RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482814.5

GCOM1-208, Transcript of GRINL1A complex locus 1, humanhuman

TSL 2

Gene GCOM1, Length 1,620 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCOM1-208ENST00000482814 PPATQ06203 517 aa21.45■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 ME3Q16798 604 aa21.45■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 ERO1BQ86YB8 467 aa21.45■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 GOPCQ9HD26 462 aa21.45■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP21.44■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 USP14P54578 494 aa21.44■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP21.44■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 CST9Q5W186 159 aa21.44■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 ZNF280CQ8ND82 737 aa21.44■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 ZHX2Q9Y6X8 837 aa21.44■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 ATAD5Q96QE3 1844 aa21.44■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 C19orf81C9J6K1 198 aa21.44■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 USP17L10C9JJH3 530 aa21.44■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 CLEC10AQ8IUN9 316 aa21.44■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 FANCBQ8NB91 859 aa21.44■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa21.44■■□□□ 1.02
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GCOM1-208ENST00000482814 UBE2Q2LH0YL09 131 aa21.43■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 MOB2Q70IA6 237 aa21.43■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 MICU3Q86XE3 530 aa21.43■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
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GCOM1-208ENST00000482814 GTF3C6Q969F1 213 aa21.43■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 SLC10A4Q96EP9 437 aa21.43■■□□□ 1.02
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GCOM1-208ENST00000482814 A0A1W2PRG0 241 aa21.42■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 F5H6K3 240 aa21.42■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 SNHG28P0DPA3 235 aa21.42■■□□□ 1.02
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GCOM1-208ENST00000482814 KLRC3Q07444 240 aa21.42■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 CUL4AQ13619 759 aa21.42■■□□□ 1.02
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GCOM1-208ENST00000482814 LPAR1Q92633 364 aa21.42■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 GMCL1Q96IK5 515 aa21.42■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 VCPKMTQ9H867 229 aa21.42■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa21.42■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 ECE1P42892 770 aa21.41■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 BACE1P56817 501 aa21.41■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 RTN1Q16799 776 aa21.41■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 ASPRV1Q53RT3 343 aa21.41■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 ACER1Q8TDN7 264 aa21.41■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 ELP3Q9H9T3 547 aa21.41■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 TRPM7Q96QT4 1865 aa21.41■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 CXCL11O14625 94 aa21.4■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 PDHBP11177 359 aa21.4■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 SCRN1Q12765 414 aa21.4■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 SPP2Q13103 211 aa21.4■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 STK3Q13188 491 aa21.4■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 PPIL2Q13356 520 aa21.4■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 GRM4Q14833 912 aa21.4■■□□□ 1.02
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GCOM1-208ENST00000482814 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
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GCOM1-208ENST00000482814 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 CPLX1O14810 134 aa21.4■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 CDKL5O76039 1030 aa21.4■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 LARGE1O95461 756 aa21.4■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 USP17L2Q6R6M4 530 aa21.4■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 CLMNQ96JQ2 1002 aa21.4■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 MYL10Q9BUA6 226 aa21.4■■□□□ 1.02
GCOM1-208ENST00000482814 MYH4Q9Y623 1939 aa21.39■■□□□ 1.01
GCOM1-208ENST00000482814 SMARCA1P28370 1054 aa21.39■■□□□ 1.01
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GCOM1-208ENST00000482814 CCT2P78371 535 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
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GCOM1-208ENST00000482814 C12orf42Q96LP6 360 aa21.39■■□□□ 1.01
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GCOM1-208ENST00000482814 HHIPL1Q96JK4 782 aa21.37■■□□□ 1.01
GCOM1-208ENST00000482814 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
GCOM1-208ENST00000482814 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
GCOM1-208ENST00000482814 MAD2L2Q9UI95 211 aa21.37■■□□□ 1.01
GCOM1-208ENST00000482814 KCNH4Q9UQ05 1017 aa21.37■■□□□ 1.01
GCOM1-208ENST00000482814 TRIM75PA6NK02 468 aa21.37■■□□□ 1.01
GCOM1-208ENST00000482814 WDR46O15213 610 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
GCOM1-208ENST00000482814 BMP3P12645 472 aa21.37■■□□□ 1.01
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