RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467691.1

CASQ1-202, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CASQ1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-202ENST00000467691 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 MKL1Q969V6 931 aa10.39□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 TMEM47Q9BQJ4 181 aa10.39□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 LRRC2Q9BYS8 371 aa10.39□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 BACH2Q9BYV9 841 aa10.39□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 VCPKMTQ9H867 229 aa10.39□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 GOPCQ9HD26 462 aa10.39□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 THSD7BQ9C0I4 1608 aa10.39□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 ERICH2A1L162 156 aa10.38□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 F5H6K3 240 aa10.38□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 TOP1P11387 765 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 VCAM1P19320 739 aa10.38□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 PSMA5P28066 241 aa10.38□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 TM4SF4P48230 202 aa10.38□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 NOVP48745 357 aa10.38□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 KLRC3Q07444 240 aa10.38□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 SART3Q15020 963 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 CCDC178Q5BJE1 867 aa10.38□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 TMEM67Q5HYA8 995 aa10.38□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 GPAT2Q6NUI2 795 aa10.38□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa10.38□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 IFNL1Q8IU54 200 aa10.38□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 FAM43AQ8N2R8 423 aa10.38□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 TCEANC2Q96MN5 208 aa10.38□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 C22orf23Q9BZE7 217 aa10.38□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 KAT14Q9H8E8 782 aa10.38□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 PTPRFP10586 1907 aa10.37□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 PDHXO00330 501 aa10.37□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 NDUFB10O96000 172 aa10.37□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 ANAPC15P60006 121 aa10.37□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 FGD1P98174 961 aa10.37□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 WTAPQ15007 396 aa10.37□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 SEC23AQ15436 765 aa10.37□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 SLFN13Q68D06 897 aa10.37□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa10.37□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 RASGRP2Q7LDG7 609 aa10.37□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 ANKRD23Q86SG2 305 aa10.37□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 DGKHQ86XP1 1220 aa10.37□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa10.37□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa10.37□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 LPAR1Q92633 364 aa10.37□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 C12orf42Q96LP6 360 aa10.37□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 TTC14Q96N46 770 aa10.37□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 TANGO6Q9C0B7 1094 aa10.37□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 SENP2Q9HC62 589 aa10.37□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa10.37□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 MYH4Q9Y623 1939 aa10.37□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 LOC285556D6RIA3 1793 aa10.37□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 TRPA1O75762 1119 aa10.36□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 RPS6KB1P23443 525 aa10.36□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 FAM83BQ5T0W9 1011 aa10.36□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 NFXL1Q6ZNB6 911 aa10.36□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 RUFY3Q7L099 469 aa10.36□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 PNMA1Q8ND90 353 aa10.36□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 ANKS1AQ92625 1134 aa10.36□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 TMEM87BQ96K49 555 aa10.36□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 BEGAINQ9BUH8 593 aa10.36□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 LY9Q9HBG7 655 aa10.36□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa10.36□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa10.36□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa10.36□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 CCDC69A6NI79 296 aa10.35□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 USP17L15C9J2P7 530 aa10.35□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 USP17L13C9JLJ4 530 aa10.35□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 USP17L11C9JVI0 530 aa10.35□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 USP17L18D6R9N7 530 aa10.35□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 USP17L22D6RA61 530 aa10.35□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 USP17L17D6RBQ6 530 aa10.35□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 USP17L19D6RCP7 530 aa10.35□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 USP17L20D6RJB6 530 aa10.35□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 WDR46O15213 610 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 CYP2C8P10632 490 aa10.35□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 OSBPP22059 807 aa10.35□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 SLC1A4P43007 532 aa10.35□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 USP17L24Q0WX57 530 aa10.35□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP10.35□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 CCDC96Q2M329 555 aa10.35□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa10.35□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 Q6ZUG5 572 aa10.35□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 KCTD1Q719H9 257 aa10.35□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 GMCL1Q96IK5 515 aa10.35□□□□□ -0.75
CASQ1-202ENST00000467691 MTA3Q9BTC8 594 aa10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms