RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482874.1

SLC22A23-208, Transcript of solute carrier family 22 member 23, human

TSL 3

Gene SLC22A23, Length 622 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC22A23-208	ENST00000482874	KIF22	Q14807	665 aa		28.05	■■■□□ 2.08
SLC22A23-208	ENST00000482874	ARHGEF6	Q15052	776 aa		28.05	■■■□□ 2.08
SLC22A23-208	ENST00000482874	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		28.05	■■■□□ 2.08
SLC22A23-208	ENST00000482874	TRIM47	Q96LD4	638 aa		28.05	■■■□□ 2.08
SLC22A23-208	ENST00000482874	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	28.05	■■■□□ 2.08
SLC22A23-208	ENST00000482874	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		28.04	■■■□□ 2.08
SLC22A23-208	ENST00000482874	LBX2	Q6XYB7	198 aa		28.04	■■■□□ 2.08
SLC22A23-208	ENST00000482874	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		28.04	■■■□□ 2.08
SLC22A23-208	ENST00000482874	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		28.04	■■■□□ 2.08
SLC22A23-208	ENST00000482874	PARP14	Q460N5	1801 aa		28.04	■■■□□ 2.08
SLC22A23-208	ENST00000482874	MYH4	Q9Y623	1939 aa		28.03	■■■□□ 2.08
SLC22A23-208	ENST00000482874	PSMC4	P43686	418 aa		28.03	■■■□□ 2.08
SLC22A23-208	ENST00000482874	TFAP4	Q01664	338 aa		28.03	■■■□□ 2.08
SLC22A23-208	ENST00000482874	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	28.03	■■■□□ 2.08
SLC22A23-208	ENST00000482874	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		28.03	■■■□□ 2.08
SLC22A23-208	ENST00000482874	MKL1	Q969V6	931 aa		28.03	■■■□□ 2.08
SLC22A23-208	ENST00000482874	CEP95	Q96GE4	821 aa		28.03	■■■□□ 2.08
SLC22A23-208	ENST00000482874	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		28.03	■■■□□ 2.08
SLC22A23-208	ENST00000482874		A0A0G2JMZ2	1700 aa		28.03	■■■□□ 2.08
SLC22A23-208	ENST00000482874	CENPF	P49454	3210 aa		28.02	■■■□□ 2.08
SLC22A23-208	ENST00000482874	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	28.02	■■■□□ 2.08
SLC22A23-208	ENST00000482874	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		28.02	■■■□□ 2.08
SLC22A23-208	ENST00000482874	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		28.02	■■■□□ 2.08
SLC22A23-208	ENST00000482874	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		28.02	■■■□□ 2.08
SLC22A23-208	ENST00000482874	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		28.02	■■■□□ 2.08
SLC22A23-208	ENST00000482874	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		28.02	■■■□□ 2.08
SLC22A23-208	ENST00000482874	SGSM2	O43147	1006 aa		28.01	■■■□□ 2.07
SLC22A23-208	ENST00000482874	TSPY3	P0CV98	308 aa		28.01	■■■□□ 2.07
SLC22A23-208	ENST00000482874	TSPY8	P0CW00	308 aa		28.01	■■■□□ 2.07
SLC22A23-208	ENST00000482874	NOV	P48745	357 aa		28.01	■■■□□ 2.07
SLC22A23-208	ENST00000482874	HAND2	P61296	217 aa		28.01	■■■□□ 2.07
SLC22A23-208	ENST00000482874	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		28.01	■■■□□ 2.07
SLC22A23-208	ENST00000482874	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	28	■■■□□ 2.07
SLC22A23-208	ENST00000482874	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		28	■■■□□ 2.07
SLC22A23-208	ENST00000482874	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	27.99	■■■□□ 2.07
SLC22A23-208	ENST00000482874	TTLL1	O95922	423 aa		27.99	■■■□□ 2.07
SLC22A23-208	ENST00000482874	PRMT2	P55345	433 aa		27.99	■■■□□ 2.07
SLC22A23-208	ENST00000482874	ATP2B2	Q01814	1243 aa		27.99	■■■□□ 2.07
SLC22A23-208	ENST00000482874	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		27.99	■■■□□ 2.07
SLC22A23-208	ENST00000482874	GOPC	Q9HD26	462 aa		27.99	■■■□□ 2.07
SLC22A23-208	ENST00000482874	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		27.99	■■■□□ 2.07
SLC22A23-208	ENST00000482874	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		27.99	■■■□□ 2.07
SLC22A23-208	ENST00000482874	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		27.99	■■■□□ 2.07
SLC22A23-208	ENST00000482874	TSPY2	A6NKD2	308 aa		27.98	■■■□□ 2.07
SLC22A23-208	ENST00000482874	ZNF213	O14771	459 aa		27.98	■■■□□ 2.07
SLC22A23-208	ENST00000482874	CNMD	O75829	334 aa		27.98	■■■□□ 2.07
SLC22A23-208	ENST00000482874	FCGRT	P55899	365 aa		27.98	■■■□□ 2.07
SLC22A23-208	ENST00000482874	SRRD	Q9UH36	339 aa		27.98	■■■□□ 2.07
SLC22A23-208	ENST00000482874	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		27.98	■■■□□ 2.07
