RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482928.5

TSPAN1-208, Transcript of tetraspanin 1, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN1, Length 844 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN1-208ENST00000482928 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa14.53□□□□□ -0.08
TSPAN1-208ENST00000482928 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
TSPAN1-208ENST00000482928 GPRC5DQ9NZD1 345 aa14.53□□□□□ -0.08
TSPAN1-208ENST00000482928 ATRNL1Q5VV63 1379 aa14.52□□□□□ -0.08
TSPAN1-208ENST00000482928 SHTN1A0MZ66 631 aa14.52□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 H3BQV1 296 aa14.52□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 RXRAP19793 462 aa14.52□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 KIF5BP33176 963 aa14.52□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 DDIT3P35638 169 aa14.52□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 GABPAQ06546 454 aa14.52□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 SEC23AQ15436 765 aa14.52□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 SAMD7Q7Z3H4 446 aa14.52□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 TRIM22Q8IYM9 498 aa14.52□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 NKX2-3Q8TAU0 364 aa14.52□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 SENP2Q9HC62 589 aa14.52□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 CABP5Q9NP86 173 aa14.52□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 NMT2O60551 498 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 ST3GAL1Q11201 340 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 RAB3GAP1Q15042 981 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 WASF1Q92558 559 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 HOOK2Q96ED9 719 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 STX6O43752 255 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 JAK2O60674 1132 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 TOP1P11387 765 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 AKR1B1P15121 316 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 SHMT1P34896 483 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 ATP2B2Q01814 1243 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 FANCBQ8NB91 859 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 PNMA1Q8ND90 353 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 TMEM39BQ9GZU3 492 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 PLIN4Q96Q06 1357 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 FAM196BA6NMK8 535 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 GOLGA6L22H0YM25 854 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 TRIM29Q14134 588 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 RASA3Q14644 834 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 ABCB5Q2M3G0 1257 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 ANKS1AQ92625 1134 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 CEP95Q96GE4 821 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 IL17RBQ9NRM6 502 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 MTMR7Q9Y216 660 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 VCANP13611 3396 aa14.48□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 NID2Q14112 1375 aa14.48□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 CACNA1AO00555 2505 aa14.48□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 TTLL1O95922 423 aa14.48□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 SYT1P21579 422 aa14.48□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 ADD1P35611 737 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 GNAQP50148 359 aa14.48□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 HUNKP57058 714 aa14.48□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 TMEM179Q6ZVK1 233 aa14.48□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 TMEM47Q9BQJ4 181 aa14.48□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 SLC26A6Q9BXS9 759 aa14.48□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa14.48□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 CTDNEP1O95476 244 aa14.47□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 EPS15P42566 896 aa14.47□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 FOSBP53539 338 aa14.47□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 DCAF15Q66K64 600 aa14.47□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 C8orf76Q96K31 380 aa14.47□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 KANSL2Q9H9L4 492 aa14.47□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 MTMR4Q9NYA4 1195 aa14.47□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 CLIP2Q9UDT6 1046 aa14.47□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 STK36Q9NRP7 1315 aa14.46□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 BRCA2P51587 3418 aa14.46□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 RAD21O60216 631 aa14.46□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 TBC1D12O60347 775 aa14.46□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 DTNBO60941 627 aa14.46□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 PPFIA3O75145 1194 aa14.46□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 GDF11O95390 407 aa14.46□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 BRD1O95696 1058 aa14.46□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 EGFRP00533 1210 aa14.46□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 IFNAR1P17181 557 aa14.46□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 XBP1P17861 261 aa14.46□□□□□ -0.09
TSPAN1-208ENST00000482928 EN2P19622 333 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms