RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435136.6

SH3BP2-202, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,318 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-202ENST00000435136 SNED1Q8TER0 1413 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2-202ENST00000435136 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-202ENST00000435136 RASA1P20936 1047 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-202ENST00000435136 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-202ENST00000435136 SARM1Q6SZW1 724 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-202ENST00000435136 PNMA1Q8ND90 353 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-202ENST00000435136 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-202ENST00000435136 SCG2P13521 617 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-202ENST00000435136 GTF2IP78347 998 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-202ENST00000435136 DYNLL2Q96FJ2 89 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-202ENST00000435136 VPS54Q9P1Q0 977 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-202ENST00000435136 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-202ENST00000435136 PLIN4Q96Q06 1357 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-202ENST00000435136 NEDD1Q8NHV4 660 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-202ENST00000435136 C7orf43Q8WVR3 580 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-202ENST00000435136 SLX4Q8IY92 1834 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-202ENST00000435136 NOVP48745 357 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-202ENST00000435136 PLCD1P51178 756 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-202ENST00000435136 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-202ENST00000435136 NR5A1Q13285 461 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-202ENST00000435136 TNFRSF25Q93038 417 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-202ENST00000435136 SHISA4Q96DD7 197 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-202ENST00000435136 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-202ENST00000435136 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-202ENST00000435136 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa21.39■■□□□ 1.02
SH3BP2-202ENST00000435136 AP5Z1O43299 807 aa21.39■■□□□ 1.02
SH3BP2-202ENST00000435136 TRAPPC10P48553 1259 aa21.39■■□□□ 1.02
SH3BP2-202ENST00000435136 CDK8P49336 464 aa21.39■■□□□ 1.02
SH3BP2-202ENST00000435136 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
SH3BP2-202ENST00000435136 FAM13BQ9NYF5 915 aa21.39■■□□□ 1.02
SH3BP2-202ENST00000435136 MYO3BQ8WXR4 1341 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 CALML3P27482 149 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 OXER1Q8TDS5 423 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 TRIM75PA6NK02 468 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 CDC25BP30305 580 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 PRELPP51888 382 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 RASSF7Q02833 373 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 HHIPL2Q6UWX4 724 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 PLA2G4DQ86XP0 818 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 TUBE1Q9UJT0 475 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 SMARCA1P28370 1054 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 NLRP12P59046 1061 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 NPY5RQ15761 445 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 PODNQ7Z5L7 613 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 MRIQ9BWK5 157 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 CABP5Q9NP86 173 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 TAOK2Q9UL54 1235 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 GALNT17Q6IS24 598 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 KCNH3Q9ULD8 1083 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 NFKBIEO00221 500 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 RIMBP2O15034 1052 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 FERMT2Q96AC1 680 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 MAD2L2Q9UI95 211 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF75DP51815 510 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 PLCB2Q00722 1185 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 KRBA2Q6ZNG9 492 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 TMEM47Q9BQJ4 181 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 USP17L3A6NCW0 530 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 USP17L4A6NCW7 530 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 BECN2A8MW95 431 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 USP17L1Q7RTZ2 530 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 CLIC6Q96NY7 704 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 SWAP70Q9UH65 585 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 TOP1P11387 765 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 KANK3Q6NY19 840 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 CERS5Q8N5B7 392 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 DAGLBQ8NCG7 672 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 SLC44A5Q8NCS7 719 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 CCDC148Q8NFR7 591 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 SPZ1Q9BXG8 430 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 NLRP5P59047 1200 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 GABPAQ06546 454 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 MYH8P13535 1937 aa21.33■■□□□ 1
SH3BP2-202ENST00000435136 G3V3G9 751 aa21.33■■□□□ 1
SH3BP2-202ENST00000435136 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.33■■□□□ 1
SH3BP2-202ENST00000435136 DCAF8Q5TAQ9 597 aa21.33■■□□□ 1
SH3BP2-202ENST00000435136 C9orf131Q5VYM1 1079 aa21.33■■□□□ 1
SH3BP2-202ENST00000435136 TEKT1Q969V4 418 aa21.33■■□□□ 1
SH3BP2-202ENST00000435136 CCDC34Q96HJ3 373 aa21.33■■□□□ 1
SH3BP2-202ENST00000435136 TRIM5Q9C035 493 aa21.33■■□□□ 1
SH3BP2-202ENST00000435136 CNNM3Q8NE01 707 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP2-202ENST00000435136 TTC38Q5R3I4 469 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP2-202ENST00000435136 PCDHA4Q9UN74 947 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP2-202ENST00000435136 STX8Q9UNK0 236 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP2-202ENST00000435136 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa21.31■■□□□ 1
SH3BP2-202ENST00000435136 SMTNL1A8MU46 457 aa21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms