RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, human

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ANKRD28-208	ENST00000463533	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	HLA-DOA	P06340	250 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	NF2	P35240	595 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	HAND2	P61296	217 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	FSTL1	Q12841	308 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	ALX1	Q15699	326 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	C8orf34	Q49A92	452 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	SBK1	Q52WX2	424 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	C12orf60	Q5U649	245 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	PASK	Q96RG2	1323 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	PPARA	Q07869	468 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	CST9	Q5W186	159 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	MAP4K1	Q92918	833 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	THAP11	Q96EK4	314 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	10.01	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	INCENP	Q9NQS7	918 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	OTOF	Q9HC10	1997 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		10	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	S1PR4	O95977	384 aa		10	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	DCAF15	Q66K64	600 aa		10	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		10	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	HOOK2	Q96ED9	719 aa		10	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		10	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	DNAJC18	Q9H819	358 aa		10	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		10	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		10	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	RNF223	E7ERA6	249 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	ZNF213	O14771	459 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	PRDM1	O75626	825 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	REC8	O95072	547 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	INPP5B	P32019	993 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	SHMT1	P34896	483 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	CDK8	P49336	464 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	MAP3K10	Q02779	954 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	GABPA	Q06546	454 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	EHD4	Q9H223	541 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	ZMYM6	O95789	1325 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	DOCK1	Q14185	1865 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	SLC27A2	O14975	620 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	HOXA2	O43364	376 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	GDF11	O95390	407 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	CYP21A2	P08686	494 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	NECTIN1	Q15223	517 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533		Q3C1V9	767 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	BRICD5	Q6PL45	260 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	KLRG1	Q96E93	195 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	WRNIP1	Q96S55	665 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	USP26	Q9BXU7	913 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	AKR1B1	P15121	316 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	JAG1	P78504	1218 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	PDE4D	Q08499	809 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	MAP3K11	Q16584	847 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
ANKRD28-208	ENST00000463533	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		9.97	□□□□□ -0.81

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