RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468693.5

HCLS1-204, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, human

TSL 3

Gene HCLS1, Length 502 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HCLS1-204	ENST00000468693	GDF11	O95390	407 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	FGB	P02675	491 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	CYP2C18	P33260	490 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	ACLY	P53396	1101 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	13.63	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	PRSS33	Q8NF86	280 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	USP17L15	C9J2P7	530 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	USP17L11	C9JVI0	530 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	USP17L18	D6R9N7	530 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	USP17L22	D6RA61	530 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	USP17L19	D6RCP7	530 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	USP17L20	D6RJB6	530 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	APAF1	O14727	1248 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	CA3	P07451	260 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	USP17L24	Q0WX57	530 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	LPIN2	Q92539	896 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	DNAJC18	Q9H819	358 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	DCX	O43602	365 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	ADAMTS4	O75173	837 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	ARHGEF15	O94989	841 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	PHKA1	P46020	1223 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	MAML3	Q96JK9	1138 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	ABCF2	Q9UG63	623 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	GFRA3	O60609	400 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	IL9	P15248	144 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	LBX2	Q6XYB7	198 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	ZNF384	Q8TF68	577 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	POTEB3	A0JP26	581 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	MYADML2	A6NDP7	307 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	CDK7	P50613	346 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	GRB10	Q13322	594 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	POTEB	Q6S5H4	581 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	SLF2	Q8IX21	1173 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	C12orf42	Q96LP6	360 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	C5orf42	Q9H799	3197 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	ZBBX	A8MT70	800 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	STRN	O43815	780 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	VCAM1	P19320	739 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	ERCC3	P19447	782 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	MECOM	Q03112	1051 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	KCNA10	Q16322	511 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	IER5L	Q5T953	404 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	SPRED2	Q7Z698	418 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	FEZ1	Q99689	392 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	SEMA3E	O15041	775 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	LPXN	O60711	386 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	ALDH1L1	O75891	902 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	KRT37	O76014	449 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	AKR1A1	P14550	325 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	PTPN5	P54829	565 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	CCL23	P55773	120 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	TAP1	Q03518	808 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	RASGRF1	Q13972	1273 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	ATP2B3	Q16720	1220 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		13.56	□□□□□ -0.24

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