WX2 424 aa24.12■■□□□ 1.45
ACTB-212ENST00000484841 TSHZ3Q63HK5 1081 aa24.12■■□□□ 1.45
ACTB-212ENST00000484841 STK11IPQ8N1F8 1099 aa24.12■■□□□ 1.45
ACTB-212ENST00000484841 ZNF287Q9HBT7 754 aa24.12■■□□□ 1.45
ACTB-212ENST00000484841 TTC41PQ6P2S7 1318 aa24.11■■□□□ 1.45
ACTB-212ENST00000484841 A0A0G2JMZ2 1700 aa24.11■■□□□ 1.45
ACTB-212ENST00000484841 SMIM22K7EJ46 135 aa24.11■■□□□ 1.45
ACTB-212ENST00000484841 ADORA2AP29274 412 aa24.11■■□□□ 1.45
ACTB-212ENST00000484841 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa24.11■■□□□ 1.45
ACTB-212ENST00000484841 SIAH1Q8IUQ4 282 aa24.11■■□□□ 1.45
ACTB-212ENST00000484841 NPLOC4Q8TAT6 608 aa24.11■■□□□ 1.45
ACTB-212ENST00000484841 ATG4CQ96DT6 458 aa24.11■■□□□ 1.45
ACTB-212ENST00000484841 FLRT1Q9NZU1 646 aa24.11■■□□□ 1.45
ACTB-212ENST00000484841 FRMPD3Q5JV73 1810 aa24.11■■□□□ 1.45
ACTB-212ENST00000484841 RLFQ13129 1914 aa24.11■■□□□ 1.45
ACTB-212ENST00000484841 ZNF236Q9UL36 1845 aa24.1■■□□□ 1.45
ACTB-212ENST00000484841 LHX8Q68G74 356 aa24.1■■□□□ 1.45
ACTB-212ENST00000484841 STAP2Q9UGK3 403 aa24.1■■□□□ 1.45
ACTB-212ENST00000484841 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
ACTB-212ENST00000484841 A0A1W2PPC1 479 aa24.09■■□□□ 1.45
ACTB-212ENST00000484841 GSG1L2A8MUP6 293 aa24.09■■□□□ 1.45
ACTB-212ENST00000484841 GPAA1O43292 621 aa24.09■■□□□ 1.45
ACTB-212ENST00000484841 SLC25A27O95847 323 aa24.09■■□□□ 1.45
ACTB-212ENST00000484841 CYP2C19P33261 490 aa24.09■■□□□ 1.45
ACTB-212ENST00000484841 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
ACTB-212ENST00000484841 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
ACTB-212ENST00000484841 OSBP2Q969R2 916 aa24.09■■□□□ 1.45
ACTB-212ENST00000484841 NACAP1Q9BZK3 213 aa24.09■■□□□ 1.45
ACTB-212ENST00000484841 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
ACTB-212ENST00000484841 PARP14Q460N5 1801 aa24.09■■□□□ 1.45
ACTB-212ENST00000484841 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
ACTB-212ENST00000484841 FCER1AP12319 257 aa24.08■■□□□ 1.45
ACTB-212ENST00000484841 FSD1Q9BTV5 496 aa24.08■■□□□ 1.45
ACTB-212ENST00000484841 OLFML2BQ68BL8 750 aa24.07■■□□□ 1.44
ACTB-212ENST00000484841 ABRAQ8N0Z2 381 aa24.07■■□□□ 1.44
ACTB-212ENST00000484841 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa24.07■■□□□ 1.44
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