SLC22A23-208	ENST00000482874	MYPN	Q86TC9	1320 aa		27.97	■■■□□ 2.07
SLC22A23-208	ENST00000482874	PEX10	O60683	326 aa		27.97	■■■□□ 2.07
SLC22A23-208	ENST00000482874	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	27.97	■■■□□ 2.07
SLC22A23-208	ENST00000482874	COG2	Q14746	738 aa		27.97	■■■□□ 2.07
SLC22A23-208	ENST00000482874	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		27.97	■■■□□ 2.07
SLC22A23-208	ENST00000482874	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		27.97	■■■□□ 2.07
SLC22A23-208	ENST00000482874		F5H6K3	240 aa		27.96	■■■□□ 2.07
SLC22A23-208	ENST00000482874	NT5C2	P49902	561 aa		27.96	■■■□□ 2.07
SLC22A23-208	ENST00000482874	ERVK-9	P63128	1117 aa		27.96	■■■□□ 2.07
SLC22A23-208	ENST00000482874	ERVK-24	P63145	666 aa		27.96	■■■□□ 2.07
SLC22A23-208	ENST00000482874	PTH1R	Q03431	593 aa		27.96	■■■□□ 2.07
SLC22A23-208	ENST00000482874	KLRC3	Q07444	240 aa		27.96	■■■□□ 2.07
SLC22A23-208	ENST00000482874	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		27.96	■■■□□ 2.07
SLC22A23-208	ENST00000482874	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		27.96	■■■□□ 2.07
SLC22A23-208	ENST00000482874	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		27.96	■■■□□ 2.07
SLC22A23-208	ENST00000482874	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
SLC22A23-208	ENST00000482874	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		27.96	■■■□□ 2.07
SLC22A23-208	ENST00000482874	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		27.96	■■■□□ 2.07
SLC22A23-208	ENST00000482874	NEDD4	P46934	1319 aa		27.95	■■■□□ 2.07
SLC22A23-208	ENST00000482874	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	27.95	■■■□□ 2.06
SLC22A23-208	ENST00000482874	NDUFB10	O96000	172 aa		27.95	■■■□□ 2.06
SLC22A23-208	ENST00000482874		Q3C1V9	767 aa		27.95	■■■□□ 2.06
SLC22A23-208	ENST00000482874	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		27.95	■■■□□ 2.06
SLC22A23-208	ENST00000482874	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		27.95	■■■□□ 2.06
SLC22A23-208	ENST00000482874	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		27.95	■■■□□ 2.06
SLC22A23-208	ENST00000482874	NMT2	O60551	498 aa		27.94	■■■□□ 2.06
SLC22A23-208	ENST00000482874	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	27.94	■■■□□ 2.06
SLC22A23-208	ENST00000482874	HOXD10	P28358	340 aa		27.94	■■■□□ 2.06
SLC22A23-208	ENST00000482874	DSG3	P32926	999 aa		27.94	■■■□□ 2.06
SLC22A23-208	ENST00000482874	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06
SLC22A23-208	ENST00000482874	BTBD7	Q9P203	1132 aa		27.94	■■■□□ 2.06
SLC22A23-208	ENST00000482874	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		27.94	■■■□□ 2.06
SLC22A23-208	ENST00000482874	PLXNB2	O15031	1838 aa		27.94	■■■□□ 2.06
SLC22A23-208	ENST00000482874	ARMC5	Q96C12	935 aa		27.93	■■■□□ 2.06
SLC22A23-208	ENST00000482874	GABRQ	Q9UN88	632 aa		27.93	■■■□□ 2.06
SLC22A23-208	ENST00000482874	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
SLC22A23-208	ENST00000482874	PRKCZ	Q05513	592 aa		27.92	■■■□□ 2.06
SLC22A23-208	ENST00000482874	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
SLC22A23-208	ENST00000482874	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		27.92	■■■□□ 2.06
SLC22A23-208	ENST00000482874	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
SLC22A23-208	ENST00000482874	MAP4K1	Q92918	833 aa		27.92	■■■□□ 2.06
SLC22A23-208	ENST00000482874	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		27.92	■■■□□ 2.06
SLC22A23-208	ENST00000482874	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		27.92	■■■□□ 2.06
SLC22A23-208	ENST00000482874	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		27.92	■■■□□ 2.06
SLC22A23-208	ENST00000482874	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		27.91	■■■□□ 2.06
SLC22A23-208	ENST00000482874	FLOT1	O75955	427 aa		27.91	■■■□□ 2.06
SLC22A23-208	ENST00000482874	PORCN	Q9H237	461 aa		27.91	■■■□□ 2.06
SLC22A23-208	ENST00000482874	TOMM22	Q9NS69	142 aa		27.91	■■■□□ 2.06
SLC22A23-208	ENST00000482874	IRF5	Q13568	498 aa		27.9	■■■□□ 2.06
SLC22A23-208	ENST00000482874	MB21D1	Q8N884	522 aa		27.9	■■■□□ 2.06
SLC22A23-208	ENST00000482874	ESR2	Q92731	530 aa		27.9	■■■□□ 2.06

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63 ms