RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460120.5

HPS3-202, Transcript of HPS3, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HPS3, Length 2,745 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3-202ENST00000460120 NYXQ9GZU5 481 aa20.65■□□□□ 0.9
HPS3-202ENST00000460120 KAT14Q9H8E8 782 aa20.65■□□□□ 0.9
HPS3-202ENST00000460120 DDAH1O94760 285 aa20.64■□□□□ 0.9
HPS3-202ENST00000460120 URI1O94763 535 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.9
HPS3-202ENST00000460120 MTF1Q14872 753 aa20.64■□□□□ 0.9
HPS3-202ENST00000460120 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.9
HPS3-202ENST00000460120 GOLGA8HP0CJ92 632 aa20.64■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 KMT5BQ4FZB7 885 aa20.64■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa20.64■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 MKNK2Q9HBH9 465 aa20.64■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 STX8Q9UNK0 236 aa20.64■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 CTNND2Q9UQB3 1225 aa20.64■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa20.63■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 FANCGO15287 622 aa20.63■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 SLFN14P0C7P3 912 aa20.63■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 ZNF18P17022 549 aa20.63■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 KARSQ15046 597 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 NT5DC1Q5TFE4 455 aa20.63■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 KANK3Q6NY19 840 aa20.63■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa20.63■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa20.63■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 MYH13Q9UKX3 1938 aa20.63■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 SLC10A5Q5PT55 438 aa20.63■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 ERO1AQ96HE7 468 aa20.63■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 ANKRD2Q9GZV1 360 aa20.63■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 DPYDQ12882 1025 aa20.62■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 PPP2R5BQ15173 497 aa20.62■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 IL17AQ16552 155 aa20.62■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 RCSD1Q6JBY9 416 aa20.62■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa20.62■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 RASSF8Q8NHQ8 419 aa20.62■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 TNFRSF25Q93038 417 aa20.62■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 IL17RBQ9NRM6 502 aa20.62■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa20.62■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa20.62■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 FAM205AQ6ZU69 1335 aa20.62■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 RPS6KA4O75676 772 aa20.62■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 LDHBP07195 334 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 TMEM139Q8IV31 216 aa20.62■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 TC2NQ8N9U0 490 aa20.62■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 ETF1P62495 437 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 REXO1L1PQ8IX06 675 aa20.62■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 PNMA1Q8ND90 353 aa20.62■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 PP2D1A8MPX8 630 aa20.61■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 ORC4O43929 436 aa20.61■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 CUL4BQ13620 913 aa20.61■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa20.61■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 FGRP09769 529 aa20.61■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 TM4SF1P30408 202 aa20.61■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 RFC4P35249 363 aa20.61■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 RRAGBQ5VZM2 374 aa20.61■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa20.61■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 KCND1Q9NSA2 647 aa20.61■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 NRAPQ86VF7 1730 aa20.6■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 MYH6P13533 1939 aa20.6■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 SEMA3EO15041 775 aa20.6■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 TYW1BQ6NUM6 668 aa20.6■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 FERMT2Q96AC1 680 aa20.6■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 CCDC34Q96HJ3 373 aa20.6■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 XDHP47989 1333 aa20.6■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 A0A0U1RQJ8 604 aa20.6■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 SOWAHDA6NJG2 315 aa20.6■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 TSPY3P0CV98 308 aa20.6■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 TSPY8P0CW00 308 aa20.6■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 GNG11P61952 73 aa20.6■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 ATRIPQ8WXE1 791 aa20.6■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 EPC1Q9H2F5 836 aa20.6■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 TRIM65Q6PJ69 517 aa20.59■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 TRIML1Q8N9V2 468 aa20.59■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 SYCP1Q15431 976 aa20.59■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 WDR24Q96S15 920 aa20.59■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 ARHGAP6O43182 974 aa20.58■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 RBL2Q08999 1139 aa20.58■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 IGSF22Q8N9C0 903 aa20.58■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 SPATA20Q8TB22 786 aa20.58■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 LZTFL1Q9NQ48 299 aa20.58■□□□□ 0.89
HPS3-202ENST00000460120 LAMB2P55268 1798 aa20.58■□□□□ 0.88
HPS3-202ENST00000460120 NR1I3Q14994 352 aa20.58■□□□□ 0.88
HPS3-202ENST00000460120 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
HPS3-202ENST00000460120 BLIDQ8IZY5 108 aa20.58■□□□□ 0.88
HPS3-202ENST00000460120 EEF2KMTQ96G04 330 aa20.58■□□□□ 0.88
HPS3-202ENST00000460120 MTRQ99707 1265 aa20.58■□□□□ 0.88
HPS3-202ENST00000460120 CARD6Q9BX69 1037 aa20.58■□□□□ 0.88
HPS3-202ENST00000460120 VAT1LQ9HCJ6 419 aa20.58■□□□□ 0.88
HPS3-202ENST00000460120 EP400Q96L91 3159 aa20.57■□□□□ 0.88
HPS3-202ENST00000460120 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa20.57■□□□□ 0.88
HPS3-202ENST00000460120 KIF5BP33176 963 aa20.57■□□□□ 0.88
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