RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482333.5

USP13-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 13, humanhuman

TSL 5

Gene USP13, Length 1,966 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13-202ENST00000482333 KRT2P35908 639 aa25.06■■□□□ 1.6
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USP13-202ENST00000482333 KINO60870 393 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
USP13-202ENST00000482333 TOP1P11387 765 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
USP13-202ENST00000482333 SHMT1P34896 483 aa25.05■■□□□ 1.6
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USP13-202ENST00000482333 CABP5Q9NP86 173 aa25.05■■□□□ 1.6
USP13-202ENST00000482333 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
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USP13-202ENST00000482333 SWAP70Q9UH65 585 aa25.05■■□□□ 1.6
USP13-202ENST00000482333 SIPA1L1O43166 1804 aa25.05■■□□□ 1.6
USP13-202ENST00000482333 CYTH3O43739 400 aa25.05■■□□□ 1.6
USP13-202ENST00000482333 SLURP2P0DP57 97 aa25.05■■□□□ 1.6
USP13-202ENST00000482333 CMA1P23946 247 aa25.05■■□□□ 1.6
USP13-202ENST00000482333 IDI2Q9BXS1 227 aa25.05■■□□□ 1.6
USP13-202ENST00000482333 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
USP13-202ENST00000482333 MRVI1Q9Y6F6 885 aa25.05■■□□□ 1.6
USP13-202ENST00000482333 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa25.04■■□□□ 1.6
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USP13-202ENST00000482333 MTMR4Q9NYA4 1195 aa25.04■■□□□ 1.6
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USP13-202ENST00000482333 HLA-DOAP06340 250 aa25.04■■□□□ 1.6
USP13-202ENST00000482333 TCP10Q12799 353 aa25.04■■□□□ 1.6
USP13-202ENST00000482333 CCDC125Q86Z20 511 aa25.04■■□□□ 1.6
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USP13-202ENST00000482333 EHD4Q9H223 541 aa25.03■■□□□ 1.6
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USP13-202ENST00000482333 SHC4Q6S5L8 630 aa25.02■■□□□ 1.6
USP13-202ENST00000482333 CLEC10AQ8IUN9 316 aa25.02■■□□□ 1.6
USP13-202ENST00000482333 LARGE2Q8N3Y3 721 aa25.02■■□□□ 1.6
USP13-202ENST00000482333 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP25.02■■□□□ 1.6
USP13-202ENST00000482333 CLIC6Q96NY7 704 aa25.02■■□□□ 1.6
USP13-202ENST00000482333 DNAJC18Q9H819 358 aa25.02■■□□□ 1.6
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USP13-202ENST00000482333 KLRF2D3W0D1 207 aa25.02■■□□□ 1.6
USP13-202ENST00000482333 ADAMTS3O15072 1205 aa25.02■■□□□ 1.6
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USP13-202ENST00000482333 UVSSAQ2YD98 709 aa25.02■■□□□ 1.6
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USP13-202ENST00000482333 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
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USP13-202ENST00000482333 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
USP13-202ENST00000482333 CALML3P27482 149 aa24.96■■□□□ 1.59
USP13-202ENST00000482333 POLD1P28340 1107 aa24.96■■□□□ 1.59
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