RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482278.5

TUBGCP2-208, Transcript of tubulin gamma complex associated protein 2, human

TSL 2

Gene TUBGCP2, Length 3,553 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TUBGCP2-208	ENST00000482278	IQCA1	Q86XH1	822 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SBF2	Q86WG5	1849 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SEMA3E	O15041	775 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CASP1	P29466	404 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PDE4B	Q07343	736 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	JMY	Q8N9B5	988 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NID2	Q14112	1375 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CUTA	O60888	179 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TPM3	P06753	285 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GPSM2	P81274	684 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ANKRD7	Q92527	254 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	DPF2	Q92785	391 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	13.42	□□□□□ -0.26	1e-6	■□□□□ 8.9
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CSRNP2	Q9H175	543 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	13.42	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TSPY2	A6NKD2	308 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	EPSTI1	Q96J88	318 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	UFL1	O94874	794 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZNF174	Q15697	407 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	EFCC1	Q9HA90	598 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	LY75	O60449	1722 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278		A0A087X0B3	334 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	USP17L3	A6NCW0	530 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	USP17L4	A6NCW7	530 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TMC6	Q7Z403	805 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SKIL	P12757	684 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CDC25B	P30305	580 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	USP5	P45974	858 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	XDH	P47989	1333 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CASQ1	P31415	396 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TFAP4	Q01664	338 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	DDR1	Q08345	913 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZSCAN26	Q16670	478 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	UTRN	P46939	3433 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PTPRE	P23469	700 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NPY5R	Q15761	445 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PROM2	Q8N271	834 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	STAM	Q92783	540 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	13.4	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CPVL	Q9H3G5	476 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FGR	P09769	529 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PDE6B	P35913	854 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PLCD1	P51178	756 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CEP135	Q66GS9	1140 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CCZ1B	P86790	482 aa		13.4	□□□□□ -0.27
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.27
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.27
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PPP2R5A	Q15172	486 aa		13.4	□□□□□ -0.27
TUBGCP2-208	ENST00000482278	OLFM4	Q6UX06	510 aa		13.4	□□□□□ -0.27
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.27
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FANCL	Q9NW38	375 aa		13.4	□□□□□ -0.27
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TUBGCP2-208	ENST00000482278	KRT2	P35908	639 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PSEN1	P49768	467 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ST5	P78524	1137 aa		13.39	□□□□□ -0.27

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