RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476423.5

SZRD1-208, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene SZRD1, Length 567 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-208ENST00000476423 ATRNL1Q5VV63 1379 aa9.77□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa9.77□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 GRXCR2A6NFK2 248 aa9.77□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 RFXAPO00287 272 aa9.77□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 ALDH1L1O75891 902 aa9.77□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 TCF15Q12870 199 aa9.77□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 DIXDC1Q155Q3 683 aa9.77□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 METTL24Q5JXM2 366 aa9.77□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 WDR66Q8TBY9 1149 aa9.77□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa9.77□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 NRBP1Q9UHY1 535 aa9.77□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 TRPC6Q9Y210 931 aa9.77□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 MROH5Q6ZUA9 1318 aa9.77□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 MOXD2PA6NHM9 499 aa9.76□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 KIF28PB7ZC32 967 aa9.76□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 NUBP1P53384 320 aa9.76□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 RABGGTBP53611 331 aa9.76□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 BACE1P56817 501 aa9.76□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 GRB14Q14449 540 aa9.76□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 IER5LQ5T953 404 aa9.76□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 WDR63Q8IWG1 891 aa9.76□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 NPLOC4Q8TAT6 608 aa9.76□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 PBXIP1Q96AQ6 731 aa9.76□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 WDR18Q9BV38 432 aa9.76□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 GBF1Q92538 1859 aa9.76□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 IGHA2P01877 340 aa9.75□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 ATXN8OSP0DMR3 200 aa9.75□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 IL9P15248 144 aa9.75□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 FGFR2P21802 821 aa9.75□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 CAP2P40123 477 aa9.75□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 RGS3P49796 1198 aa9.75□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 FAM47AQ5JRC9 791 aa9.75□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 OTOP2Q7RTS6 562 aa9.75□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 ZFPM1Q8IX07 1006 aa9.75□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 ARNTL2Q8WYA1 636 aa9.75□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 GLT1D1Q96MS3 346 aa9.75□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 ELP1O95163 1332 aa9.75□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF318Q5VUA4 2279 aa9.74□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 PDE8BO95263 885 aa9.74□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 KCNA5P22460 613 aa9.74□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 PRDX5P30044 214 aa9.74□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 KCTD2Q14681 263 aa9.74□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa9.74□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa9.74□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 EDAQ92838 391 aa9.74□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 SIPA1L1O43166 1804 aa9.74□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 ATAD5Q96QE3 1844 aa9.74□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 MYH2Q9UKX2 1941 aa9.74□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 C19orf67A6NJJ6 358 aa9.73□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 ZBBXA8MT70 800 aa9.73□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 USP17L10C9JJH3 530 aa9.73□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 NEFLP07196 543 aa9.73□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 CA3P07451 260 aa9.73□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 ASNSP08243 561 aa9.73□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 MYOGP15173 224 aa9.73□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 ACLYP53396 1101 aa9.73□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 GRB10Q13322 594 aa9.73□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 MTMR2Q13614 643 aa9.73□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 KRT40Q6A162 431 aa9.73□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 SLF2Q8IX21 1173 aa9.73□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 FBXL6Q8N531 539 aa9.73□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa9.73□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 ANKS1AQ92625 1134 aa9.73□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 VTI1AQ96AJ9 217 aa9.73□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa9.73□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa9.73□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa9.73□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 CERS4Q9HA82 394 aa9.73□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 FAM86C1Q9NVL1 165 aa9.73□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa9.73□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 CFAP54Q96N23 3096 aa9.73□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 WDFY4Q6ZS81 3184 aa9.73□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 PEX10O60683 326 aa9.72□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 PFKMP08237 780 aa9.72□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 ADORA1P30542 326 aa9.72□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 CDK7P50613 346 aa9.72□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa9.72□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 ATG9AQ7Z3C6 839 aa9.72□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 ADHFE1Q8IWW8 467 aa9.72□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 USP44Q9H0E7 712 aa9.72□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 GINM1Q9NU53 330 aa9.72□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 USP34Q70CQ2 3546 aa9.72□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 KIF16BQ96L93 1317 aa9.72□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 CACNA1BQ00975 2339 aa9.72□□□□□ -0.85
SZRD1-208ENST00000476423 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
SZRD1-208ENST00000476423 PRR23AA6NEV1 266 aa9.71□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms