RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481081.1

CASQ1-203, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CASQ1, Length 869 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-203ENST00000481081 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 SIL1Q9H173 461 aa8.94□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa8.94□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 FAM86C2PA6NEL3 165 aa8.93□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 PGK1P00558 417 aa8.93□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 CSF2RAP15509 400 aa8.93□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 MRE11P49959 708 aa8.93□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 TIMM10P62072 90 aa8.93□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP8.93□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF365Q70YC5 407 aa8.93□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 WDR63Q8IWG1 891 aa8.93□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 HERVK_113Q902F9 699 aa8.93□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 MAML3Q96JK9 1138 aa8.93□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa8.93□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 MSRAQ9UJ68 235 aa8.93□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa8.93□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 LRRC37A2A6NM11 1700 aa8.92□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 ROBO3Q96MS0 1386 aa8.92□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 DCDC2CA8MYV0 355 aa8.92□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 PI4K2BG5E9Z4 385 aa8.92□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 ADAMTS4O75173 837 aa8.92□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 GH2P01242 217 aa8.92□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 ACRP10323 421 aa8.92□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 RARBP10826 455 aa8.92□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 ERCC3P19447 782 aa8.92□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 IL15P40933 162 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 CDK7P50613 346 aa8.92□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 GSTO1P78417 241 aa8.92□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa8.92□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 RNF180Q86T96 592 aa8.92□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 SHCBP1Q8NEM2 672 aa8.92□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 ACER1Q8TDN7 264 aa8.92□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa8.92□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 SLC28A3Q9HAS3 691 aa8.92□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 HMG20BQ9P0W2 317 aa8.92□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 NRBP1Q9UHY1 535 aa8.92□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 PALD1Q9ULE6 856 aa8.92□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 CACNA1AO00555 2505 aa8.92□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 CFAP54Q96N23 3096 aa8.91□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 FOCADQ5VW36 1801 aa8.91□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 FLT1P17948 1338 aa8.91□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF521Q96K83 1311 aa8.91□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 SMIM22K7EJ46 135 aa8.91□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 ANP32CO43423 234 aa8.91□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 USP14P54578 494 aa8.91□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 PPP4CP60510 307 aa8.91□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 TATDN1Q6P1N9 297 aa8.91□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 CCDC174Q6PII3 467 aa8.91□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 PI16Q6UXB8 463 aa8.91□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa8.91□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 ABRAQ8N0Z2 381 aa8.91□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 KLHDC9Q8NEP7 349 aa8.91□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa8.91□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 XAGE2Q96GT9 111 aa8.91□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 SPATC1LQ9H0A9 340 aa8.91□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 CD320Q9NPF0 282 aa8.91□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 STARD7Q9NQZ5 370 aa8.91□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 MTCH2Q9Y6C9 303 aa8.91□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 A0A0G2JMZ2 1700 aa8.91□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 A0A1B0GUL7 405 aa8.9□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 PRR33A8MZF0 331 aa8.9□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 ACLYP53396 1101 aa8.9□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 CCDC184Q52MB2 194 aa8.9□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 MICALL1Q8N3F8 863 aa8.9□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 TMEM199Q8N511 208 aa8.9□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 SPATA5Q8NB90 893 aa8.9□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 FEZ1Q99689 392 aa8.9□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 IL23AQ9NPF7 189 aa8.9□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP8.9□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 SLC5A4Q9NY91 659 aa8.9□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 COG5Q9UP83 839 aa8.9□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
CASQ1-203ENST00000481081 TRIOO75962 3097 aa8.89□□□□□ -0.99
CASQ1-203ENST00000481081 MOXD2PA6NHM9 499 aa8.89□□□□□ -0.99
CASQ1-203ENST00000481081 MYOGP15173 224 aa8.89□□□□□ -0.99
CASQ1-203ENST00000481081 GUCY1A2P33402 732 aa8.89□□□□□ -0.99
CASQ1-203ENST00000481081 RABGGTBP53611 331 aa8.89□□□□□ -0.99
CASQ1-203ENST00000481081 NHLH1Q02575 133 aa8.89□□□□□ -0.99
CASQ1-203ENST00000481081 COG2Q14746 738 aa8.89□□□□□ -0.99
CASQ1-203ENST00000481081 KCNA10Q16322 511 aa8.89□□□□□ -0.99
CASQ1-203ENST00000481081 ADGRA1Q86SQ6 560 aa8.89□□□□□ -0.99
CASQ1-203ENST00000481081 NUP133Q8WUM0 1156 aa8.89□□□□□ -0.99
CASQ1-203ENST00000481081 VWCEQ96DN2 955 aa8.89□□□□□ -0.99
CASQ1-203ENST00000481081 TINF2Q9BSI4 451 aa8.89□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms